藥物治療包括中樞興奮藥、抗抑郁藥、抗高血壓藥和去甲腎上腺素再攝取抑制劑。從中醫的角度來說，孩子腎陰不足，虛火上升，煩躁不安，所以發育期往往會出現陰氣不足，陽氣過盛的情況，會引起孩子多動癥。所以滋陰補腎健腦是治療小兒多動癥的良方。中藥有很多，但缺乏科學的方法來驗證其療效。
1)中樞興奮劑:首選。主要用於6歲以上兒童，可減少多動和沖動，提高註意力。常用:
(1)哌甲酯，。該藥物有效率為75-80%；
②不再推薦匹莫林，因為它會增加急性肝衰竭的風險。
近十年來，越來越多的研究和報道表明長效、緩釋或控釋哌甲酯具有更持久、穩定的療效。有取代傳統速效哌甲酯的趨勢。
2)選擇性去甲腎上腺素再攝取抑制劑:托莫西汀。托莫西汀是壹種選擇性去甲腎上腺素再攝取抑制劑(SNRI)。這種藥物是第壹種被批準用於治療註意缺陷多動障礙(ADHD)的非興奮性藥物。國外用了3-4年，國內用了近2年。臨床實踐表明，該藥治療多動癥的療效與哌醋甲酯相當，無明顯副作用。目前也是主要治療藥物之壹。