手汗癥本身就是交感神經系統過度活躍造成的，治療方法必須針對交感神經系統。傳統的治療方法包括口服藥物和局部治療。前者是指口服壹些阿托品類藥物，但只有短期效果，卻帶來了口渴、不適等全身副作用。後者主要指氯化鋁溶液的應用。氯化鋁溶液雖有抑制出汗的作用，但需每日塗抹，對腋下出汗有較好的效果，但對治療手掌、腳底出汗效果較差。
近年來，這些費力不討好的方法逐漸被手術治療所取代。傳統的外科治療包括交感神經切除術伴背部手術和皮下交感神經切除術。前者是在上背部做壹個10厘米左右的切口，然後切掉兩側壹根肋骨，切斷兩側第二胸交感神經——聽起來有點嚇人。的確，這種方法創傷很大，疤痕也很大，術後需要很長時間才能恢復。目前大多不使用。
後者用電極燒灼破壞胸交感神經節。雖然術後無明顯疤痕，但由於復發率高，並未被廣泛接受為主流手術。目前只有少數情有獨鐘的醫生還在用這種方法，成功率很好。
目前公認最有效的方法是胸腔鏡胸交感神經切除術。
該方法在雙側腋窩做壹個約2cm的切口，在胸腔鏡的精確引導下，利用電視監視系統，準確、快速地切斷引起手汗癥的胸交感神經。手術效果立竿見影，而且切口小，部位隱蔽，不易復發。但任何手術都有不同的風險和壹定比例的並發癥。胸腔鏡交感神經切除術可能出現的並發癥包括胸腔出血引起的血胸或肺隔膜、肺泡破裂引起的氣胸，但這些並發癥的發生率不到1%。
手術治療風險相對較大，對醫生的專業性要求較高，但也是最有效的方法。專家認為，只要選擇正規醫院和專業醫生進行手術，風險基本可以規避，不必過於擔心。不過，醫生也告誡患者不要相信所謂的偏方、偏方和針灸方法，它們並不能真正治愈手汗癥。至於在某些報紙上刊登的壹個治愈出汗和狐臭的廣告，那絕對是壹個利用人性弱點的騙局。
應該及早治療。
專家表示，目前還沒有研究顯示手汗癥會隨著年齡的增長而改善，而且手汗癥往往會持續存在，因此早期治療可以盡早擺脫困擾。
治療手汗癥的最佳時期是青春期，此時癥狀最為明顯。手汗癥的癥狀可以在手術後立即緩解，手術成功率也較高。40歲以後往往因為胸膜粘連或肺部病變等疾病而難以手術，失敗率增加。不是越早越好，身體還不成熟的孩子不適合手術治療。因為孩子的生長發育還沒有停止，升學壓力也不大，出汗的手應該不會給生活帶來困擾。