蘭州大學藥學院創建於1959年，初建為蘭州醫學院藥學系，2004年並入蘭州大學。學院下設6個研究所：藥物化學研究所、藥劑學研究所、藥物分析研究所、生藥學研究所、微生物與生化藥學研究所及分子藥理學研究所；2011年，成立藥學科研實驗中心和本科教學實驗中心。
學院***有教職員工60人，教師系列人員45人，其中教授8人、副教授17人，中級職稱人員20人。具有博士學位28人，占教師總數的62%。博士生導師5人，碩士生導師39人（含兼職）。1人入選教育部“新世紀優秀人才支持計劃”。 藥學院每年招收藥學專業本科生150余人，碩士研究生50余人，博士研究生3-5人。現在校生500余人。
藥學學科為甘肅省教育廳重點學科。藥學壹級學科下現有藥物化學、藥劑學、藥物分析、生藥學、微生物與生化藥學及藥理學6個二級學科碩士點。2006年藥學壹級學科碩士點獲得授權，於2007年與蘭州大學化學化工學院聯合建立了藥物化學博士點，2010年獲教育部批準了藥學專業學位並開始招生。藥學院分別同蘭州軍區總醫院、甘肅省藥監局藥品檢驗所組建了2個藥學類研究生聯合培養基地，並在2008年啟動招生。
2009年以來，學院承擔國家自然科學基金項目10項，獲省部級獎3項。近5年發表SCI論文48篇，取得4項發明專利授權，編撰完成了《甘肅中草藥資源誌》（470萬字）等2部專著。
2010年，藥學院所在的勤博樓進行了全面的翻修，學院硬件條件得到了極大改善，購置了現代化的實驗家俱。近幾年，通過“985工程”和“211工程”計劃的支持，購進了壹批現代化的教學與科研設備，固定資產總值超過1千萬元，並建有甘肅省最大的中草藥資源庫