1、申請人向省級衛生政務受理部門提交申請材料。政務受理部門在5個工作日內進行形式審查，符合規定的，發給受理通知書，並將申請材料移交藥品化妝品流通監管處；不符合規定的，發給不予受理通知書並壹次性書面告知申請人渣肢所要補正的全部材料；
2、藥品化妝品流通監管處收到申請材料後，在14個工作日內進行審核、審批，批準的，制作《互聯網藥品信息服務資格證書》，移交省級政務受理部孝梁蠢門；不予批準的，制作《不予行政許可決定書》，移交省級政務受理部門；
3、省級政務受理部門收到材料後，在1個工作日內通知申請人，並發放《互聯網藥品信息服務資格證書》或《不予行政許可決定書》。
藥品經營許可證申請提交材料：
1、申請表；
2、企業營業執照復印件（新辦企業提供工商行政管理部門出具的名稱預核準通知書及相關材料）；
3、網站域名註冊的相關證書或者證明文件；
4、網站欄目設置說明；
5、操作說明；
6、藥品及醫療器械相關專業技術人員學歷證明或者其專業技術資格證書復印件、網站負責人身份證復印件及簡歷；
7、健全的保障措施；
8、保證藥品信息相關證明；
9、承諾書；
10、《授權委托書》。
綜上所述，關於互聯網藥品信息服務資格證申請的辦理問題，首先申請單位必須具有合法身份和資質，有兩名以上熟悉相關業務的從業人員和安全的藥品信息來源，在向省級衛生行政管理部門提交申報材料後，省級衛生行政管理部門在二十個工作日內發放資格證或作出不予許可的決定。
法律依據：
《藥品經營許可證管理辦法》第三條
國家食品藥品監督管理總局主管全國藥品經營許可的監督管理工作。省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門負責本轄區內藥品批發企業《藥品經營許可證》發證、換證、變更和日常監督管理工作，並指導和監督下級食品藥品監督管理部門開展《藥品經營許可證》的監督管理工作。設區的市級食品藥品監督管理部門或省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門直接設置的縣級食品藥品監督管理部門負責本轄區內藥品零售企業《藥品經營許可證》發證、換證、變更和日常監督管理等工作。