為了與國際接軌，同時，我國實行了疾病控制和衛生監督體制改革，由於職能的轉變，各級衛生防疫站於2002年相繼從衛生監督所（局）分離出來後，更名為?疾病預防控制中心（CDC）。到 2004 年，更名工作基本完成。除少數行業系統仍保留該名稱外，衛生防疫站基本不再使用。
主要職責
1、貫徹執行《中華人民***和國食品衛生法》、《中華人民***和國傳染病防治法》。中華人民***和國母嬰保健法》等法律、法規和規定，並依法進行監督，履行行政監督職能。
2、組織開展重大疾病綜合防治工作；組織指導全區健康教育活動。
3、組織協調全區公共****、衛生監督執法；負責食品、職業衛生、放射、學校、公共****、生活飲用水等衛生監督管理；組織實施食品等與健康相關的質量管理，負責預防性體檢、健康檢測等相關機構的資質考核和認證。
四、貫徹執行有關婦幼保健工作的方針、政策和法律、法規，依法實施監督管理；負責擬訂全區婦幼衛生、婦女、兒童工作的發展規劃、政策措施並組織實施；
對全區婦幼衛生各項工作實施宏觀管理和質量督導；負責婦幼保健、助產技術服務機構和人員的準入，負責督導托幼機構的衛生保健工作。
擴充
防疫站工作制度
為了認真貫徹執行《全國衛生防疫站工作規範》，搞好衛生站建設，調動職工的積極性，必須建立、健全各項規章制度，有正常的工作秩序。現主要制度如下：
壹、辦公制度
1、自覺遵守作息時間，按時上下班。
2、堅守崗位，集中精力做好本職工作。
3、工作時間，不處理私事。
4、外出公務要報告、交代。
5、急事先辦，緩事後辦，杜絕拖拉。
6、寫大事記，記錄已處理的重大事項。每月總結壹次。
二、計劃、總結工作制度
1、工作計劃要根據上級指示精神，結合本地實際情況討論制定。
2、計劃應於上年12月底前由各科室制定，交辦公室綜合整理，經中央辦公廳討論批準後執行。
3、各科室要有詳細的實施計劃。按季、按月安排，任務到人，明確完成任務的時間和質量要求。
4、工作計劃的內容不得擅自更改，有需要增減和變更的由中心主任或分管主任審批。
5、計劃執行情況，每季度由各科室進行壹次檢查，每半年由中心主任組織有關人員進行壹次檢查，年終進行全面總結。
6、年度工作計劃、總結材料於1月底前報衛生行政部門和業務領導小組單位。
三、會議制度
1、主任辦公會：每周壹次。中心主任、副主任、辦公室主任參加。傳達上級指示精神，交流各自分管工作情況，討論研究有關問題。
2、中心例會：每月召開壹次，如有特殊情況可隨時召開。由中心主任主持。主任、副主任及各科室負責人參加，主要傳達上級文件和指示精神。
2、總結、匯報、部署工作，研究解決涉及中心的重大問題，會前各科室需提交理事會討論的事項，應事先向辦公室提出建議，由辦公室統壹安排，會議決議要有文件依據，並由辦公室督促檢查落實情況。
3、全中心職工大會：每季度召開壹次，根據工作需要可臨時召開，傳達上級文件、指示，總結、布置工作，表揚好人好事。
4、科務會：每周召開壹次，傳達中心職代會精神。總結本周工作，布置下周任務。
5、民主生活會：以科室為單位，每月壹次，交換意見，開展批評與自我批評。
四、考勤制度
1、建立考勤登記簿，實行每天考勤登記，每月匯總統計。
2、考勤登記包括事假、病假、曠工、遲到、早退、加班等情況。
3、除法定假日、節假日外，因公、因病離開工作崗位的，必須辦理請假手續。
4、請假期滿後要做銷假處理，需要續假的應另辦續假手續。
5、未經請假擅自離崗或請假期滿逾期不歸者，按曠工處理。
6、節假日因工作需要不休息，臨時工作需要加班的，可給予適當補假。
七、休假審批權限按當地規定執行，產假、探親假、節假日休假按國家規定執行。
五、辦文制度
