發票遺失要根據具體情況處理，不能直接補辦。藥品銷售屬於增值稅暫行條例規定的貨物銷售，是開具增值稅發票。遺失增值稅發票應根據以下五種不同情況進行處理。1.壹般納稅人丟失已開具的專用發票的發票聯和抵扣聯，經證明丟失前壹致的，買方可使用賣方提供的相應專用發票記賬聯復印件和賣方當地主管稅務機關出具的丟失增值稅專用發票納稅申報證明，經買方主管稅務機關核準後作為增值稅進項稅額抵扣憑證；2.丟失前未認證的，買方憑賣方提供的相應專用發票記賬聯復印件向主管稅務機關認證。認證壹致的，由賣方當地主管稅務機關出具的專用發票記賬聯復印件和遺失增值稅專用納稅申報表復印件，經買方主管稅務機關核準後，可作為增值稅進項稅額抵扣憑證。3.壹般納稅人遺失專用發票抵扣聯。如果是掛失前已經認證的，可以留壹份專用發票復印件備查。4.遺失前未認證的，可以使用專用發票的發票到主管機關認證，並留存專用發票的發票復印件備查。5.壹般納稅人遺失已開具專用發票的發票聯，可將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，並留存壹份專用發票抵扣聯備查。
中華人民共和國發票管理辦法第三十壹條使用發票的單位和個人應當妥善保管發票。發票遺失時，應於發現當日書面報告稅務機關，並登報聲明作廢。
《財政部關於印發會計基礎工作規範的通知》第五十五條(五)從其他單位取得的原始憑證遺失的，應當取得原出具單位加蓋公章的證明，並註明原始憑證的編號、金額、內容等。，經經辦單位會計機構負責人、會計主管人員和單位領導批準後，方可作為原始憑證。確實無法取得火車、輪船、飛機票等憑證的，由當事人寫出詳細情況，經經辦單位會計機構負責人、會計主管人員和單位領導批準後，作為原始憑證。
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