和大多數封建皇帝壹樣，朱元璋的出世也被人為增加了幾分傳奇色彩，據《明史》記載：朱元璋的母親剛懷孕時，曾經做了個夢，夢中有壹個神仙給了她壹粒仙藥，放在手中閃閃發光，於是她就吃了下去，他母親從夢中驚醒，但是仍余香滿口。等到朱元璋出生時，紅光滿屋，時值夜晚，紅光從屋中射出，鄰居見後，以為失火，忙奔走相救，結果是虛驚壹場。
朱元璋祖籍是江蘇句容縣(今南京市句容縣)通德鄉的朱家巷，其祖先世代耕田種地。其祖父朱初壹因不堪地主和蒙古統治者的剝削，舉家逃到了淮河岸邊的泗州盱眙(今安徽盱眙)墾荒種地。朱初壹死後，家裏壹貧如洗，朱元璋父親朱世珍(本來叫朱五回，後來朱元璋給父親追名為朱世珍)只好東遷西移，五十歲時，才在濠州鐘離縣(今安徽鳳陽)的東鄉定居下來，並在這裏有了朱元璋。
由於營養不良，朱元璋小時候體弱多病，瘦得皮包骨頭。朱元璋父母十分迷信，認為只有觀音菩薩才能救他壹命，保佑他平平安安地活下去。於是，他們就把幼小的朱元璋送到附近的皇覺寺,並讓朱元璋拜寺裏的老和尚高彬為師。
朱元璋到了10歲時，其父親朱世珍為了躲避沈重的賦役，再次搬家。後來就在太平鄉的孤莊為地主劉德種地，朱元璋就為劉德家放牛。
在放牛的過程中，朱元璋結識了徐達、湯和、周德興等人，並成為要好的朋友。日後，徐達、湯和、周德興等人為建立明朝南征北戰，立下了功勛，成為開國元老。
朱元璋自幼聰明頑皮，並曾經讀過幾天書，所以鬼主意最多。常玩的遊戲就是扮皇帝，他穿著破衣爛衫，把棕樹葉撕成絲絲縷縷，粘在嘴上當胡子，用壹塊車輻板放在頭上頂著當作平天冠，然後往土堆上壹坐，就裝模作樣稱起皇帝來，還讓夥伴每人撿壹木塊，用雙手捧著，三跪九叩，並高呼萬歲。
當放牛娃，不僅常挨主人打罵，而且經常吃不飽，只有餓肚子放牛，於是發生了朱元璋宰牛的事情。壹天放牛時，朱元璋和徐達、湯和、周德興都覺得肚子餓，於是朱元璋出點子，將壹頭小牛犢殺掉，大家烤著吃了。沒多久，只剩下壹張牛皮、壹堆骨頭和壹條牛尾巴。吃完了，但回去怎麽向地主交待呢?大家都發愁了，於是互相埋怨。朱元璋於是站出來，想了個辦法，他讓大家把牛骨和牛皮埋了，把血跡掩蓋起來，然後把牛尾巴插到山上的巖縫裏，就說小牛鉆進山洞裏去了，拉不出來。小夥伴都紛紛贊同。這個天真的想法當然瞞不過地主劉德，結果是朱元璋被毒打壹頓並趕回了家，而且給父親增添了賠償小牛的債務。但是朱元璋卻因敢作敢當而深得小夥伴的信任。
流浪行童
蒙古帝國統治時期把人分為四等，蒙古人統治下的漢人、南人是賤民。殺蒙古人償命，殺回回罰銀八十兩，殺漢人罰交壹餐頭毛驢價錢。漢人村裏新媳婦的頭壹夜壹定要給蒙古保長，中國人甚至連姓名都不能有，只能以出生日期為名，不能擁有武器，只能幾家合用壹把菜刀。賦役沈重，再加上災荒不斷，廣大漢人在死亡線上掙紮。
1343年，濠州發生旱災。不料次年春天又發生了嚴重的蝗災，莊稼被蝗蟲吃得幹幹凈凈。禍不單行，接著又發生了瘟疫。壹時間，家家戶戶都死人，壹個村子中壹天中竟死去十幾人，甚至幾十人。
