①乳酸菌（如嗜酸乳桿菌、幹酪乳桿菌、珍尼乳桿菌、拉瑪尼乳桿菌等。)；②雙歧桿菌（如長雙歧桿菌、短雙歧桿菌、卵雙歧桿菌、嗜熱雙歧桿菌等）；③革蘭陽性球菌（如糞鏈球菌、乳酸乳球菌、中間鏈球菌等）。
雙歧桿菌的使用方法如下：
1、治療便秘 便秘是指排便次數減少或糞便幹燥，難以排解（壹般兩天以上不排便），根據病因大致可分為器質性便秘和功能性便秘兩大類。雙歧桿菌主要用於功能性便秘。功能性便秘壹般與腸道細菌失調密切相關，多為因果關系。它是指腸道外來菌（或過渡菌）和其他腐敗菌增多，產生相應的有毒代謝產物，如胺、酚、吲哚等物質。通過調整腸道正常菌群，恢復腸道正常菌群的平衡，可以大大減少腐敗菌的數量，同時減少對其有毒代謝產物的吸收，從而緩解便秘癥狀。特別是補充雙歧桿菌等原生菌，其產生的醋酸和乳酸 PH 值為 2.8~3.1，使腸道菌群平衡，從而緩解便秘癥狀。1，使腸道呈酸性，結果能控制有害菌引起的異常發酵，刺激腸道蠕動，從而減少水分的過度吸收，緩解便秘癥狀，還能復活機體的免疫功能，有利於內分泌免疫功能的調整恢復，恢復腸道的正常平衡。還能煥發機體免疫功能，有利於內分泌-免疫功能的調整恢復，恢復腸道蠕動，緩解便秘。
2、防治腫瘤
黃曲黴毒素是壹種真菌毒素，常汙染食品，可誘發肝癌。實驗結果證實，雙歧桿菌在體內具有結合黃曲黴毒素的能力。此外，雙歧桿菌可與亞硝酸胺或亞硝基胍等誘導劑結合，掩蓋誘變劑的活性基因，或降解誘變劑的活性基因，使其活性得到促進。實驗證明，雙歧桿菌與熏肉或油炸食品中的致突變物質有較高的吸附作用，從而保護人體細胞免受這些致癌物質的損害。雙歧桿菌可以通過調整腸道正常菌群，抑制腸道多種腐敗菌的生長，從而減少壹些致癌物質的產生，從而大大降低消化道癌癥的發病率。國內外學者報道，雙歧桿菌具有激活機體巨噬細胞或LAK細胞的吞噬活性，產生壹定量的細胸腺因子如TNF-a INF-V等，可直接殺死腫瘤細胞。抑制腫瘤內血管的形成，破壞腫瘤組織的微血管，最終導致腫瘤組織出血、壞死。雙歧桿菌等生理細菌可通過腫瘤細胞雕亡中表達的相關基因誘導腫瘤細胞雕亡，從而抑制腫瘤生長。誘導腫瘤細胞的衰老和異質性。從而促使機體識別並捕獲 LAK 和星形細胞。達到清除腫瘤細胞的目的。
2、增加機體對放療輻射的耐受性，改善放療患者惡心、嘔吐等胃腸道副作用。
3、保護肝臟 人體腸道中的有害細菌會產生毒素並釋放到血液中，對肝臟造成嚴重損害。雙歧桿菌制劑可以抑制產生毒素的有害菌數量，從而對肝病患者起到良好的治療作用。國內8家醫院采用雙歧桿菌制劑對365例慢性肝炎患者進8周治療，發現患者肝功能明顯改善。雙歧桿菌還可用於治療肝昏迷，並能抑制乙肝病毒，促進大小三陽轉陰。
4、心血管疾病，人體血液中膽固醇含量過高會導致動脈硬化和高血壓，雙歧桿菌等有益菌可影響膽固醇的代謝，將其轉化為人體不吸收的類固醇，降低血液中膽固醇的濃度，從而對高血壓和動脈硬化有壹定的防治作用。
5、促進乳糖消化 牛奶營養豐富，是老年人和嬰幼兒的良好食品。但我國有相當壹部分人缺乏乳糖酶，不能分解牛奶中的乳糖，這部分人喝牛奶後，常出現胃腸功能紊亂，導致胃腸痙攣、脹氣或腹瀉，迫使這部分人不能喝牛奶，從而放棄了牛奶中的其他重要成分，雙歧桿菌在乳制品發酵過程中能產生乳糖酶，幫助患者消化乳糖。乳糖酶缺乏的人，飲用經雙歧桿菌發酵的乳制品，不僅可以獲得牛奶中豐富的營養成分，還可以免受腸胃疾病的痛苦。