唐代有潤切煮（炒）（《千金翼方》）法[1]。
到了宋代，炮制方法有了很大的發展，除了唐代的炒法之外，還有微炒（《太平聖惠方》）、炒炭（《博濟方》）、制炭（《資治通鑒》）、酒炒（《汴京新書》）、酒蒸（《丹溪新發》）、姜炒（《九芝比藥方》）、蜜制（《太平惠民和劑局方》）、蜜泔制（《小炒直解》）、麩炒（《聖濟總錄》）、煮法（《千金翼方》）[1]。炒制（《聖濟總錄》）、吳茱萸制（《聖濟總錄》）、巴豆制（《小兒衛生通用微方倫》）等炮制，對炮制的程度也有 "炒微焦赤色"、"燒之保性 "等要求[1]。
元代增加了土炒（"丹溪心法"）、童便制（"原機啟妙"）等方法[1]。
明清以後，增加了醋制、鹽制、乳制、樸硝制、幹漆制（《蒙傳》）、茱萸益智制（《醫學綱目》）、黃土姜酒蜜制（《本草匯言》）、膽汁制、槐花炒（《景嶽全書》）、酒茱萸制（《補萬病回春》）等[1]。對其炮制的目的也有更多的闡述，如 "黃連入手少陰心經，為治火之要藥；治本臟之火，生用；治肝膽之火，浸豬膽煎；治下焦之火，以鹵水或樸硝細末，摻水煎；治氣分濕熱之火，棗湯浸炒；治血分伏瘕之火，幹漆拌水炒；治食積之火，黃土研細拌水炒"（《本草綱目》）[1]。"白痢加山茱萸炒，赤痢用濕槐花炒，去槐花"（《初醒齋廣筆記》）[1]。
現在的炮制方法主要有酒炒、姜炒、山茱萸炒等[1]。
黃連片的炮制方法：取原藥材，除去雜質，搶水洗凈，潤透，切薄片，曬幹，篩去雜物；或搗爛當用[1]。
吳茱萸的炮制方法是：取吳茱萸加水適量煎煮，取汁和渣，將煎好的藥液與黃連片混合，稍加悶潤，待藥液被吸收後，置於煎煮容器中，用文火加熱，煎幹後取出晾涼，過篩去屑[1]。
每 100 千克黃連片用山茱萸 10 千克 [1]。
4 吳茱萸的性狀黃連片為不規則的薄片或碎片，周邊暗黃色，粗糙，富含細小須根殘片，片面黃色[1]。質堅實，氣微，味極苦[1]。
山茱萸色暗黃、味苦，略帶山茱萸辛辣味[1]。
5 吳茱萸的質量要求吳茱萸的總灰分不得大於 5.0%，以鹽酸小檗堿（C20H17NO4-HCl）形式存在的小檗堿不得少於 3.6%；吳茱萸的總灰分不得大於 4.0%[1]。
6 黃連的性味歸經《中華人民***和國藥典》（2010 年版）：黃連味苦，性寒。歸心、脾、胃、肝、膽、大腸經。
《中藥大辭典》：黃連味苦，性寒。入心、肝、胃、大腸經。
《中華本草》：黃連味苦，性寒，入心、肝、胃、大腸經
《神農本草經》："味苦，性寒"。
《吳普本草》："神農、蔓荊子、雷公：苦，無毒，李：小寒。"
《湯液本草》："入手少陰經。"
《本經》："入手少陰、陽明，足少陽、厥陰、陽明、太陰經。"
《本草經解》："入足少陰腎經，手少陰心經。
7 黃連的功效與主治《中國藥典》（2010年版）：
