《神農本草經》共分三卷，收載藥物365種，按三等分類法分為上、中、下三等，文字簡明扼要，成為中藥理論的精華。
2015年8月，《全圖神農本草經》英、法文譯本由外文出版社出版。該書的譯者和註釋者安德烈夫婦是漢學專家，曾翻譯出版多部中國傳統文化書籍。著名花鳥畫家劉景增先生在本書中創作了許多前人未曾觸及的物種形象，使傳統花鳥畫的物種大大增加，對新物種繪畫的實踐具有重要的參考價值。書中畫作不拘影貌，壹舉突破了明清以來藥物標本畫的束縛。畫中融入了大量與物種相關的詩詞、史料等中國古代文化信息。讀者可以細細品味那些耐人尋味的精彩畫面。
《神農本草經》在中醫藥發展中的歷史作用
《神農本草經》的歷史地位不可低估，它系統地總結了東漢以前零散的藥物學知識，包含了許多具有科學價值的內容，為歷代醫家所珍視。此外，它作為藥學著作的編纂體例由來已久，作為中國第壹部藥學專著，其影響極為深遠。它是我國第壹部提出 "君臣佐使 "理論的著作，這壹理論壹直為後世藥學所沿用，並自成壹卷《序例》（或稱《序》），作為全書的總論，概括了藥學的十三種理論。
《本經》的問世，對中國藥物學的發展產生了很大影響。歷史上有代表性的幾部《本草綱目》，如《本草經集註》、《新修本草》、《證類本草》、《本草綱目》等，都源於《本草綱目》而得到發展。藥物之間的相互關系也是藥物學的壹大關鍵，《本經》中提出的 "七情和合 "原則在幾千年的醫藥實踐中發揮了巨大的作用。
藥物之間，有的***配合使用可以相得益彰，發揮更大的功效，有的甚至比各自單獨使用的效果強數倍；有的兩藥相遇壹方會降低另壹方的藥性，難以發揮作用；有的藥物能降低另壹種藥物的毒性，常在炮制毒性藥物或在方劑中限制某種藥物的毒性時使用；有兩種藥物 有的藥物能降低另壹種藥物的毒性，常在炮制毒性藥物或在方劑中限制某種藥物的毒性時使用。這些都是從業人員或從事藥理研究的人員必須具備的基本專業知識，非常重要，甚至操縱著生死關，不能忽視壹分半毫。
在相當長的歷史時期內，《本草綱目》是醫生、藥師學習中藥的教科書，或作為必讀書，被擺在十分重要的位置。書中對藥物性質的定位和功能的描述非常準確，書中規定的大部分藥理和配伍規則，直到今天仍是中醫藥的重要理論支柱。對於現代中醫診所來說，《本經》的論述仍然具有很強的權威性，同時，它也成為了醫者案頭必備的工具書之壹。
處方用藥劑型
《本經-序錄》："諸藥之性，宜丸、宜散、宜煮、宜酒浸、宜膏、宜煎，又有壹物為主，又有壹物不得入湯、酒，與諸藥之性，不得相越"。這壹方面反映了2000多年前中藥劑型的成就，另壹方面也反映了藥物配伍過程中對哪些藥物應采用哪些劑型的研究經驗，如砭石 "煉如膏"，術 "作煎餌"，鹿茸 "可作浴湯"（外用洗劑）、葡萄 "可作酒"，白芷 "可作面脂"，牛角、牛膽 "可入丸"，"蘇軾 "酒煮可殺之，"魯壁方 "火煮可使之良，"當歸 "煮飲可治金創，"雷丸 "作膏按摩可除病痛，"雷丸"為膏，除小兒病"，蛇蛻 "火熬好"，貝母 "燒用好 "等等。這不僅講述了藥物的炮制加工方法，也說明了不同藥物在具體應用中的不同劑型，才能更有效地發揮其療效。當今中醫界醫生只用湯劑入藥的現象具有很大的批判價值。
客觀評價藥物療效
《神農本草經-序》認為："凡欲治其病，先望其源，先候其病，五臟不空，六府不竭，血脈不亂，神氣不散，藥必治之。若病已成，可半愈。病已過，命難全"。這首先告誡人們，有病壹定要及早治療；其次強調病的愈合與否，不能完全依賴藥物的作用，主要是機體的防禦功能和機體在藥物的幹預下驅除疾病的內在能力。
