1、超時不予報銷按照新農合的規定，只能報銷本年度所發生的醫療費用，超時就需要個人承擔醫療費用，新農合不予報銷。在異地就醫的農民，報銷時限則更短，需要在3個月內完成，特殊情況可以延長到6個月，壹旦過了報銷時限，農民就只能自己承擔這些醫療費用。2、未在定點醫院就診新農合有合作的定點醫院，並不是所有的醫院都能報銷的。如果指定的醫療機構條件有限需轉到其他醫院，需開具好轉院手續。壹般情況下在鄉鎮醫院報下比例相對較高。3、私自轉院如果當前醫院的醫療水平還不夠，需要到醫療條件更好的醫院進行治療，這時壹定要得到當前醫院的批準，並辦理轉院手續。新農合才會予以報銷。4、特殊事故的醫療由於自身或他人原因導致的住院，新農合不能報銷。例如酒駕、整形、酗酒、打架、吸毒、流感等導致受傷的不予報銷。還有自身或他人原因導致的交通事故，壹般由事故責任方或單位承擔，新農合不予報銷。5、低於規定報銷金額根據新規定，各級醫院將設置起報金額，低於報銷金額的不予報銷。具體標準是鄉鎮衛生院起報標準是100元，縣級醫院根據等級，二甲醫院起報標準為500元，三甲醫院起報標準為2000元。新農合具體報銷比例詳情請戳2018新農合報銷比例是多少6、養生藥品不予報銷新農合藥物目錄以外的藥品不予報銷，像保健藥、營養品均不予報銷。
凡參加新型農村合作醫療的人員，年度內門診、住院醫藥費用可按規定的補償比例報銷。享受補償的辦法如下：（1）門診：門診不設起付線，門診報銷比例不高於25％。設封頂線為150元。（2）住院：住院設起付線，鄉鎮衛生院起付線不低於100元，報銷比例不低於50％；縣級定點醫療機構起付線不低於200元，報銷比例不低於40％；縣級以上定點醫療機構起付線不低於400元，報銷比例不低於30％，起付線為個人自付部分。比如：到鄉鎮衛生院住院，***支付醫藥費用1600元，扣除自付部分100元後，按報銷比例50％進行報銷，最少能報銷750元。封頂線不高於7000元，是指全年個人報銷總額累計不超過封頂線。凡參加新型農村合作醫療的人員，年度內住院醫藥費用可按規定的補償比例報銷。住院才能比例報銷，鄉鎮衛生院，報銷比例為70％；縣級定點醫療機構報銷比例不低於40％。