中國中藥飲片的現狀喜憂參半。壹方面，中藥飲片產業化發展和中藥炮制學術研究取得了顯著進步；而另壹方面，過去積澱下來的大量問題未能解決，已成為扼制中藥發展的五大瓶頸。
藥材來源及采收不規範
由於中國中藥材物種豐富，同壹種中藥各地使用的品種不同，或同壹品種不同地區名稱相異。即使是屬於同壹品種的藥材，由於生長的地區、氣候的差異，同樣導致質量優劣有別。此外，采收時間或加工方法不同，也對原藥材有效成分的含量有影響。
加工工藝和質量標準不統壹
雖然國家規定，中藥飲片必須按照國家藥品標準炮制（國家藥品標準沒有規定的，則按省、自治區、直轄市藥監部門制定的規範炮制）。但由於目前各省、市、自治區自訂的地方標準缺乏約束力和權威性，沒有統壹的質量標準，導致相同藥材有多種不同的炮制方法，常造成差異甚至相互矛盾，難以實現統壹的質量控制。對飲片的內在質量而言，目前還缺少先進的、操作性強的質量檢測方法和控制技術，缺乏量化指標和國內外公認的質量評價標準。到現在為止，中國依然沒有壹套完整的中藥飲片標準化體系出臺。在實際應用中，絕大部分中藥飲片質量仍以地方標準來控制甚至不按標準操作；另壹方面，已有的標準也只是經驗總結，主觀性較強，難以統壹和讓人理解。如“麩炒蒼術炒至深黃色”，對於深黃色的標準每個人的眼光不盡相同，照此標準炮制飲片，會產生壹些理化性質的改變，導致飲片質量不統壹。
炮制機理不明確
雖然目前也有壹部分飲片的炮制機理比較明確，如烏頭、附子、馬錢子等炮制後，其毒性成分發生轉變而消失，或含量降低或異構化；黃芩通過蒸制軟化切片可避免有效成分的損失等。但還有相當壹部分飲片的炮制機理不明確，這就在很大程度上阻礙了炮制品種在臨床上的使用。例如補益藥物黃精，研究表明，黃精經過酒蒸制之後，可以更好地發揮補益作用，且刺激性下降。據文獻報道，黃精多糖是其補益作用的主要有效成分。但有研究表明，黃精經過酒蒸制後其粗多糖含量下降，很難解釋黃精多糖含量下降為何補益作用還能增強。
信息標準不統壹
主要表現在編號上。如有的中藥飲片是根據《中藥材商品目錄》來編號的，而有的則按中藥功能作用編號，有的還是由飲片加工企業自行編號，造成同壹品種在不同區域有不同的編號，容易混淆和出錯。此外，信息不完整。如前面所提及的《中藥材商品目錄》中，雖收載了編號、品名、規格和產地，卻沒有標註藥材品種來源，某些地區就以變種或同屬其他植物作正品使用，造成品種混亂。再就是分類不明確。無論是按藥用部位分類的還是按照功能主治分類的，全國都沒有統壹標準。
產業化發展滯後
飲片產業是中藥產業中的薄弱環節。縱觀全國，中藥飲片生產企業水平參差不齊，已通過GMP認證的只占少數，大部分企業規模較小、效益低下、技術開發和創新能力薄弱，生產工藝和設備落後，管理也不規範。這種狀況恐怕在短時期內亦難以改變。
有識之士為解決瓶頸問題提出了相應對策。大家比較強調的是務必註重飲片的地道性問題，即強調用於生產飲片的藥材要求有穩定的內含物質群。其次是強調中藥炮制必須以中醫中藥理論為依據，以中西醫結合理論為指導，對傳統的炮制方法進行改革與完善。同時要加強對中藥炮制機理的研究，包括減毒、增效、緩和藥性及產生新藥效原理的研究。通過對炮制機理的揭示，制定出統壹規範的最佳炮制工藝。