在分析區別之前，我們先來介紹下這兩個藥物的相同點。從藥物分類上來說，不管是西地那非還是他達拉非，都屬於臨床上用於男性ED改善治療的壹線藥物，從藥物分類上來說兩個藥物都屬於PDE5抑制劑，都是對5型磷酸二酯酶具有高度選擇性的藥物，磷酸二酯酶5型磷酸二酯酶主要分布於哺乳動物的海綿體的主要磷酸二酯酶，這類藥物通過抑制5型磷酸二酯酶的活性，從而減少細胞生理後續物質cGMP的分解，升高cGMP水平，調節增加局部血流量，從而達到改善男性功能的藥理作用。
這麽說對很多朋友可能太過復雜，簡單來說，就是這兩個藥物都是具有高度專屬性的，直接通過作用於男性相關部位受體，從而發揮作用的壹類有效治療藥物，對於有相關功能障礙問題的男性朋友，多數情況下，都有不錯的改善效果。
這類藥物除了在改善男性相關功能障礙方面的藥效之外，在肺動脈高壓的治療方面，對於男性良性前列腺增生帶來的下尿路癥狀改善方面，也都是可以應用的藥物。
除了在藥理作用方面類似以外，他達拉非和西地那非在用藥禁忌方面，也基本相同，對於服用硝酸酯類藥物的朋友（如硝酸甘油、單硝酸異山梨酯等），服用此類藥物可能會引起嚴重的低血壓風險，應當禁用此類藥物，對於本身已有相關疾病，已經不宜進行夫妻生活的患者，也不應服用此類藥物。
說完相同點，我們再來說下他達拉非和西地那非在藥物應用中的各方面不同點。
對於這兩個藥物，目前國內上市的藥物類型中，他達拉非只有普通片劑壹種類型，規格方面有5mg，10mg，20mg三種規格，而西地那非除了有25mg，50mg，100mg3種普通片規格以外，在去年還有新型的口崩片上市，劑量為每片50mg，口崩片不需要用水送服，直接放入口中即可迅速崩解，是壹種更方便服用的藥物，口腔的崩解還會促進藥物的迅速吸收，最快12分鐘就能起效，對於按需服用，不方便用水送服的朋友來說，是壹種新的用藥選擇，但對於這種劑型，目前的缺點是價格比普通片要貴了不少，更適合經濟上相對寬裕的朋友使用。
對於男性相關功能障礙的改善治療方面，PDE5抑制劑最常見的用藥方式之壹，就是在相關活動前按需用藥。不管是他達拉非還是西地那非，都是可以按需服用的藥物。如果看藥品說明書，他達拉非和西地那非的按需服用，都建議在活動前30~60分鐘服用，而實際上，如果想要達到最佳的用藥效果，建議他達拉非活動前2小時服用效果更佳，而西地那非則建議活動前壹小時服用。
飲食對於這兩種藥物的吸收起效也有不同的影響，他達拉非不受進食的影響，而高脂飲食則可能影響西地那非的吸收速度，因此，對於按需服用的朋友，如果選擇的是西地那非，如果在飲食後按需服藥，不妨將服藥時間再提前壹小時，活動前2小時服藥，能夠獲得更好的效果。
從藥物作用持續時間方面，他達拉非的藥物半衰期為17.5小時，其最長作用時間可以長達36小時，而西地那非的作用時間通常為4~5小時，相比他達拉非有較大的差異。長效藥物的優勢，主要在於能夠有效地減少很多朋友的時間壓力，還有助於將相關活動與服藥時間分開，減少服藥帶來的焦慮感，使夫妻生活更加自然。
除了按需服用以外，西地那非和他達拉非也都可以選擇規律用藥，長時間用藥的方式來用藥，這樣的用藥方式，有助於在改善ED問題的同時，改善男性的血管內皮 健康 ，對於部分輕癥患者的治療改善，有不錯的效果。如果說規律用藥選擇的話，比起西地那非，更推薦長效藥物他達拉非，他達拉非作用時間長，可以優先選擇低劑量（5mg）每日規律服用，服用5天後，就能夠達到穩態血藥濃度，規律服用的同時，要註意保持壹定頻率的夫妻生活，同時定期評估相關功能，並結合治療效果，逐漸減量停藥。
雖然同樣是高度選擇性的PDE5抑制劑，但對於其他型的磷酸二酯酶的親和力，這兩個藥物之間也存在壹定的差異。服用他達拉非和西地那非，都有可能出現頭痛、頭暈、消化不良、鼻黏膜充血等方面的不良反應，但西地那非比起他達拉非，出現視覺異常，包括色盲，光敏感，視覺模糊等問題的不良反應發生率要高得多，而他達拉非則發生肌肉痛，後背疼痛的幾率要比西地那非高，因此，對於兩種藥物的選擇來說，應該結合實際的不良反應發生情況，如果服用他達拉非出現了嚴重的肌肉痛問題，換服西地那非有助於降低不良反應風險，而對於有視覺相關不良反應的朋友，選擇他達拉非則可能更加安全。
隨著年齡的增長，男性出現ED問題的幾率會越來越高，因此對於沒有相關禁忌的老年朋友，也是可以通過合理的選擇藥物來改善相關問題。相關研究發現，西地那非在大於65歲的老年人使用後，血漿清除率會有所下降，遊離血漿濃度比青年人誌願者的血漿濃度升高40%以上，因此，在老年人使用西地那非時，應當註意適當的減量，而他達拉非在65歲以上患者使用時，血漿濃度沒有明顯變化，不需要進壹步調整劑量。