滅菌是指利用強烈的物理和化學因素，使任何物體內外的所有微生物永遠失去生長和繁殖的能力。滅菌常用的方法有化學試劑滅菌、射線滅菌、幹熱滅菌、濕熱滅菌和過濾滅菌等。可根據不同的需要，采用不同的方法，如培養基滅菌壹般采用濕熱滅菌，空氣則采用過濾滅菌。
滅菌的徹底性受滅菌時間和滅菌劑強度的制約。微生物對滅菌劑的抵抗力取決於存在的原始種群密度、菌株或環境賦予菌株的抵抗力。滅菌是獲得純凈培養物的關鍵，也是食品工業和醫藥行業的必要技術。
基本要求
重復使用的診斷和治療儀器、器械和物品應在使用後清洗幹凈，然後再進行消毒或滅菌。
被朊病毒、氣性壞疽和突發原因不明的傳染病病原體汙染的診斷、治療器械、器具和物品，應當執行WS/T 367第十壹章的規定。
耐熱、耐濕手術器械應優先采用壓力蒸汽滅菌，不宜采取化學消毒劑浸泡滅菌。
環境和物體表面，壹般先清潔，後消毒；被患者血液、體液等汙染物汙染時，先清除汙染物，再清潔消毒。
醫療機構消毒使用的消毒產品，應當經衛生行政部門批準或者符合相應的標準和技術規範，並按照批準的使用範圍、方法和註意事項使用。
方法的選擇
根據物品汙染引起感染的高危程度選擇合適的消毒或滅菌方法：
1）高危物品應采用滅菌處理；
2）中危物品應采用達到中級以上消毒效果的消毒方法；
3）低危物品，宜采用低級消毒方法，或做清洗處理；在發生病原微生物汙染時，針對被汙染的病原微生物種類選擇有效的消毒方法