1.登錄官網，填寫《食品經營許可證換證申請書》，上傳相關材料；
2.等待食品藥品監督管理部門對提交的材料進行審核，審核通過後予以受理；
3.相關部門在規定時間內完成資料審核和現場核查；
4、經批準後，到指定地點領取新的食品經營許可證。
食品流通許可申請條件:
1.申請人應當具有法人或者其他組織的資格；
2.有固定的經營場所和與食品經營相適應的必要設施設備；
3、有健全的食品安全管理制度和食品安全管理人員；
4、符合食品安全國家標準的食品采購檢驗記錄和銷售記錄；
5.有符合法律法規的經營行為，未發生重大食品安全事故。
綜上所述，食品流通許可證網上換證需要登錄官網提交換證申請和材料，經食品藥品監督管理部門審核受理後，完成材料和現場核查，最終通過審批後獲得新的許可證。
法律依據:
中華人民共和國行政許可法
第三十九條
行政機關作出準予行政許可的決定，需要頒發行政許可證件的，應當向申請人頒發由行政機關蓋章的下列行政許可證件: (壹)許可證、執照或者其他許可證件；(二)資質證書、資格證書或者其他合格證書；(三)行政機關的批準文件或者證明文件；(四)法律、法規規定的其他行政許可文件。行政機關實施檢驗、檢測、檢疫的，可以對檢驗、檢測、檢疫合格的設備、設施、產品、物品加貼標簽或者加蓋檢驗、檢測、檢疫印章。
中華人民共和國食品安全法
第三十三條
食品生產經營應當符合食品安全標準，並符合下列要求:
(壹)具有與生產經營的食品品種和數量相適應的食品原料加工、食品加工、包裝和儲存場所，保持場所環境整潔，與有毒有害場所和其他汙染源保持規定的距離；
(二)有與生產經營的食品品種、數量相適應的生產經營設備或者設施，有相應的消毒、更衣、洗滌、采光、照明、通風、防腐、防塵、防蠅、防鼠、防蟲、洗滌、廢水處理和垃圾、廢棄物存放的設備或者設施；
(三)有專職或者兼職的食品安全專業技術人員、食品安全管理人員和保障食品安全的規章制度；
(四)具有合理的設備布局和工藝流程，防止待加工食品與直接進口食品、原料和成品交叉汙染，避免食品接觸有毒、不潔物質；
(五)餐具、飲具和盛放直接食用食品的容器使用前應當洗凈、消毒，炊具、用具使用後應當洗凈、保持清潔；
(六)儲存、運輸、裝卸食品的容器、工具和設備應當安全無害，保持清潔，防止食品汙染，並符合保障食品安全所需的溫度、濕度等特殊要求，食品不得與有毒有害物質混裝儲存、運輸；
(七)直接進口的食品應當使用無毒、清潔的包裝材料、餐具、飲具和容器；
(八)食品生產經營人員應當保持個人衛生，食品生產經營人員應當洗手，穿戴清潔的工作服、帽等。；銷售直接進口的無包裝食品時，應當使用無毒、清潔的容器、銷售工具和設備；
(九)用水應當符合國家規定的生活飲用水衛生標準；
(十)使用的洗滌劑、消毒劑應當對人體安全無害；
(十壹)法律法規規定的其他要求。
從事食品儲存、運輸和裝卸的非食品生產經營者應當遵守前款第六項的規定。