大多數學者認為木村病是壹種免疫介導的炎癥反應性疾病。也有人認為與白色念珠菌感染、工作環境鏡像和個人衛生習慣有關。
沒有令人滿意的治療方法。主要方法有(1)手術切除；單壹皮膚病變可考慮手術切除。腫塊較大，邊界不壹定清楚，可侵犯唾液腺、肌層等。，且傾向於多發，所以切除後常復發。(2)放射治療:常用深部X線和60Go電子束，後者最好。但這種病是良性的，X線照射可引起惡變，兒童病例多，過度照射有惡變的危險。(3)糖皮質激素治療:起效最快，但多數病例不完全消失，減量或停藥後可復發。(4)羥苯丁酮治療:劑量為每日300-600mg，好轉後會逐漸減少，必須維持治療。比糖皮質激素稍差，腫塊很難完全消失。減量或停藥後可迅速復發。(5)其他:金硫葡萄糖、乙酰螺旋黴素及免疫抑制劑如壹氧化氮芥、環磷酰胺等作用不確定。據報道，念珠菌是通過脫敏治療治愈的。(6)綜合治療:用糖皮質激素和羥丁氮酮減輕腫塊，再用手術切除和X線治療，或用X線治療減輕腫塊再行手術切除。