黃連具有清熱燥濕、瀉火解毒的功效。用於濕熱痞滿，嘔吐吞酸，泄瀉，黃疸，高熱頭暈，心火亢盛，心煩不寐，心悸，衄血，血熱衄血，目赤，牙痛，消渴，癰腫瘡毒；外治濕疹，濕瘡，耳道流膿。
黃連善清上焦火熱。用於目赤、口瘡。
生姜黃連清胃止嘔。用於寒熱往來、濕熱阻滯、痞滿嘔吐。
鹿茸具有舒肝、和胃、止嘔的作用。主治肝胃不和、嘔吐、吞酸等癥。
"中藥炮制"：
黃連具有瀉火解毒、清熱燥濕的作用，用於濕熱壅盛、嘔吐泄瀉、黃疸、高熱眩暈、心火亢盛、心煩不眠、血熱衄血、目赤吞酸、牙痛消渴、癰腫疔瘡；外治濕疹、濕瘡、耳道流膿[1]。如黃連解毒湯（《外科正宗》），主治熱毒壅盛，高熱煩躁，癰腫疔瘡；青皮敗毒飲（《疫麻理想》），主治氣血燔灼；白頭翁湯（《傷寒論》），主治熱瀉熱痢[1]。
酒炙黃連能引藥上行，緩其寒性，善清頭目之火[1]。如《證治準繩》中用其治療目赤腫痛、口舌生瘡[1]。
姜炙黃連有緩和苦寒之性，增強止吐作用的作用[1]。如治療濕熱阻胃、胃失和降、嘔吐、泄瀉的香附生姜散（《鎮誌全集》）；治療脘腹疼痛、噯氣吞酸、便熱瀉的獨谷連丸（1983年《四川省藥品標準》）[1]。
烏藥制黃連抑制其苦寒之性，使黃連寒而不滯，以清利濕熱之氣，散肝膽之火為主[1]。如用於治療氣滯內阻、胸膈痞滿、脅肋脹痛或膿血下痢（太平惠民和劑局方）[1]。
《中藥大辭典》：黃連具有瀉下、燥濕、解毒、殺蟲的功效。用於治療發熱、傷寒、熱病心痛、痞滿嘔吐、痢疾、熱瀉腹痛、肺結節、嘔吐、衄血、吐血、消渴、疳積、蛔蟲病、百日咳、咽喉腫痛、火眼、口瘡、癰腫瘡毒、濕疹、湯火燙傷等癥。
《中華本草》：黃連具有清熱瀉火、燥濕解毒的功效。主治熱病煩躁、譫語、熱迫血衄、濕熱胸悶、泄瀉、痢疾、心火上炎失眠、胃熱嘔吐、或食谷不饑、肝目腫痛、熱瘡、疔瘡、目黃、牙齦腫痛、口舌生瘡、耳、陰腫、痔血、濕疹、燙傷。
《神農本草經》："主熱氣目痛，眥傷流淚，明目，腸防腹痛下痢，婦人陰中腫痛"。
《本草綱目拾遺》："主熱氣目痛，眥傷流淚，明目，腸防腹痛痢疾，婦人陰中腫痛。""解巴州毒"。
《藥性論》："殺小兒疳積，點赤眼痛，抑肝清熱解毒"。
《本草拾遺》："主羸瘦氣短。"
《日華子本草》："治五勞七傷，益氣，止心腹痛。心悸煩躁，潤心肺，長肉，止血，和瘡，疥癬，盜汗，日行熱，豬肚蒸為丸，治小兒疳氣。"
《任齋直指方》："能去心竅邪血"。
《珍珠囊》："瀉心火，心下瘟。酒煎，酒浸，上頸已上。"
王好古："主心病逆盛，心積伏梁。"
《本草衍義補遺》："姜汁炒，辛散清熱有效。"
《本草綱目》："解藥過煩，輕粉毒。"
《本草新編》："止嘔吞酸，止渴，治目火，安心，止夢，定狂，去腫滿。"
《本草綱目》："治口瘡疥癬，酒毒，胎毒。去疳積，殺蛔蟲。"
