制作蜜丸的基本步驟如下:煉蜜→混藥→制條→制丸→包裝→儲存。
1.蜂蜜的選擇和提煉是保證蜜丸質量的關鍵。煉蜜的目的是去除雜質，破壞酶，殺死微生物，蒸發水分，增強粘度。其方法是:小規模生產可用銅鍋或鍋直火加熱，文火冶煉；大規模生產可以通過蒸汽夾套罐和真空蒸發濃縮罐進行精制，最後過濾掉雜質。蜂蜜精制的程度分為嫩蜜、煉蜜、陳蜜。
嫩蜂蜜將嫩蜂蜜加熱至沸騰，顏色變深變粘，水分損失約3%。適用於含有較多脂肪、澱粉、粘液、糖和動物組織的處方。
煉蜜會持續加熱嫩蜜，產生淡紅色有光澤的泡沫，用手摸有粘性，但沒有白絲。它用於含有纖維、澱粉、糖和壹些油的配方。
老蜜加熱至棕紅色，有紅色光澤。用手很粘，能拉出白絲。適用於含有大量纖維素和礦物質的處方。
2.藥物組合:將煉好的煉蜜與藥粉按比例混合(藥粉與煉蜜的比例壹般為1: 1或1: 5，也有小於1: 1的，視藥物性質和季節而定。壹般含糖、油的中藥材用蜂蜜少。纖維素多、質地疏松的藥物，用蜂蜜多。夏天少用蜂蜜，冬天多用蜂蜜。均勻揉搓成面團狀顆粒(在攪拌機中機械混合或在其他容器中手工混合)。配藥時壹般趁熱加入蜂蜜(如含膠質、樹脂或揮發性成分，需待煉蜜稍涼後再配)，充分混勻，使其內外濕潤，色澤壹致，軟硬適中，可隨意揉搓。
3.做成條，做成丸。
將面團狀的軟材放在壹起壹定時間，使藥材和蜂蜜成分混合濕潤，產生壹定粘度後，即可搓條，搓條的粗細要壹致，外觀要光滑。即可以用手工或制丸板制成壹定量的光滑球形微丸，用機械進行批量生產。
制丸時，先將藥塊稱重，進行精確計量，即計算出每次要制丸的粒數和每粒丸的總量，根據計算出的量將藥塊稱重，然後卷成預期的粒數。滾丸的功能詞可以根據丸的大小來確定。藥丸滾好後，分成小塊，再滾成球形。
為了避免粘手和儀器，操作時可以使用適量的潤滑劑。潤滑劑可由甘油或芝麻油(花生油)和蜂蠟按壹定比例加熱熔化制成。夏天可以多加壹點蜜蠟。
4.包裝和儲存:蜜丸可以用蠟紙、玻璃紙、塑料袋和蠟殼包裹，儲存在陰涼幹燥的地方。