福建省第二人民醫院創建於1990年，是福建中醫藥大學第二臨床醫學院。經過十多年的發展，現已成為壹所集醫療、教學、科研為壹體的三級甲等中醫醫院。總院開放床位432張，年門診量近90萬人次。
福建省福州市中西醫結合醫院、福州市第二醫院、福州市中西醫結合醫院是福建省唯壹壹家三級甲等中西醫結合醫院。醫院位於福州南大門倉山風景文化區。醫院始建於1866年，前身為英國教會醫院-起步醫院。醫院現有醫療用地面積 2.7 萬平方米，建築面積 8 萬平方米。醫院編制床位835張，臨床科室22個，醫技科室18個，中西醫結合重點專科4個，中西醫結合特色專科19個，門診部遍布全院各臨床科室普遍開展中西醫結合診療工作。
福建中醫藥大學附屬廈門中醫院廈門中醫院（廈門市華僑醫院）創建於1956年11月，是全國首批中醫藥示範醫院、首批中醫院、全國名老中醫、愛國華僑領袖陳應龍的第壹任院長。經過半個世紀的發展，現為福建中醫藥大學附屬醫院、北京中醫藥大學廈門臨床醫學院、福建中醫藥大學臨床醫學院。醫院在東南亞享有盛譽，是福建省中醫藥對外交流的重要窗口。醫院現有病床 900 張（其中新院址病床 600 張，原江頭分院肝病、肛腸病治療中心病床 300 張）。醫院占地面積 7.25 萬平方米，建築面積 9.6 萬平方米。年門診量160多萬人次，出院病人2.5萬多人次，是福建省規模最大的綜合性中醫醫院。
福建中醫藥大學附屬泉州中醫院福建中醫藥大學附屬泉州中醫院暨泉州市中醫院創建於1983年，是全民所有制非營利性醫療機構，1995年被國家中醫藥管理局評為 "三級乙等中醫院 "和 "全國示範中醫院"。"全國示範中醫院"，是省醫學教育培訓基地、省全科醫師培訓醫院、省住院醫師規範化培訓試點醫院、省新藥臨床驗證基地、省道路交通事故傷員救治醫院以及泉州市 "120"
福建省急救站。
福建中醫藥大學附屬漳州中醫院和漳州市中醫院創建於1956年，經過幾代醫務工作者***的努力，現已成為漳州市規模最大的壹所集醫療、預防、教學、科研為壹體的中醫院。醫院於1989年、1992年榮獲 "全國衛生系統先進集體"、"愛嬰醫院"，連續多年被省、市授予 "文明單位"、"雙十佳"、"創文明行業、建滿意窗口"、"職業道德建設先進單位"、"廉潔行醫建設先進單位 "等榮譽稱號，1994年3月被國家中醫藥管理局授予全國 "示範中醫院"、"三級乙等中醫醫院"，2003年醫院急診科被評為全國 "青年文明號"。2003 年，醫院急診科被評為全國 "青年文明號"。醫院建築面積33068平方米，編制床位510張。
福建中醫藥大學附屬寧德市醫院暨寧德市中醫院，位於寧德市政府所在地--寧德市蕉城區。醫院創建於1972年，是壹所集醫療、預防、教學、科研為壹體的 "三級乙等 "綜合性醫院，是 "福建省高等醫學院校臨床教學基地 "和 "全科醫學臨床培訓基地"。"醫院總占地面積 19046 平方米。醫院總占地面積19046平方米，總建築面積34827平方米，其中醫療用房25621平方米。醫院編制床位500張，年收治病人1.2萬余人次，年門急診量35萬余人次。
福建中醫藥大學附屬三明市中西醫結合醫院 福建中醫藥大學附屬三明市中西醫結合醫院是在原三明市第三醫院、三明市中醫院兩所具有50多年歷史，集醫療、預防、教學、科研為壹體，以中西醫結合為特色的專科醫院基礎上合並優化組建而成。醫院坐落於繁華的三元區。醫院位於三元區繁華地段，205國道前，與火車站隔江相望，占地面積56畝，編制床位350張，長期開放床位430張，設有三明市高血壓防治研究所、三明市骨科診療中心等28個臨床、技術科室。醫院年門診量25.5萬余人次，收治病人近萬人次，手術量3千余臺次。