抗日戰爭與遷居陜西
奠定西北現代醫學和教育的基礎
1937期間，抗日戰爭突然爆發。為了挽救中國文化教育的根基，抵禦日本軍國主義征服中國思想文化的戰略企圖，國立北平大學、北平師範大學、北洋工學院奉命遷至Xi安。三校愛國師生在極其艱苦的戰爭環境中創辦了國立Xi安臨時大學，開啟了西北教育救國行動，也奠定了西北近代教育和近代醫學的基礎和格局。因此，國立北京大學醫學院更名為Xi安林達醫學院。1938年4月，戰火逼進陜西，日軍飛機轟炸肆虐。Xi安林達再次跋涉到漢中，更名為國立西北聯合大學。
1939年，國民政府行政院決定再次改組西北聯合大學。原北平大學文、理、法、商三校成立國立西北大學，原北平師範大學獨立成立為西北師範學院，醫學院獨立成立為國立西北醫學院(今Xi安交通大學醫學部)。此外，西北農學院和西北工學院獨立成立較早，西北聯合大學已分為五個學校。
從1938到1946，國立西北醫學院及其附屬醫院堅持在漢中農村的惡劣環境中，冒著日軍飛機的轟炸，堅持行醫興教，移風易俗，啟蒙西北現代醫學科學觀念；路藍縷奠定了西北現代教育和現代醫學的基礎和創造；弦歌不絕，培養了數百名民族復興的高級醫學人才；在抗日戰爭中救死扶傷，搶救治療無數軍民，是國內為數不多的知名醫學院。她為中國開創的高等醫學教育的生存和發展，為抗戰大後方醫學事業的堅持和發展，為全民族抗戰的最後勝利，做出了卓越的貢獻。
抗日戰爭勝利
復學未果搬回Xi安進壹步發展
艱難困苦是成功的開始。1945年，中國人民抗日戰爭取得最後勝利。此時，當年遷至陜西的國立北平大學、北平師範大學、北洋工學院的師生，要求恢復在北平、天津的學業。1946 65438+10月，教育部責令北洋大學、北平師範大學恢復辦學。但原國立北京大學由於院系搬遷、與教育部假期未解決等種種原因，最終不顧種種訴求，被教育部拒絕遷址北平。
1946年8月，當時的教育部發布政令:從1946年起，國立西北醫學院漢中部分並入西北大學(蘭州部分後歸蘭州大學)，更名為國立西北醫學院，侯宗廉任院長。8月中旬，西北大學醫學院隨西北大學遷回Xi安。醫學院位於市內崇禮路(今西五路)西北化學制藥廠舊址，其西側建有附屬醫院(今Xi交通大學第二附屬醫院)。與此同時，聯合國總部、教育部和美國紅十字會調撥和捐贈了大量醫院病床設備、x光機、藥品和儀器。1947 11附屬醫院10月開業，初期50張床位，鐘樓裏貼廣告慶祝。它是當時Xi安最大的醫院，Xi安被稱為“西大醫院”或“大學醫院”。至此，國立北京大學醫學院及其附屬醫院終於在西北紮下了根，落葉歸根於長安，最終變成了西北最負盛名的交大醫學院及其附屬醫院。