執業藥師註冊流程如下：
(壹)申請
申請執業藥師註冊人員需先登錄執業藥師註冊網絡服務平臺，提交個人信息和註冊信息,網上申報成功後,打印註冊申請表，再按照執業藥師首次註冊、再次註冊、變更註冊、註銷註冊需知上的要求,把所需提交的資料交到省政府政務服務中心省食品藥品監督管理局窗辦理。
(二)受理對不符合申請註冊條件或註冊材料不全者不予註冊，應當當場或者在5個工作日內書面通知申請人，說明理由並通知所要補齊的全部材料，逾期不告知的，自收到申請之日起即為受理。省食品藥品監督管理部門受理或不受理《執業藥師(首次、再次、變更、註銷)註冊》，應當出具加蓋本部門專用印章並註明日期的《受理通知書》或《不予受理通知書》。
(三)審查
由窗口人員負責進行資料審查。
辦理時限：3個工作日。
(四)作出決定
經省食品藥品監督管理局審查材料合格後，對符合條件者予以首次註冊、再次註冊、變更註冊或註銷註冊。
辦理時限：2個工作日。
五、辦理時限
(壹)法定時限：20個工作日。(二)承諾時限：5個工作日。
六、收費標準、收費依據
不收費
所需材料有：
首次申請註冊人員須提交的材料：1、《執業藥師資格證書》原件; 2、《執業藥師首次註冊申請表》壹式2份 3、身份證復印件(單位蓋鮮章);
4、近期1寸免冠正面半身照3張; 5、提交縣級以上(含縣)疾病預防控制機構出具的健康證明;
6、執業單位合法開業的證明復印件(營業執照，藥品經營、藥品生產、醫療機構許可證); 7、上述提交的復印件需加蓋單位鮮章。
申請再次註冊人員須提交的材料：1、《執業藥師再次註冊申請表》壹式2份 2、《執業藥師資格證書》原件和《執業藥師註冊證》(正、副本)原件;
3、《執業藥師繼續教育登記證書》原件; 4、提交縣級以上(含縣)疾病預防控制機構出具的健康證明; 5、近期1寸免冠正面半身照3張。
(6、辦事指南沒寫，但也需要身份證復印件，有時還查原件，建議帶上。)
變更註冊人員需提供的資料執業藥師變更執業地區的：1、《執業藥師變更註冊申請表》原件2份 2、近期1寸免冠正面半身照3張;
3、《執業藥師資格證書》原件和《執業藥師註冊證》(正、副本)原件; 4、提供與原註冊單位解除勞動關系的合同。
5、新執業單位合法開業證明復印件(營業執照，藥品經營、藥品生產、醫療機構許可證)。 6、上述提交的復印件需加蓋單位鮮章。
(7、辦事指南沒寫，但也需要健康證身份證復印件，有時還查原件，建議帶上。)
註銷註冊人員需提供的資料：1、《執業藥師註銷註冊申請表》2份 2、近期1寸免冠正面半身照2張。 3、《執業藥師註冊證》正、副本。