營養器官和生殖器官的關系也是相互依存、相互制約的。營養生長是生殖生長的基礎。只有根、莖、葉等器官健康生長，才能為花、果、種子的形成和發育創造良好的條件。果實和種子的良好發育為新壹代營養器官的生長奠定了物質基礎。營養器官和生殖器官的相互制約還表現在對養分的爭奪上。如果營養器官的生長過程中消耗了過多的營養物質，營養生長過於旺盛，就會導致生殖生長延遲或生殖器官發育不良。結果，谷類作物貪吃綠葉，晚熟，棉花和果樹落花落果。但是，如果在生殖器官的生長過程中消耗了過多的營養物質，生殖生長就會過於旺盛，也會影響營養器官的生長潛力和生長，甚至導致植物的早衰和死亡。
合理調整它們之間的關系，使營養器官和生殖器官的生長和諧地、有目的地發展，在生產中具有重要意義。如果提供充足的水肥，摘花或花蕾，或進行適當的修剪，收獲營養器官的植物(如茶、桑、麻、葉菜等)可獲得高產；比如在棉花生產中，可以采取修剪、打頂、去多余芽等措施，控制營養器官的生長，保證棉鈴和桃的生長。在果樹生產中巧妙利用它們之間的關系，可以消除“大小年”現象，年年獲得高產。