2、網上藥店銷售公開透明，再加上完善的交易制度和管理環境，使得商家會嚴格自律，有利於減少假劣藥品的銷售。
3、隨著我國醫療體制的改革，藥品分類管理制度、執業藥師制度、醫療保險制度等的逐步實施，在客觀上有利於推動醫藥電子商務。
4、許多網站和藥品經營商向顧客提供自診自療的醫學、藥學知識以及詳盡的藥品信息和檢索工具。信息的集中不僅便於消費者的比較、選擇，而且因流通環節的減少，使藥品價格也相對便宜。
5、網上售藥可打破行政區域界限，將信息和實物傳到世界各地，特別是通過網上來表現中醫藥的神奇，將有利於增強世界對中藥的認同，實現中醫在全球為人們服務的目的。
弊端：
1、網上售藥將藥品銷售各方完全隔離。這種既隱蔽又直接的方式容易被不法分子利用，進行無證經營、制藥假劣藥或實施其他欺詐行為。其結果不但使合法網站和藥品經營商的利潤與聲譽受損，而且消費者的生命安全與健康也受到威脅。
2、從目前的技術角度來看，網絡技術缺乏監控，功能尚不完備，即使在技術發達的西方國家，網上售藥業受到種種限制，壹些國家甚至提醒患者不要相信網上出售的藥品。
3、我國藥品分類管理制度剛剛啟動，在網上無法實現對處方的有效管理，處方真偽難以識別，加之消費者在網上得不到醫生、藥師的直接用藥指導，因此從不法網站或合法網站購買藥品的消費者都有可能遭受不當處方之害，或者購買的藥物之間可能存在交叉影響的危險。