不久，朱元璋家也染上了瘟疫，不到半個月，其64歲的父親、大哥以及母親陳氏先後去世。朱元璋和二哥眼看著親人壹個個死去，家裏又沒錢買棺材，甚至連塊埋葬親人的土地也沒有。可嘆朱世珍壹生勞苦，生無立足之地，死無葬身之處。朱元璋和二哥放聲痛哭，驚動鄰居劉繼祖，於是繼祖給了他們壹塊墳地。他們兄弟二人好不容易找了幾件破衣服包裹好屍體，將父母安葬在劉家的土地上。三十五年以後，朱元璋回憶起此事時，仍難抑悲痛之情，他在《皇陵碑》中寫道：“殯無棺槨，被體惡裳，浮掩三尺，奠何肴漿!”不到半個月，昔日和睦溫暖的家不存在了，父母的疼愛也壹去不復返了。家破人亡的慘痛，深深地影響著朱元璋的心境，使他仿佛跌進了無底深淵。這時，為了活命，朱元璋與他的二哥、大嫂和侄兒被迫分開，各自逃生。朱元璋實在走投無路之下，想起幼時曾經許願舍身的皇覺寺，於是就去投奔了高彬和尚，在寺裏剃度為僧，做了小行童。他在寺裏每日掃地、上香、打鐘擊鼓、燒飯洗衣，整天忙得團團轉，有時仍會受到老和尚的斥責。日子壹長，朱元璋憋了壹肚子氣。壹天，他掃地，被伽藍神座絆了壹下，於是他就順手打了伽藍神幾掃帚。
還有壹次，老和尚見大殿上的蠟燭讓老鼠咬壞了，就當眾訓斥了朱元璋。朱元璋心想，伽藍神連自己面前的東西都管不住，還怎麽管殿宇?更害得自己受罵，越想越氣。於是，朱元璋就找管筆，在伽藍神的背後寫了“發配三千裏”幾個字。這些都反映了朱元璋不甘於受壓迫的性格。
可是，朱元璋做行童不久，寺裏的糧食不夠和尚們吃了，寺裏也得不到施舍，主持高彬法師只好罷粥散僧，打發和尚們雲遊化緣。這樣，朱元璋才做五十天行童，而且還不會念經、做佛事，但是沒有辦法，也只好扮成和尚的樣子，離開寺院托缽流浪。這時朱元璋年僅17歲。
朱元璋邊走邊乞討，他聽人說哪裏年景好就往哪裏走，他從濠州向南到了合肥，然後折向西進入河南，到了固始、信陽，又往北走到汝州、陳州等地，東經鹿邑、亳州，於1347年又回到了皇覺寺。在這流浪的三年中，他走遍了淮西的名都大邑，接觸了各地的風土人情，見了世面，開闊了眼界，積累了社會生活經驗。艱苦的流浪生活鑄就了朱元璋堅毅、果敢的性格，但也使他變得殘忍、猜忌。這段生活對朱元璋的壹生產生了深遠的影響。
朱元璋在外雲遊的三年，也正是元末農民起義風起雲湧的時期。社會上廣泛流傳著“明王出世，普度眾生”的說法，北方的白蓮教也在進行同樣的宣傳。朱元璋在流浪中，也接觸到這樣的宣傳，他目睹國是日非、人民生活惡化的現狀，意識到天下大亂很快就會來臨了。於是在回到皇覺寺後，朱元璋發奮勤學，廣交朋友，準備幹出壹番事業來。
1351年，白蓮教首領韓山童、劉福通在穎州(今安徽阜陽)發動起義，並推韓山童為明王。同年八月，彭瑩玉、徐壽輝在蘄水(今湖北浠水)起義。這些起義者用紅巾裹頭，故稱紅巾軍。1352年，郭子興和孫德崖在濠州起義。
朱元璋聞聽起義的消息，不由心想，老在寺院裏，隨時可能被元官軍抓走，性命難保。正在此時，朱元璋收到兒時夥伴湯和的信，湯和在信中邀請朱元璋參加郭子興的義軍。恰在此時，朱元璋的師兄秘密告訴他，說有人知道此信，要去告密。於是，朱元璋放下缽盂，趕緊去投奔郭子興的紅巾軍。這壹年，朱元璋25歲。
