1)腎精虧虛是由於先天稟賦不足、調養不當、房室過多、久病傷腎或年老腎虛所致。而腎主骨，牙在骨之外，腎精不足，牙齒根本不固，所以牙齒枯黃發黑，松動，容易齲齒。如《聖紀總錄》說:“腎主骨，齒除骨。腎強骨髓壯，牙齒就白而亮；今腎弱不傲骨髓，故牙枯黃黑。”
2)由於久病不愈，稟賦不足，房室過度消耗，過度消耗搶奪陰的溫燥之品，腎陰受損，陰虛火旺，牙齒稀疏、動搖、外露，牙齦潰爛、萎縮。《知止方》雲:“腎虛則牙開，旺盛則牙堅，虛熱則牙動”。如果感到熱邪，消耗津液，牙齒就會發黃、幹燥。
3)久病氣血不足，氣虛不能生血，或血虛化氣，氣血兩虛，精氣不能調至牙齦，牙齦失養，故牙齒蒼白；再覺得風邪就縮肉了。《生肌總錄》說:“氣血虧虛，管理不當，風邪襲虛，牙縫間客，會使肌肉冰冷，氣血虛弱，牙齒萎縮，漸露，永不附齒。”
4)邪氣侵入陽明經絡(手陽明、足陽明)，經絡血液循環受阻，故牙齒黃黑、幹癟、動搖。《病因論》中說:“風寒乘其經脈，故髓骨受損，不能濡於齒上，故齒暗黑。”“風邪寒氣囿於經脈，髓弱血不能養於骨上，故齒黃黑。”此外，吃辛辣油膩食物，化熱為火，或情誌不遂，氣滯成火，或熱邪內侵導致胃熱過盛，而循胃經，胃火循經熏發，氣血瘀滯，牙齦腫痛，甚至潰爛；熱傷血絡，牙齒就會出血。5)牙齒和跟部疾病如牙齒和牙齦疾病、齲齒和牙癰也會導致牙齒顏色和形狀異常。
此外，長期吸煙、大量飲用濃茶、慢性鉛中毒或氟中毒、服用四環素等某些藥物以及慢性疾病也可引起牙齒顏色和形態的改變。