主要的種類有鹽酸氨糖和硫酸氨糖。
鹽酸氨糖壹直在與硫酸氨糖進行對比，僅就作用來看，這兩者是沒有任何區別的。作用：鹽酸鹽和硫酸鹽都完全溶解於胃酸中，胃酸能使所有的氨基葡萄糖釋放出來以供小腸迅速吸收，而不管其來源，壹旦氨基葡萄糖被吸收進血液，它就與最初的鹽無關，對身體的作用是相同的。純度：鹽酸氨糖是高穩定性的，其純度超過99%，而硫酸氨糖的純度為80%，這是因為硫酸鹽是由鹽酸氨糖加攻摩爾硫酸鈉或硫酸鉀混合結晶而制備，產品中有20%的氯化鈉或氯化鉀（也就是平時的食鹽）。 生物活性氨基葡萄糖：中性的氨基葡萄糖是真正有活性的物質，它是身體合成氨糖聚糖，透明質酸，蛋白多糖和膠原的前體。以上所有物質是修復和維持軟骨健康和關節功能所必要的。根據美國所提到的氨糖及其鹽酸純度和相應的分子量，用簡單的數學運算就可算出鹽酸氨糖釋放83.1%的活性氨糖，而硫酸氨糖釋放量為62.8%。因此，1500mg鹽酸氨糖相當於硫酸氨糖1995mg。如果兩種產品均裝入750mg膠囊中，鹽酸鹽2粒/天相當於硫酸氨糖2.66粒/天。鹽酸鹽60粒/月相當硫酸鹽80粒/月。
硫酸氨糖：人體軟骨對氨糖的吸收主要是靠“硫酸根”介導的，硫酸氨糖則具有這種“硫酸根”；而鹽酸氨糖則是不容易被人體吸收的“鹽酸根”。人的關節重要成分含有“硫酸根”（如硫酸軟骨素等）對於同含有“硫酸根”的氨糖，會顯得更為“親近”，吸收更好。此外硫酸氨糖的氨糖比例高，純度高，雜質極少，這無疑更提高了硫酸氨糖對關節炎的治療作用。“臨床上，氨基葡萄糖的非硫酸鹽療效不佳，有學者推測，治療作用可能是硫酸根而不是氨基葡萄糖介導的。”《氨基葡萄糖治療骨關節炎的現狀》，2004年7月,第23卷第7期“硫酸型氨糖”適合長期服用氨糖是慢作用成分，需長期服用，人體若吸收過量的鉀、鈉、氯離子就會損害肝、腎臟。市場上氨糖主要分為鹽酸氨糖與硫酸氨糖兩種，在中國國內的臨床試驗中，硫酸氨糖與鹽酸氨糖治療效果相似，但是就對身體副作用來說，鹽酸氨糖身體有不適的壹組較多，主要體現在胃部疼痛，好轉反應多，效果相對不明顯。在國際上，硫酸氨糖逐漸成為主流，眾多終端產品含有硫酸氨糖，如麥弗遜、登喜健、倍健等。在國內，氨糖產品主要是以氨糖鹽酸鹽為主，較出名品牌有禾博士等，而硫酸氨糖的產品較少，較知名的產品主要有潤骨素等。“口服氨糖硫酸鹽的吸收率顯著高於口服氨糖鹽酸鹽的吸收率，大概是1.54倍。”