將帥之才
朱元璋入伍後，因為他作戰勇敢，而且機智靈活、粗通文墨，很快得到郭子興的賞識，於是郭子興就把朱元璋調到帥府當差，任命為親兵九夫長。朱元璋精明能幹，處事得當，打仗時身先士卒，獲得的戰利品全部都上交郭子興元帥，得了賞賜，又說功勞是大家的，就把賞賜分給大家。不久，朱元璋在部隊中的好名聲傳播開來。郭子興也把他視作心腹知己，有重要事情總是和朱元璋商量 。當時郭子興有壹養女，是其至交馬公的女兒。馬公死後，他最小的女兒便由郭子興收養。此時，郭子興見朱元璋是個人才，對自己的事業將會有很大的幫助。於是便把21歲的養女馬氏嫁給了朱元璋，從此軍中改稱他為朱公子。有了身份，便不能再用從前的小名重八了，於是就另起了正式名字元璋，字國瑞。
當時，在濠州城中，紅巾軍有五個元帥。郭子興壹派，孫德崖與其他三個元帥壹派，兩派之間矛盾重重。這年九月，徐州紅巾軍主將芝麻李被元軍殺害，其部將彭大和趙均用率兵到了濠州，彭大與郭子興交好，而孫德崖等人則拉攏趙均用。在孫德崖的鼓動挑撥下，趙均用綁架了郭子興，並將郭子興弄到孫家毒打壹頓，準備殺掉郭子興。朱元璋聞訊後，在彭大的支持下，率兵救回了郭子興。從此，兩派結怨更深了。
朱元璋見濠州城諸將爭權奪利，矛盾重重，決心依靠自己的力量，開創新局面。至正十五年(公元1355年)六月中旬，朱元璋回鄉募兵，少年時的夥伴徐達、周德興、郭英等和同村鄰鄉的熟人聽說朱元璋做了紅巾軍的頭目，紛紛前來投效。於是朱元璋很快就募兵七百多人，回到濠州，郭子興十分高興，就提升朱元璋做了鎮撫。
這年冬天，彭大的兒子彭旱住自稱魯淮王，趙均用自稱永義王，而郭子興等仍是元帥。
朱元璋見這些人半年沒出濠州城，於是他從自己招募的新兵中挑選了心腹徐達、湯和等二十四人離開濠州，南略定遠。在南略定遠途中，朱元璋先招撫了張家堡驢牌寨民兵三千人，後又招降了豁鼻子秦把頭的八百人。統率著這支隊伍，朱元璋向東進發，乘夜攻破定遠橫澗山的元軍營地，元帥繆大亨投降。朱元璋從降軍中挑選了精壯漢人二萬人編入了自己的隊伍，並南下滁州(今安徽滁縣)。
在南下滁州途中，定遠名人李善長到軍門求見。李善長和朱元璋壹見如故，李善長以漢高祖劉邦為例勸說朱元璋：只要效法劉邦知人善任，不亂殺人，很快便可平定天下。朱元璋認為很有道理，於是留李善長做了幕府的書記，並囑咐李善長好好協調將領間的關系，***創大業。
朱元璋很快攻下了滁州，其親侄兒文正、姐夫李貞帶著外甥保兒(後來取名文忠)前來投靠。從他們口中，朱元璋得知二哥、三哥、姐姐都去世了，不免傷心。其時還有定遠孤兒沐英，甚是可憐，於是，朱元璋就將這三個孩子收作養子，改姓朱。後來，朱元璋又收養了二十幾個義子。
在朱元璋進攻滁州時，郭子興受到趙均用、孫德崖等人的排擠，所以，朱元璋攻下滁州城不多久，郭子興也來到了滁州。朱元璋立即交出兵權，三萬人的隊伍，紀律嚴明，軍容肅整，郭子興見了十分歡喜。