1、拆送文件：凡對外行文，除科室簽收外，均由收發人員拆送、登記，由辦公室主任提出擬辦意見報中心主任審批後，送有關科（室）辦理。
2、收文：各科（室）指定專人負責文件：資料的收、發、管理工作。接收文件、資料應簽名。
3、辦文：要認真負責，及時將重要的、有指導意義的文件、處理意見報站領導審閱，涉及多個科（室）的，要及時簽收，辦文處要督促、催辦。
4、發文字件：壹般公文，由辦公室主任簽發。信箋要使用編號和留根，以便核對。以中心名義下發的文件，擬稿後先交辦公室修改，再送中心簽發。
5、發文：起草科（室）負責校對。印校文件必須認真負責，印前應對修改後的文稿進行認真審核。對重要文件，發文前必須再次核對印章，防止出現差錯。
6、歸檔：有保存利用價值的各類文件，在辦理完畢後，最遲於次年第壹季度按規定歸檔。單個業務文件由主管科（室）保管，綜合性和涉密文件由保密辦或專職人員管理。
七、清理文件：對於無保留利用價值的文件，在辦理結束後，最遲不得超過次年第壹季度，經篩選、審核登記後，報領導審定，指定專人負責監燒。
六、請示報告制度
1、實行各級請示報告制度。對上級下達的工作任務落實情況要及時報告。
2、整體工作計劃和工作總結，由下級向上級報告。
3、外出參加會議和重要業務活動要及時報告。
4、發生重大疫情、職業中毒、食物中毒，及時向上級報告請示並提出處理意見。專題調查、科學實驗，應將結果書面報告上級。
5、發生差錯、事故和違紀違法事件，除及時向上級口頭報告外，還應輔以書面報告。
6、預算、決算和超過權限範圍的財務開支，應報上級審批。
7、有關工作人員的任用、晉升等問題，應報上級審批。
8、經營藥品、器械和生物制品的，應將器械和生物制品的配送計劃報上級審批。
9、舉辦各種專業會議、專業培訓班應做到計劃上報，統壹安排。
十、工作中遇到政治、方針、政策、法律、經濟等方面的問題，要及時向上級請示匯報。
七、財務管理制度
1、財務工作必須堅持勤儉辦站的方針，實行經濟核算，講求經濟效益，組織合理收入，正確執行各項財務政策，加強財務監督，嚴格財務紀律。
2、各項財務開支，應根據衛生防疫業務需要，編制年度和季度預算，報中心辦公會議研究批準後執行。
3、工作人員外出預支差旅費，根據實際需要，填寫申請單，經主管領導批準後，回來壹周內結清差旅費。在已用完預借款項未結清前，不準連續預借。否則，會計人員的工資不予發放。
4、所有會計事項均應取得合法原始憑證（如發票、票據、收據等），經辦人、收款人和驗收人簽字後方可報銷。不能取得正式單據或單據丟失的，經辦人應書面說明理由，由證明人簽字，財務主管及領導審核同意後方可報銷。
5、撥給外單位的物價藥品、器械收費：外單位的體檢、疾病查治、檢查的收費，應按編號、項目和規定的收費標準，由財務負責收費，開具收據，並留存存根備查。
6、工資、保健津貼、會議津貼、加班津貼、獎金等按國家或地方財務規定發放。
七、臨時困難或病故職工需要補助的，應從福利費中解決，不得占用單位的業務經費和衛生防疫專項經費。
八、物資管理制度
1、除防疫業務用的各種物資外，由總務人員根據工作需要負責采購、管理和供應。
2、建立健全臺帳。購進的物品要經過驗收入庫，財務才能辦理帳務。
3、各科（室）要指定專人負責，按計劃向總務科倉庫人員領用物資，臨時需要的辦公用品和計劃外物資，由科（室）領導簽字，總務科同意領用。
4、各科（室）外來人員臨時購買辦公用品和材料，應經批準後方可購買，並必須向管理部門做好驗收手續。
5、物資倉庫管理人員應定期清點物資和辦公用品，核對帳目，做到帳物相符，防止積壓、損壞、變質。
6、個人防護用品，按國家和地方有關規定配發。
參考資料來源；百度百科-防疫站