南京醫療保障局主要職責:
1. 制定全市基本醫療保險、生育保險、大病保險、醫療救助、醫療價格等醫療保障制度的政策、規劃和計劃，推動建立長期護理保險制度，建立健全多層次的醫療保障體系，並組織實施。開展醫療保障領域的對外合作與交流。
2. 做好醫療保障基金預決算管理工作，組織制定並實施醫療保障基金監督管理辦法。建立健全全市醫療保障基金統壹安全防控機制，組織開展打擊醫療保障基金詐騙、欺詐行為的工作，推動全市醫療保障機構開展醫療服務智能監控系統建設，審核醫療保障機構實施的醫療保障基金運行報告。改革醫療保障基金支付方式。
南京市醫保繳費標準：老年居民籌資標準為1730元/人·年，其中，財政補助標準1270元/人·年，個人繳費標準460元/人·年。其他居民籌資標準為1750元/人·年，其中，財政補助標準1190元/人·年，個人繳費標準560元/人·年。學生兒童籌資標準為1410元/人 ·年，其中，財政補助標準1160元/人·年，個人繳費標準250元/人·年。大學生籌資標準為830元/人·年，其中，財政補助標準650元/人·年，個人繳費標準180 元/人·年。老年居民、其他居民個人繳費部分含失能保險個人繳費部分。據了解，2022年度將門診高費用補償年度基金支付限額提高200元，提高到2800元/年。具有本市戶籍，除城鎮職工基本醫療保險應參保人員以外的其他所有城鄉居民，以及部分符合條件的非本市戶籍居民，可以參加城鄉居民醫保。