1353年，朱元璋任命虹縣(今安徽泗縣)人胡大海為前鋒，壹舉攻克了和州。消息傳來，郭子興即刻任命朱元璋為總兵官，鎮守和州。壹次，朱元璋外出，看到壹個小孩在哭，朱元璋問他為什麽哭，答說是等父親。朱元璋仔細壹詢問才知道，原來孩子的父親和母親都在軍營，父親在營中養馬，母親和父親不敢相認，只好以兄妹相稱。朱元璋意識到，部隊軍紀存在問題，他們攻破城池後，擾民滋事，擄掠婦女，這樣下去，部隊將失去民心。於是，朱元璋召集眾將，申明紀律，下令歸還軍中有夫之婦，讓城中許多被拆散的夫妻團圓。此事廣為傳頌，朱元璋深得民心。
此年三月，郭子興病逝，小明王韓林兒任命郭子興的兒子郭天敘為都元帥，妻弟張天為右副元帥，朱元璋為左副元帥。名義上，都元帥是軍中之主，右副元帥的地位也比左副元帥高。但是滁州和和州的軍隊，多是由朱元璋招募收編的，而且朱元璋比郭天敘和張天有勇有謀，並且手下又有人才。所以，朱元璋事實上成了這支隊伍的主帥。
朱升獻策
在朱元璋稱帝之前，所奉行的策略是朱升提出的“高築墻、廣積糧、緩稱王”。高築墻是指加強軍事防備，鞏固後方；廣積糧是指發展經濟生產，儲備糧食，增強經濟實力；緩稱王則是指不要過早稱帝，以免樹敵過多。這三條建議極具戰略眼光，是朱元璋發展初期的指導思想。
朱元璋在和州駐守幾個月後，糧食供應成了問題。與和州相對，緊靠長江南岸的太平(今安徽當塗)、蕪湖是盛產稻米的地方，但是沒有船只，只能望江興嘆。這時恰好兩支紅巾軍的巢湖水軍前來歸附，朱元璋親自處理合並事宜。七月間，巢湖水軍千余只戰艦突破元軍封鎖抵達和州。朱元璋的步馬軍登上巢湖水軍的船只，從和州東渡長江。到達對岸的采石，常遇春壹馬當先，率軍沖殺，攻克采石，獲得大量糧食。將士想把糧食和戰利品運回和州慢慢享用。見此，朱元璋果斷地命人砍斷船纜，任船順流而下，斷絕退路。將士們見無路可退，壹鼓作氣，在朱元璋率領下攻克太平。進入太平，朱元璋重申軍紀，嚴禁擄掠，有個別兵士犯禁，立即處死，因此，朱元璋的軍隊受到當地百姓的擁護。朱元璋於是置太平興國翼元帥府，自己做元帥，任命李善長為帥府都事。這樣，朱元璋便開始了穩固根據地的工作。
至正十六年（公元1356年）三月，張士誠在長江三角洲地帶發起攻勢，進攻江南元軍。乘此機會，朱元璋親自統率水陸大軍，第三次進攻集慶(今江蘇南京)。在第三天，攻破城外的陳兆先軍營，其部三萬六千人歸降朱元璋。但是，朱元璋看出降軍心存疑慮，軍心不定。於是朱元璋就從降軍中挑選了五百名勇士當親軍，在夜裏守衛，而自己身邊，只留有親兵統領馮國用壹人。
第二天，降軍知道此事，都十分感動，疑慮全消，甘願跟隨朱元璋打天下。於是，戰爭進行得十分順利，不到十天，朱元璋便攻下集慶。
朱元璋進城後，下令安撫百姓，改集慶為應天府。小明王韓林兒獲報後，升朱元璋為樞密院同僉，不久又升為江南等處行中書省平章。朱元璋在應天則設天興建康翼大元帥府，以廖小安為統軍元帥，李善長為左右司郎中。
