1、工作原理不同：正壓通氣治療機通過不斷提供正壓氣體來維持患者的通氣，從而改善呼吸功能，而呼吸機則可提供多種模式，包括正壓通氣，但也可以提供其他模式如輔助呼吸、控制呼吸等。
2、適應病情不同：正壓通氣治療機應用於非急性病患者，例如慢性阻塞性肺疾病、睡眠呼吸暫停綜合征等，而呼吸機則常用於急性疾病，如重癥監護、急性呼吸衰竭等。