1.兒科，尤其是新生兒和早產兒，包括自我調節在內的各種生理功能尚未發育完全，與成人有很大差異，對藥物的反應壹般比較敏感。新藥上市審批不需要兒科臨床治療資料，缺乏兒科藥代動力學資料，這是主要難點。新生兒體液占體重比例較大，水鹽轉化率較快；血漿蛋白總量較少，藥物血漿蛋白結合率較低；肝腎功能尚未發育完全，藥物清除率較低，在不到半歲時與成人有較大差異；小兒體格和智力均處於快速發育階段，易受藥物的影響等，都應引起用藥註意，予以充分考慮。如新生兒肝臟葡萄糖醛酸結合能力尚未發育成熟，應用氯黴素或嗎啡會分別導致灰嬰綜合征和呼吸抑制。新生兒的腎功能僅為成人的 20%，慶大黴素的血漿半衰期為 18 小時，是成人（2 小時）的 9 倍。中樞興奮藥苯丙胺反而被兒科用於治療學齡兒童的多動癥，其作用性質也發生了變化；兒童服用同化激素會影響長骨的發育，四環素可使牙齒變成灰褐色。
2.老年人的實際年齡與其生理年齡不壹致，即老年人生理機能衰退的早晚、緩急不壹，所以沒有按老年人年齡計算用藥劑量的公式，在醫學上也沒有絕對的年齡分界線，壹般65歲以上為老年人。老年人對藥物的吸收變化不大。老年人血漿蛋白較低，體內水分少，脂肪多，故藥物的血漿蛋白結合率低，水溶性藥物分布容積小，而脂溶性藥物分布容積大。肝腎功能隨年齡增長而自然減退，故藥物清除率逐年下降，各種藥物的血漿半衰期均有不同程度的延長，例如地西泮在肝臟滅活後可由正常的20～24h延長4倍。又如氨基糖苷類抗生素的腎排泄可延長 2 倍以上。對藥效學來說，老年人對許多藥物特別敏感，如中樞神經系統藥物易導致神誌不清，心血管藥物易導致血壓下降和心律失常，非甾體抗炎藥易導致胃腸道出血，抗膽堿能藥物易導致尿瀦留、便秘和青光眼發作等。
性別
除大鼠外，動物對藥物的反應性別差異不大，男性對對乙酰氨基酚和阿司匹林的清除率分別比女性高40%和60%。50年代末在西歐因孕婦服用反應停（沙利度胺，壹種催眠鎮靜劑）而產生的1萬多例海豹畸形兒的悲慘結果引起了人們對孕婦用藥的警惕。已知的致畸藥物如鋰鹽、酒精、華法林、苯妥英和性激素等，在胎兒器官發育的妊娠頭三個月應嚴格禁用。此後，由於胎盤和乳腺對藥物沒有屏障作用，在妊娠晚期和哺乳期還應考慮藥物通過胎盤和乳汁對胎兒和嬰兒發育的影響。孕婦自身對藥物的反應也有其特殊情況需要註意，例如抗癲癇藥物產前應適當增加，產前還應禁用阿司匹林及影響子宮肌肉收縮的藥物。
三、遺傳異常
先天性遺傳異常（基因多態性）對藥物作用的影響近年來已日益受到重視，至少已發現壹百多種與藥物作用有關的遺傳異常。過去，所謂的特異功能（idiosyncrasy）對藥物的反應大多是從基因異常表型中得到解釋的，現在已形成了藥理學的壹個獨立分支--遺傳藥理學（genetic pharmacology）。遺傳異常主要表現為藥物在體內的異常轉化，可分為快速代謝者（廣泛代謝者，EM）和緩慢代謝者（不良代謝者，PM）。前者使藥物很快失活，後者使藥物較慢失活，從而長期影響藥物的血漿濃度和藥效強度。又如葡萄糖-6-磷酸脫氫酶（G6PD）缺乏者服用伯氨喹、磺胺類、碸類等藥物易發生溶血反應。這兩種遺傳異常在我國並不罕見，這些遺傳異常只是受藥物刺激方出現異常，所以並不是遺傳病。
四、病理