此時，盡管朱元璋擁有十萬兵力，聲勢比過去大了很多，但是占有的地盤仍然很少，而且四面受敵。東面和南面是元軍，東南是張士誠，西面是徐壽輝，雖然同是反元武裝，但是張、徐二人同小明王卻相互敵視。不過，北面小明王、劉福通率領的紅巾軍主力，大大牽制了元軍，而且，張士誠、徐壽輝的力量還不足以兼並朱元璋。這樣壹來，朱元璋暫時沒有對付不了的敵人，並且面臨著壹個很好的發展機會。
朱元璋目前首要的任務是鞏固以應天為中心的根據地。於是在占領應天不久，朱元璋立即派徐達攻取鎮江。出戰前，為了嚴明軍紀，朱元璋故意以放縱士卒的罪名將徐達抓起來，並準備以軍法處斬。此時，李善長出來求情，眾將不知是計，也壹起求情。於是朱元璋就順水推舟，說看在眾人的面上，暫時免去徐達死罪，不過要徐達攻下鎮江後，做到不燒不搶，方可完全赦免徐達之罪。眾將見對待主將尚且如此嚴厲，因此，無不嚴守軍紀，鎮江很快攻下。到1357年冬，朱元璋在壹年的時間裏先後攻下了金壇、丹陽、江陰、常州、常熟、揚州等地，控制了應天周圍的戰略據點。到1359年，從現在的地圖看，朱元璋已經占領了江蘇南京、太湖以西，往南經江蘇、安徽、浙江三省交界處，到浙東的壹塊長方形地區。與四年前剛占領應天時相比，形勢已大有改觀。
在完成了“高築墻”的部署後，朱元璋便著手實行“廣積糧”了。在初期，軍糧的解決主要是靠強征，即征收“寨糧”。但是長此以往，軍隊就會成為純粹的破壞力量，失去民心。為了解決糧食問題，朱元璋除了動員百姓進行生產外，決定推行屯田法，大力開展軍隊屯田，任命元帥康茂才為都水營用使，負責興修水利，又分派諸將在各地開墾種田。幾年工夫，到處興屯，府庫充盈，軍糧充足。在1360年，朱元璋下令不再征收“寨糧”，以減輕農民負擔。為了積糧，朱元璋明令禁酒，但是其手下大將胡大海的兒子胡三舍與別人違法犯禁，私自釀酒獲利，朱元璋知道後，下令殺了胡三舍，有人進諫說胡大海此時正在攻打紹興，希望朱元璋可以看在胡大海的面子上放了胡三舍。朱元璋大怒，堅決嚴明軍紀，於是自己動手將胡三舍殺掉。
在爭取民心的同時，朱元璋還不斷網羅人才，特別是地主階級的知識分子，朱元璋在應天還專門修建了禮賢館來接待他們。這些人在朱元璋統壹全國的過程中起了重要作用，如李善長、朱升。朱元璋十分尊重儒士，他曾在1358年召見儒生唐解實，詢問漢高帝、漢光武、唐太宗、宋太祖、元世祖平定天下之道，這也表明朱元璋決心要開創壹個新的封建皇朝。
削陳平張
朱元璋建立以應天為中心的根據地，在長江上遊有陳友諒，長江下遊有張士誠，東南鄰方國珍，南鄰陳友定。方國珍、陳友定的目標在於保土割據，張士誠則對元朝首鼠兩端，沒有多大雄心；陳友諒最強，是朱元璋占領應天後遇到的最危險的敵人。
陳友諒本是徐壽輝手下大將倪文俊的部下。後來他殺死倪文俊，並於1360年挾持徐壽輝，攻占了太平、采石。於是陳友諒以為應天唾手可得，就殺了徐壽輝，在采石稱帝，國號漢，改元大義。