強調辨證用藥
《神農本草經-序》提出 "治寒者以熱藥，治熱者以寒藥，飲食不消者以吐下藥，鬼魅、托蠱者以毒藥，癰疽瘡瘍者以瘡瘍藥，風濕者以風濕藥，各隨其宜"。這句話既突出了辨證論治用藥的主旨，又提示了在辨證論治用藥的前提下，要辨病性（寒、熱）而用藥，辨病因而審因施治（如、"飲食不節"、"風濕"）；辨病勢輕重，根據病勢輕重用藥（如 "鬼、托、蠱 "都是危重病）；辨體病（如 "癰腫瘡瘍"、"風濕"）與內病（如 "鬼、托、蠱、毒"）。還需要認識到身體疾病（如 "癰、腫、瘡 "和 "風濕"）與內臟疾病（如 "鬼、疰、蠱"）之間的區別。前者用 "瘡"、"風濕"，後者用 "毒"。再看書中365味藥的功效和主治，我們還可以發現，書中根據內科病、婦科病、外科病、眼科病、皮膚病等不同的病種和不同的藥物加以論治，充分體現了辨證用藥的思想。
重視用藥時間與療效的關系
《神農本草經-序》雲："病在胸膈以上者，先食後藥；病在腹部以下者，先藥後食；病在四肢血脈者，宜空腹壹日；病在骨髓者，宜飽食壹宿。" 可見本書作者在認真總結前人用藥經驗的基礎上，認識到服藥時間與藥物療效的密切關系。
實踐 "藥有陰陽 "理論的價值
"藥有陰陽 "理論最早提出於《內經》，實踐於《本經》。所謂 "藥有陰陽"，含義很廣。如果單從植物藥和礦物藥的陰陽來說，礦物藥質地重而主降，屬性為陰，植物藥質地輕而屬於陽。若是植物藥，凡藥以其花、其葉、其枝多屬陽，若以其根、其莖多屬陰。如果將藥物的深層內涵加以陰陽之分，則 "陽為氣，陰為味 ......陰味出下竅，陽氣出上竅。味厚者為陰，味薄者為陰中之陽。味愈濃，陽中之陰愈薄。味濃則泄，味薄則通。氣薄則泄，氣厚則熱"。"氣味辛甘散為陽，酸苦湧泄為陰"，詳見《素問-陰陽應象大論》。
藥有酸、鹹、甘、苦、辛五味
所謂 "藥有酸、鹹、甘、苦、辛五味"，原指人所能嘗到的藥物真味及其對人體氣血陰陽的影響。藥物的真味不止五味，由於受事物五種屬性歸類理論的影響，所以從古至今，在藥物的五味中，又將澀味附於酸味，淡味附於甘味，以結合五種屬性對藥物的五味進行歸類。
藥物 "有寒、熱、溫、涼四氣"
《本經》說藥物有 "寒、熱、溫、涼四氣"。四氣即四性，是藥物或食物的寒、熱、溫、涼四種屬性，與人們所能感知到的五味相對，四氣屬陽，五味屬陰，即《素問-陰陽應象大論》中 "陽為氣，陰為味 "之意。事物的陰陽屬性可分，"陽中有陰，陰中有陽"，故藥物的寒、熱、溫、涼性質可分陰陽。溫、熱為陽，涼、寒為陰。熱多於溫，寒多於涼，這只是程度上的區別。溫熱藥有微溫、溫、熱、熱、熱的不同層次；寒涼藥有微涼、微寒、寒、寒、寒的不同層次，如果沒有寒、熱、溫、涼性質的明顯區別，所以用 "平 "標明其性質。
認為藥物 "有毒無毒，酌之"
《本經-序論》中的 "有毒無毒，酌之 "是指在臨證用藥時，要熟悉哪些 哪些藥物是有毒的，哪些藥物是無毒的。有毒的藥物，毒性的大小、程度等，再根據實際情況，酌情用藥。
認為醫學有 "七情和合"
該書-序》認為：醫學 "有單行者，有相須者，有相使者，有相畏者，有相惡者，有相逆者，有相殺者。凡此七情，並見"。這就是藥物復方 "七情和合 "理論的來源，指的就是藥物復方中的特殊關系。