然而，任何藥物都有副作用。與其他治療精神疾病的藥物相比，奧氮平的副作用應被認為相對較少，其常見的不良反應如下:
與臨床試驗中使用奧氮平相關的唯壹不良反應是嗜睡和體重增加。服用奧氮平的34%患者血漿催乳素濃度暫時略有升高(平均終點不超過正常值上限，與安慰劑無統計學差異)，相關臨床表現(如男性乳房增大)少見，大部分患者激素水平可在不停藥的情況下恢復到正常範圍。
臨床試驗中偶見不良反應(1-10%)，包括頭暈、靜坐不能、食欲增加、外周水腫、直立性低血壓、口幹、便秘。偶爾，肝臟轉氨酶ALT SGPT和AST SGOT升高暫時無癥狀。
禁忌癥奧氮平禁止用於已知對該藥物任何成分過敏的患者。
註意事項:用藥的特殊註意事項
註意:
神經阻滯劑惡性綜合征(NMS):臨床試驗中沒有奧氮平引起NMS的報告。然而，NMS是壹種潛在的致命綜合征，已有使用其他抗精神病藥物的報道。NMS的臨床表現包括高熱、肌強直、精神狀態改變和自主神經障礙(脈搏和血壓不規則、心動過速、出汗和心律失常)。其他癥狀可能包括肌酸酐磷酸激酶增加、肌紅蛋白尿、(橫紋肌溶解)和急性腎衰竭。如果患者有NMS的臨床表現或只有高熱而沒有NMS，應停止所有抗精神病藥物，包括奧氮平。
遲發性運動障礙:與氟哌啶醇6周以上相比，奧氮平引起的包容性運動障礙發生率較低，具有統計學意義。然而，長期使用抗精神病藥物會增加遲發性運動障礙的風險。如果患者出現遲發性運動障礙的癥狀或體征，應減少或停止用藥，停藥時上述癥狀可加重，甚至停藥後仍可加重。
註意事項:
肝功能指標:偶爾會出現肝轉氨酶ALT、AST無癥狀暫時升高，多見於用藥初期。應觀察ALT和/或AST升高的患者、肝損傷的體征和癥狀、與肝功能儲備有限相關的預存疾病以及使用具有潛在肝毒性的藥物。如果治療期間ALT/ AST升高，應考慮隨訪和減藥。
癲癇:與其他抗精神病藥物類似，奧氮平在有癲癇史或癲癇相關疾病的患者中慎用。
血液學指標:與其他抗精神病藥物相似，奧氮平應慎用於以下情況的患者:
任何原因引起的白細胞和/或中性粒細胞減少；
藥物性骨髓抑制/毒性反應史；
伴隨疾病、放療或化療引起的骨髓抑制
酸性細胞過多癥，或骨髓和外部骨髓的增生性疾病。
臨床實驗發現，許多由氯氮平引起的粒細胞減少癥或粒細胞缺乏癥患者，使用氯氮平後無復發。
抗膽堿能活性:臨床實驗表明抗膽堿能作用發生率較低，但患者出現並發癥時服用奧氮平的數據有限，建議前列腺增生、麻痹性腸梗阻、窄角青光眼或相關疾病患者慎用。