8 黃連湯黃連具有瀉火解毒、清熱燥濕的作用，用於濕熱壅盛、嘔吐泄瀉、黃疸、高熱神昏、心火亢盛、心煩不眠、血熱衄血、目赤吞酸、牙痛、消渴癰腫、疔瘡腫毒；外用治療濕疹、濕瘡、耳道流膿[1]。如黃連解毒湯（《外科正宗》），主治熱毒壅盛，高熱煩躁，癰腫疔瘡；青皮敗毒飲（《疫麻理想》），主治氣血燔灼；白頭翁湯（《傷寒論》），主治熱瀉熱痢[1]。
吳茱萸制黃連抑制其苦寒之性，使黃連寒而不滯，以清氣分濕熱，散肝膽之火[1]。如治療氣滯內阻、胸膈痞滿、脅肋脹滿或痢疾膿血的大香連丸（《太平惠民和劑局方》）[1]。
9 黃連的炮制研究黃連含小檗堿、小檗堿生物堿、掌葉防己生物堿、藥根生物堿、甲基黃酮生物堿、厚樸生物堿等[1]。
9.1 對化學成分的影響實驗表明，切黃連宜在水溫較低時進行，並盡量縮短在水中浸潤的時間，否則會失去藥效[1]。在目前的實踐中，黃蓮大多在使用時被粉碎，以避免在切割過程中成分的損失 [1]。
黃連的主要化學成分小檗堿、巴馬汀和藥根堿的含量在與酒、姜汁和五竹汁調配後沒有明顯變化[1]。但也有報道證明，黃連中的小檗堿含量隨炮制溫度的升高而降低，但炮制後小檗堿在水中的溶出率反而升高[1]。小檗堿在生黃連中的溶出率為 58.17%，經黃酒、姜汁和五竹煎煮後，溶出率約為 85%，說明煎煮對小檗堿在煎劑中的溶出率有促進作用[1]。但也有報道與上述結論不同，認為山茱萸煎劑中的總生物堿含量降低了 8.68%，小檗堿降低了 19.35%，巴馬汀降低了 3.45%。與生藥相比，山茱萸煎劑的生物堿總含量減少了 8.68%，小檗堿減少了 19.35%，巴馬汀減少了 3.45%；黃連經不同方法炮制後，小檗堿的含量有不同程度的降低，其中以黃連炭的降低最為顯著；但黃連與酒混合後，鹽酸小檗堿的含量高於其他加熱的酒制品和生品。黃蓮用不同劑量的白酒和黃酒炒制後，鹽酸小檗堿含量對黃蓮影響不大，但水溶性浸出物的含量明顯高於生品，且酒浸品中微量元素 Mn、Ca、Zn 的煎煮率明顯高於生品[1]。因此，可以推斷酒糟的添加量和加熱溫度對黃連中生物堿的含量和溶出率有影響[1]。
黃連在加熱過程中會產生壹種紅色小檗堿類生物堿--小檗紅堿[1]。當原藥材加熱至 130°C 1 小時或 180°C 20 分鐘時開始生成，其含量隨加熱溫度和時間的增加而增加，小檗堿則相應減少[1]。加熱也會導致香茅生物堿和藥根生物堿的結構發生變化[1]。這表明應重視加熱與黃連質量變化關系的研究[1]。
9.2 對藥理作用的影響研究表明，小檗堿對多種革蘭氏陽性菌和陰性菌有抑制作用，有解熱、抗炎、抗潰瘍、利膽作用，抑制血小板聚集，有降血糖和抗心律失常作用，對心肌缺血和心肌梗塞有保護作用[1]。黃蓮與黃酒、姜汁、吳茱萸汁等配伍後，仍有不同程度的抗菌活性，對綠膿桿菌均有配伍前所沒有的抑制作用[1]。此外，黃連與姜汁配伍後對銅綠假單胞菌的抑菌效果增強，優於其他炮制方法[1]。
10 鹿茸的貯藏方法