對感染球蟲的兔要做到早發現、早治療，並采取綜合治療。
磺胺類藥物
磺胺喹惡啉治療劑量0.1％飲水，預防劑量0.05％飲水，廣泛用於兔球蟲病的防治。乙胺嘧啶飼料中拌入0.0025％乙胺嘧啶對肝球蟲病有效。磺胺二甲氧嘧啶加入飲水中使用時，治療劑量：0.05％～0.07％，預防劑量：0.025％。按體重使用，第1天0.2克/千克體重，以後4天為0.1克/千克體重，間隔5天後重復壹個療程。藥品與飼料比例為：第1天以0.32％濃度拌料，以後4天的劑量為0.15％濃度拌料。復方新諾明用0.02％濃度混料餵服5～10天，可以預防肝球蟲病，使兔肝病變，病兔死亡率、卵囊數顯著減少，0.015％混料餵服可以控制死亡。病兔用0.04％的劑量，無癥狀者用0.02％的劑量，餵服1～2個療程，可以降低病兔死亡率，減少卵囊數，但不能減輕病變。
磺胺藥長期使用易在體內殘留，影響無公害肉品的生產及對外出口，實際生產中最好不用或少用，如果使用應有足夠的休藥期。以上幾種磺胺類藥物連用4～5天後，應停藥壹段時間，再用藥4～5天。如果通過飲水給藥，水必須清潔。兔飼餵含水量大的飼料，如胡蘿蔔和青草時，應少飲水。
磺胺類藥物除了抗球蟲之外，長期使用會產生壹定的毒性。抗葉酸劑，如乙胺嘧啶可加強其藥效，減少磺胺類藥物使用劑量。
中藥療法
內服球蟲九味散。處方為白僵蟲100克，生大黃、桃仁、地鱉蟲各50克，生白術、桂枝、白茯苓、澤瀉、豬苓各40克，***研細末內服，每次3克，每日3次。
用車前草、鴨跖草、苦楝樹葉、雞眼草、鐵莧菜等作飼料，並將大蒜、洋蔥頭、鮮韭菜等切碎拌入飼料中飼餵。
常山、柴胡、甘草各150克，***研細末，根據體型大小，每只服1.5～3.0克，每日2次，連服5～7日。
用冷開水配成0.01％敵百蟲溶液作飲水，每日3次，連飲5天。5天不愈者，再以綠萍500克煎水飲服。