與其他選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑(SSRI)壹樣，常見的不良反應如下:
全身性:過敏(如瘙癢、皮疹、風疹、過敏反應、血管炎、血清反應、面部水腫等。)(見禁忌癥和警告)、寒戰、血清素綜合征、光敏反應和極少數病例，多形紅斑可能發展為幹燥綜合征或中毒性表皮壞死松解癥(萊爾綜合征)。
消化系統:胃腸功能紊亂(如腹瀉、惡心、嘔吐、消化不良、吞咽困難、味覺倒置)、口幹等。肝功能檢查異常很少見，特發性肝炎也很少報道。
神經系統:頭痛、睡眠異常(如夢境異常、失眠、嗜睡)、頭暈、厭食、疲勞、欣快、短暫的異常運動(如驚厥、共濟失調、震顫、肌陣攣)、痙攣和罕見的精神運動性焦慮/靜坐不能(見註釋)。血清素綜合癥非常罕見。
精神障礙:幻覺、躁狂反應、意識模糊、激越、焦慮及相關癥狀(如神經質)、註意力和思維能力受損(如人格解體)、驚恐發作、血清素綜合征極為罕見、自殺念頭和行為(這些癥狀可由基礎疾病引起)。在氟西汀治療期間或治療停止後早期報告了自殺想法和行為(參見註意事項)。
泌尿系統:尿瀦留、尿頻等。
生殖障礙:性功能障礙(如射精延遲或不足、性高潮缺乏)、陰莖異常勃起、溢乳。
其他:脫發、打哈欠、視力異常(如視力模糊、瞳孔散大)、出汗、血管舒張、關節痛、肌痛、體位性低血壓和淤血。其他出血表現(如婦科出血、消化道出血等皮膚或粘膜出血)很少報道(見註意事項:緊急情況)。
壹過性低鈉血癥:極少數患者停藥時出現壹過性低鈉血癥(包括110mmol/L以下的低鈉血癥)，停藥後可逆。有些病例可能是由抗利尿激素分泌失衡引起的。大多數報告發現於老年人、服用利尿劑的患者或其他原因引起體液衰竭的患者。
呼吸系統:咽炎、呼吸困難。肺部不良事件很少見(包括不同組織病理學中的炎癥變化和/或纖維化)。開始時呼吸困難可能是唯壹的癥狀。
氟西汀治療停止時的戒斷癥狀:通常在氟西汀停止時出現戒斷癥狀。頭暈、感覺障礙(包括感覺異常)、睡眠障礙(包括失眠和多夢)、疲勞、激越或焦慮、惡心和/或嘔吐、震顫和頭痛是最常報告的不良反應。壹般來說，這些癥狀是輕至中度的，並且是自限性的，然而，在壹些患者中，這些癥狀可能是嚴重的和/或延長緩解時間(參見註意事項)。因此，當需要停用百優解治療時，建議逐漸減少劑量(見用法用量及註意事項)。
兒童和青少年(見註釋)
在兒科臨床試驗中，抗抑郁治療組比安慰劑對照組有更多的自殺相關行為(自殺企圖和自殺想法)和敵對行為。
沒有關於長期使用氟西汀超過19周的安全性的系統研究。
在兒科臨床試驗中，有躁狂和輕躁狂反應的報告(氟西汀組為2.6%，安慰劑組為0%)，其中大多數導致停藥。這些患者沒有躁狂和輕躁狂病史。
在壹項兒科臨床試驗中，服用19周後，氟西汀組身高增長比安慰劑對照組少1.1cm(P = 0.004)，體重增長比安慰劑對照組少1.1kg(P = 0.008)。臨床應用中有個別生長遲緩的情況。
百優解用於報告兒童性成熟延遲或性功能障礙的個別病例。(參見藥理學和毒理學)
在兒科臨床試驗中，也發現服用氟西汀伴隨著堿性磷酸酶水平的降低。