接著，陳友諒約張士誠東西夾擊應天，平分朱元璋的領地，應天大震。朱元璋只好召集眾將商量對策，壹時眾說紛紜。惟有劉基默不作聲，朱元璋知道劉基有主張，於是征求他的意見，劉基認為目前最危險的敵人莫過於陳友諒，必須集中力量消滅他。雖然陳友諒勢力強大，但是他殺君自立，部眾離心，人民疲敝，故而不難戰勝，只要等他們深入，再以伏兵擊之，不難取勝。
朱元璋同意劉基的判斷，於是設計誘敵深入，制造戰機。朱元璋的部將康茂才和陳友諒是老朋友，於是康茂才修書壹封，派人送到陳友諒營中，約陳攻擊應天，並說願意在江東橋作內應。
六月二十三日早晨，陳友諒率艦隊主力趕到應天郊外的江東橋，才發現橋是石橋而非木橋，方知受騙中計。但為時已晚，朱元璋的伏兵奮起攻擊，陳友諒大敗。朱元璋收太平，占領信州、安慶。陳友諒敗逃九江，第二年八月攻下安慶，於是朱元璋率軍直取陳友諒的老巢江州，陳友諒逃往武昌，朱元璋攻克江西和湖北東南部。
正在這時，中原紅巾軍發生分裂，力量削弱。至正二十三年二月，張士誠乘人之危，派部將呂珍進攻安豐，劉福通向朱元璋求救。待到朱元璋率軍趕到安豐時，劉福通已被呂珍殺死，朱元璋只救出小明王韓林兒，把他安排在滁州居住。
朱元璋率主力營救小明王時，陳友諒認為反攻時機已到，於是率兵進攻洪都(今江西南昌)。
朱元璋的侄子朱文正率領將士堅守八十五天。至正二十三年(公元1363年)七月，朱元璋統兵二十萬，進發洪都，陳友諒獲悉後，撤出圍軍，迎戰朱元璋，雙方在鄱陽湖展開決戰。
鄱陽湖水戰，從八月二十九日開始，至十月三日結束，進行了三十六天。朱元璋的軍隊充分發揮小船靈活的長處，火攻陳軍，最終取勝，陳友諒被亂箭射死。
1364年元旦，朱元璋稱吳王，建百官司屬，仍以龍鳳紀年，以“皇帝聖旨，吳王令旨”的名義發布命令。因1363年張士誠早已自立為吳王，故歷史上稱張士誠為東吳，朱元璋為西吳。
至正二十四年三月，朱元璋再次到武昌督兵攻城，陳理最終出城投降。在吞並了陳友諒後，朱元璋的下壹個目標就是張士誠。
張士誠是泰州(今屬江蘇大半)人，早年販賣私鹽為業。元末發動鹽徒起義，於1354年在高郵稱誠王，建國號為周，建元天。1356年，建都平江(今蘇州)。消滅陳友諒父子後，朱元璋於至正二十五年十月進攻張士誠，壹舉攻下通州、興化、鹽城、泰州、高郵、淮安、徐州、宿州、安豐諸州縣，將東吳的勢力趕出江北地區。
至正二十六年五月，朱元璋發表檄文聲討張士誠。檄文列舉了張士誠八大罪狀，除了第四款和第八款與西吳有關外，其余的全都是指責張士誠背叛元朝。不看開頭和結尾，非常容易使人誤以為是元朝的討伐令。這表明朱元璋已經以順承天命的王自居，準備繼承王朝的正統。
朱元璋的軍隊攻勢迅猛，至正二十六年十壹月，杭州、湖州先後投降，平江成為孤城。於是朱元璋以重兵包圍平江，發動平江戰役。
