國家基本藥物制度對基本藥物使用管理確定的原則是合理配備、優先使用。
1、優先使用
醫院優先配備基本藥物，藥品遵選專家在選本院基本藥物目錄時，在滿足臨床需要的原則上，優先選擇基本藥物進入本院基本藥物目錄，醫院配備的基本藥物品種必須達到國家制定的基本藥物總品種的30%以上。
2、合理配備
新品種的引進，藥劑科根據臨床需求、國家基本藥物政策等相關要求擬定需要增補的基本藥物品種、品規目錄，報藥事管理與藥物治療學委員會審核，然後按照衛生廳基本藥物中標廠家進行引進、配備。
3、負責人員
基本藥物優先配備和合理使用領導小組負責建立健全基本藥物的引進、使用評價及監管等各項制度；醫務科負責組織基本藥物優先合理使用的宣傳、培訓及監管。藥劑科提供技術支持，負責基本藥物的供應、處方專項點評及《基本藥物臨床應用指南》等相關知識的資料收集。
國家基本藥物制度的作用、意義及政策：
1、國家基本藥物制度的作用
中國國家基本藥物制度是對基本藥物目錄制定、生產供應、采購配送、合理使用、價格管理、支付報銷、質量監管、監測評價等多個環節實施有效管理的制度。國家基本醫藥制度可以改善目前的藥品供應保障體系，保障人民群眾的安全用藥。
2、國家基本藥物制度的意義
保證基本藥物足量供應和合理使用，有利於保障群眾基本用藥權益，轉變“以藥補醫”機制，也有利於促進藥品生產流通企業資源優化整合，對於實現人人享有基本醫療衛生服務，維護人民健康，體現社會公平，減輕群眾用藥負擔，推動衛生事業發展，具有十分重要的意義。
3、政策框架
國家基本藥物目錄遴選調整管理；保障基本藥物生產供應；合理制定基本藥物價格及零差率銷售；促進基本藥物優先和合理使用；完善基本藥物的醫保報銷政策；加強基本藥物質量安全監管；健全完善基本藥物制度績效評估。