1.中醫
北京中醫藥專業主要培養學生掌握中醫藥基礎理論和臨床實踐技能，具備中醫藥診療和制劑能力，能夠運用中醫藥理論和技術預防、診斷和治療疾病。
本專業的學科設置涵蓋中醫基礎理論、中醫診斷學、中醫內科學、中醫外科學、中醫婦科、中醫兒科、中醫皮膚科、中醫骨傷科等。學生畢業後可在醫院、中醫診所、中醫養生機構等單位從事中醫臨床工作，也可從事中醫藥教育和科研工作。
2.藥房
北京中醫藥大學藥學專業旨在培養具有中醫藥知識和藥學基礎理論、知識和技能的高級應用型專門人才。學生將學習中西藥基礎理論和知識，掌握藥劑學、藥物分析、藥理學、藥物化學、中西藥藥事管理等專業知識和技能。
本專業主要課程有中藥學、藥物化學、藥學、生藥學、藥物分析、藥理學、藥事管理學等。學生還將實習和參加藥學實驗、臨床實習等活動，提高實際操作能力和解決實際問題的能力。
藥學專業學生畢業後可在醫藥企業、醫療機構、藥品監管機構、科研機構等領域從事藥物研發、生產、質量控制、臨床藥師和藥品監管等工作。同時，妳也可以繼續深造，攻讀碩士和博士學位，或者從事相關的學術研究。
3.中西醫臨床醫學
北京中醫藥大學中西醫結合臨床醫學專業是壹個綜合性醫學專業，培養具有基本醫學知識和技能，能應用中西醫結合方法進行臨床診斷、治療和預防的醫學人才。
學生將學習與中醫、西醫、中西醫結合相關的知識和技能，包括基礎醫學、臨床醫學、中醫、中藥、針灸推拿等。
本專業的培養目標是培養具有中醫基礎理論知識、西醫臨床醫學知識和技能、中西醫結合臨床診斷、治療和預防的臨床醫學人才。