在圍城的同時，朱元璋派廖永忠去滁州接小明王韓林兒到應天來，但在瓜州渡江時悄悄將船底鑿漏，小明王沈於江底。接著，朱元璋宣布不再以龍鳳紀年，稱1367年為吳元年。平江戰役開始時，朱元璋築墻圍城，並造有三層的木塔樓，高過城墻，以弓弩、火銃向城內射擊，還設襄陽炮日夜轟擊。城內壹片恐慌，張士誠幾次突圍都以失敗告終。張士誠反復無常，貪圖享受，對部下也十分放縱。平江被圍困的最後壹天，張士誠弟弟張士信在城頭督戰，仍不忘享樂，坐在銀椅上飲酒，左右侍奉的人遞桃子給他，結果桃子還沒到口，恰好壹炮打來，腦袋被打得粉碎。朱元璋曾多次派人勸降，都被張士誠拒絕。張士誠死守平江，糧盡後，便以老鼠、枯草為食；箭盡了，便以屋瓦為彈。直至正二十七年(公元1367年)九月初八，朱元璋率軍攻入平江城，張士誠則展開巷戰相抵抗。最後，張士誠被俘，解往應天。朱元璋問話，他不搭理；李善長問他，他則破口謾罵。朱元璋氣極，命手下衛士以亂棍打死張士誠，連屍骨都燒成灰。當時張士誠47歲，東吳滅亡。
明朝統壹
消滅東吳張士誠後，朱元璋大體上占據了今天的湖北、湖南、河南東部、江西、安徽、江蘇和浙江，這些是全國最富庶、人口最稠密的地區。因此，進行大規模南征北伐的時機成熟了。
當時南方的形勢是方國珍占據浙東、陳友定據有福建、明玉珍控制著四川，廣東和廣西則仍處在元朝統治中。在平江戰役快結束之時，朱元璋已派參政朱亮祖率兵進攻方國珍，然後又命湯和為征南將軍，從寧波進攻方國珍，方國珍於至正二十七年(公元1367年)十二月歸降。與此同時，朱元璋與劉基細細商定了北伐計劃。此時常遇春提議：直取大都，以其精兵消滅元朝的疲卒，占領大都後，分兵出擊，則大功告成。為此，朱元璋不贊成，他認為大都是元朝經營了上百年的都城，防禦工事堅固，孤軍深入進攻，太過危險，應先取山東，再占河南，折攻潼關，取得東西南三方面的軍事要點，然後再攻取大都，必將成功。諸將對此表示贊同。
於是，朱元璋以徐達為征虜大將軍，統率全軍；以常遇春為副將軍，另以參將馮勝、右丞薛顯、參將傅友德各領壹軍，全力北伐。
朱元璋再三申明軍紀，告誡出征將士，北伐不是攻城略地，而是推翻蒙元暴政、解除人民痛苦。隨後還發布了由宋濂起草的告北方官吏和人民的檄文，文中提出“驅逐胡虜，恢復中華，立綱陳紀，救濟斯民”的口號，這對中原地區的廣大漢族人民具有很強的號召力；檄文還表示，對於蒙古人和色目人若願為新皇朝臣民，則與中原人民壹樣看待。
北伐軍節節勝利，迅速攻下山東諸郡。至正二十八年(公元1368年)四月占領開封，平定河南，同時攻克潼關。八月，攻克元朝首都大都(今北京)，元順帝見孤城難守，於是帶著後妃太子慌忙棄城逃走，奔向漠北，統治中原長達九十九年的蒙元被趕出了中原。
在南征北伐不斷取得勝利的情況下，至正二十八（公元1368年）正月，40歲的朱元璋告祀天地，於應天南郊登基，建國號大明，改元洪武，以應天為南京。
經過十六年的征戰討伐，朱元璋終於實現了自己的夢想，“驅逐胡虜，恢復中華”，從壹個橫笛牛背的牧童、小行僧，成為明朝的開國皇帝。
1371年，明軍入川，夏主明升暗降，四川平定。1381年，朱元璋命傅友德、沐英、藍玉進攻雲南，次年攻破大理，基成上完成了南方的統壹。1387年，馮勝、傅友德、藍玉奉命進攻遼東元朝殘將納哈出，納哈出無路可走，只好投降，遼東平定。至此，除漠北草原和新疆等地外，全國已基本上統壹。