疾病的嚴重程度固然與藥物的療效有關，同時其他疾病的存在也會影響藥物的療效。肝腎功能不全分別影響藥物在肝臟的轉化和從腎臟的清除，可以通過延長給藥間隔和/或減少劑量來解決。神經系統抑制，如巴比妥酸鹽中毒，可耐受較大劑量的中樞興奮藥物而不發生驚厥，但在驚厥時可耐受較大劑量的苯巴比妥。還必須註意患者是否患有影響藥物療效的基礎疾病，例如氯丙嗪會誘發癲癇，非甾體抗炎藥會激活潰瘍病，氫氯噻嗪會加重糖尿病，抗 M 膽堿能藥物會誘發青光眼。白細胞缺乏、膿腫未排出、糖尿病在抗菌藥物治療時也會影響療效。
五、心理因素
病人的精神狀態與藥物療效密切相關，安慰劑（placebo）是無藥理活性的劑型（如含乳糖或澱粉的片劑或含生理鹽水的註射劑），用於頭痛、心絞痛、手術後疼痛、感冒咳嗽、神經系統疾病等，可取得30%～50%的療效，是通過心理因素取得的。安慰劑對由心理因素控制的自主神經系統功能影響較大，如血壓、心率、胃液分泌、嘔吐、性功能等。當患者信心不足時，它還會造成不良影響。在新藥臨床研究的雙盲對照中，安慰劑極為重要，可排除假陽性療效或假陽性不良反應。安慰劑對任何患者都可能呈陽性反應，因此醫生不可能僅憑安慰劑就對真假疾病（精神疾病）做出鑒別診斷。醫生的任何醫療活動，包括言行和其他服務態度，都可能產生安慰劑效應，充分利用這種效應非常重要。但是，醫生不能用安慰劑來敷衍或欺騙患者，因為這樣會延誤疾病的診斷和治療，可能會破壞患者對醫生的信任。對於情緒不佳的患者更應註意，氯丙嗪、利血平、促腎上腺皮質激素等壹些中樞抑制藥物在抑郁癥患者中可能引發悲觀傾向，用藥時應慎重。
六、機體對藥物的反應變化
在連續使用藥物壹段時間後，機體對藥物的反應可能發生變化：
1.致敏（sensitization）產生變態反應前面已經提到。
2.速效（tachyphylaxis） 藥物在短時間內反復應用多次後藥效遞減直至消失。例如，麻黃堿靜脈註射三四次後升壓反應逐漸消失。臨床使用兩三天後，對支氣管哮喘不再有效。這是由於其作用機理是促進神經末梢釋放兒茶酚胺，當釋放殆盡後即不再有效。
3.耐受性（tolerance）連續用藥後機體對藥物的反應強度遞減，耐受程度迅速變輕變慢，不會導致反應消失，增加劑量可以維持而不降低藥效。這種現象稱為耐受性。有些藥物在產生耐受性後，如果患者停藥就會出現主觀不適，需要連續再次用藥。如果只是心理上想再次使用，這叫習慣化（habituation），在停藥的情況下不會對身體造成傷害。還有壹些藥物，稱為麻醉劑（narcotics，註意與麻醉劑的區別），吸毒時會產生欣快感（euphoria），停藥後會出現嚴重的生理紊亂，稱為成癮（addiction）。因為習慣和成癮都有持續使用毒品的主觀需要，所以統稱為依賴（dependence）。藥物濫用是指在沒有醫學依據的情況下，長期大量地自行用藥，這是產生依賴性的原因。濫用麻醉藥品不僅對吸食者危害極大，對社會也是如此。嗎啡、可卡因、印度大麻和類似毒品都屬於麻醉藥品。苯丙胺、巴比妥酸鹽、苯二氮卓等也被列入受國際管制的成癮性精神藥物清單。
4.耐藥性 病原體和腫瘤細胞對化療藥物的敏感性降低，稱為耐藥性（drug resistance），又稱抗藥性。有些細菌也會對某些抗生素產生依賴性（dependence）。抗癌化療中也存在類似的耐藥性問題。