在兒童，霧化吸入可用於哮喘，以及感染後咳嗽、嬰幼兒喘息、肺炎、急性喉氣管支氣管炎、支氣管肺發育不良等疾病的治療。根據疾病的不同，治療方案、霧化的藥物不壹樣。目前最常用的霧化吸入藥物是糖皮質激素，其次還有β2-受體激動劑、抗膽堿能藥物和黏液溶解劑等。霧化用的糖皮質激素類的目前有二種：布地奈德和倍氯米松，主要是抗炎的作用。霧化用的β2-受體激動劑有特布他林和沙丁胺醇，抗膽堿能藥物用於霧化的就是異丙托溴銨，這兩類藥物都有止喘的作用；其中β2-受體激動劑起效更快，但經常使用會出現“藥效減弱”的情況。另外需要強調是，霧化吸入對於形成的藥霧微粒大小有要求，只有直徑1-5 μm的藥霧微粒才能真正進入呼吸道起作用。粒徑大的微粒絕大多數被截留在口咽部，最終經吞咽進入體內；而小的微粒雖能達到下呼吸道，但又可隨呼氣排出體外霧化。因此，霧化吸入治療需用霧化劑型的藥物，用註射劑型霧化的做法是不可取的。
總體而言，霧化吸入的安全性較好，但並不是完全沒有不良反應。以吸入糖皮質激素為例，可能有聲音嘶啞、咽喉不適等，個別嚴重的病例還可能出現口腔真菌感染，這些與藥物使用不當有關系，通過吸藥後漱口或暫時停藥（1 - 2 d）大多可以緩解。