(1)兩性黴素B: ①是迄今為止最有效的抗真菌藥物。首次用於成人1 ~ 5mg/天，5%葡萄糖溶液500ml，6小時。以後根據情況，每日劑量增加2 ~ 5 mg，直至最大劑量1mg/(kg？d)、兩性黴素B總劑量為2000 ~ 3000mg；也可通過小腦延髓池、側腦室或椎管給藥，以增加局部腦或腦脊液中的藥物濃度；(2)但應註意該藥的不良反應較大，可引起高熱、寒戰、血栓性靜脈炎、頭痛、惡心、嘔吐、低血壓、低鉀血癥、氮血癥等。，並偶有心律失常、驚厥、白細胞減少或血小板減少，故應註意上述不良反應的防治；③該藥可與氟康唑或氟尿嘧啶聯合使用，以減少其用量和不良反應。
(2)氟康唑:①口服吸收好，血和腦脊液中濃度高，對隱球菌有特效，200 ~ 400 mg，1/天，5 ~ 10天可達平穩血藥濃度，療程壹般為6 ~ 12個月；②應註意惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、脹氣、皮疹等不良反應的防治。
(3)5-氟胞嘧啶:①與兩性黴素B合用可增加療效，減少耐藥性，劑量為50 ~ 150 mg，分3 ~ 4次，1療程為數周至數月；②註意惡心、厭食、白細胞和血小板減少、皮疹、肝腎功能損害等不良反應的防治。