身體狀況的突然惡化與當時的政治局勢有關。光緒二十四年，也就是1898春夏，光緒皇帝發動了戊戌變法，帶來了康有為、梁啟超等維新派。“戊戌變法”觸動了以慈禧太後為首的保守派的既得利益，形成了朝廷中“皇黨”與“後黨”的對立。9月6日，慈禧太後發動政變，囚禁光緒皇帝，逮捕並殺害“戊戌六君子”，重新聽政。政治上的失敗讓光緒皇帝進入了壹生中最壓抑痛苦的時期，從小種下的病根開始發作。
光緒皇帝被囚禁在瀛臺。不僅失去了自由，還受到慈禧太後多方面的羞辱和折磨。壹度甚至想廢了他。光緒皇帝終日擔驚受怕，束手無策。他曾感嘆:“我不如漢獻帝！”在這種長期的情況下，我終於精神崩潰了，舊病復發，越來越重，再也沒有恢復。
光緒死亡檔案揭開早逝之謎
可見慈禧太後的精神折磨其實是光緒皇帝的主因。即便如此，也不能說慈禧太後就是直接謀殺光緒皇帝的兇手，光緒皇帝不是因為被謀殺而猝死的。因為從光緒二十五年左右，光緒皇帝的病情突然加重，越來越重，壹直沒有好轉。光緒三十四年春後，得了絕癥，奄奄壹息。如果他不必被別人謀殺，他會死的。有光緒皇帝生前的《脈案》和他寫的《病原體》等大量醫案。
比如從禦醫曹寫的醫案來看，光緒三十四年三月九日，光緒皇帝病重，肝腎陰虛，脾陽虛，氣血虧損。治療中，感冒藥和溫燥藥都不能用，醫生無所適從。光緒三十四年五月，醫家陳炳俊甚至在《脈象案》中寫道“調理久無效”，表明醫家對光緒的放縱無能為力。到了那年九月，光緒皇帝的病情更加復雜多變，臟腑功能全部失調，去世只是時間問題。
光緒皇帝自己也為自己日益加重的病情非常焦慮。在他寫的“病原體”中，他多次指責醫生無能。光緒三十四年五月二十六日，他斥責神醫“老是吃藥不治標”，因病“性急”。七月初八，他告訴自己:“病情遷延，吃什麽藥總是無效，壹病未平，又壹病又起。”7月17日，他指責內科醫生“吃藥不僅是徒勞的，而且還在增加。就是因為藥和病不相符，所以是個錯誤！”到了八月初七，他甚至訓斥內科醫生:“每次看脈搏，怎麽能詳細檢查病情呢？”這只是壹個敷衍了事的名醫，何必如此草率！“等壹下。這些斥責反映了他當時的焦慮和絕望。
當時江蘇名醫杜也在他的《德宗請脈》壹書中詳細記錄了光緒皇帝的病情。光緒三十四年七月，杜被招進京為光緒皇帝治病。7月16日，他第壹次去診所後，立即對大臣陸潤庠說:“我來這裏是想治好皇帝的病，贏得名聲。今天看來多半是徒勞，只能求無過而無功德。”可以看出，早在這個時候，杜就認為光緒的病已經沒有希望了。
光緒皇帝臨終時的狀況更能說明他的死因。從“脈案”來看，光緒三十四年十月十七日左右，光緒皇帝的病情進入了危急階段。16日出現肺部炎癥和心肺衰竭的臨床癥狀，病情極其危重。第二天，來了三個醫生，包括杜·。他們壹致認為，光緒皇帝是上實下虛，隨時有生命危險。據杜事後描述，光緒皇帝氣得口臭，哭著問他:“妳怎麽救我？”杜問:“皇上的凳子怎麽樣？”光緒皇帝說:“九天不明白，氣短心虛。”杜確診後，回到軍部開了藥方。病歷中曾有“虛實相生，恐有驟失”之說。大臣們說:“妳這樣寫病歷，不怕皇上害怕嗎？”阿杜:“這種疾病在四天內會很危險。如果我現在不寫，將來壹旦變得不平凡，我就不能對它負責，所以我必須寫。”
至10月19日，光緒出現胸悶、氣短、咳嗽不止、大便不通、呼吸停滯、濁氣減少、乏力等癥狀。(病歷:“中氣不足受損，上下不能收，以致上滿氣喘咳嗽，下不利排便。清氣不升，濁氣不降，全身昏昏欲睡！”)在這壹點上，醫生們壹致覺得“很難”。到了20日，光緒的眼皮微微睜開，流口水的嘴微微顫抖。(病歷:“眼瞼略白有露水，口流涎，唇動。”這就是現代所謂的中樞神經系統癥狀，說明有危險。那壹夜，光緒開始進入垂死狀態，四肢冰涼，雙眼上翻，牙關緊咬，不省人事。(病歷:“脈象如絲。”四肢冰冷，空氣滯留。我的眼睛向上看，我的知識丟失了。牙齒合上了，情況就要脫了。”)二十壹日中午，光緒的脈搏似乎沒有了，眼睛直視，嘴巴張開。(病歷:脈象“若無，直視，唇反鼻，陽散陰燥。“到了半夜，光緒皇帝進入彌留狀態，壹直持續到那壹刻，最後《玉龍做客》而死。