醫療垃圾分為五大類，分別是：損傷性廢物、化學性廢物、藥物性廢物、感染性廢物、病理性廢物。
1.損傷性廢物
定義：能夠刺傷或者割傷人體的廢棄的醫用銳器。
廢棄的金屬類銳器，如醫用針頭、縫合針、針灸針、探針、穿刺針和各種導絲、鋼釘、手術鋸等；廢棄的玻璃類銳器，如蓋玻片、載玻片、玻璃安瓶、破碎的玻璃試管；廢棄的其他材質類銳器，如壹次性鑷子、壹次性探針、壹次性使用塑料移液吸頭等。
2.化學性廢物
定義：具有毒性、腐蝕性、易燃易爆性的廢棄化學物品。
化學影像、醫學實驗使用後的廢棄的化學試劑；廢棄的過氧乙酸、戊二醛等化學消毒劑；廢棄的含重金屬物質的器具、物品，如含汞血壓計、含汞溫度計，以及口腔科等使用後的含汞物品等。
3.藥物性廢物
定義：過期、淘汰、變質或者被汙染的廢棄藥品。
批量廢棄的壹般性藥品，如：抗生素、非處方類藥品等；廢棄的細胞毒性藥物和遺傳毒性藥物，包括：致癌性藥物，可疑致癌性藥物，免疫抑制劑；廢棄的疫苗，血液制品等。
4.感染性廢物
定義：攜帶病原微生物具有引發感染性疾病傳播危險的醫療廢物。
被病人血液、體液、具有傳染性的排泄物汙染的塑料、橡膠、棉、纖維及其他材質的廢物；微生物實驗室廢棄的病原體培養基、標本、菌種、毒種保存液；各種廢棄的醫學標本；隔離的傳染病病人、疑似傳染病病人產生的生活垃圾。
5.病理性廢物
定義：診療過程中產生的人體廢棄物和醫學實驗室動物屍體等。
手術及其他診療過程中產生的廢棄的人體組織、器官等；醫學實驗動物的組織、屍體；病理切片後廢棄的人體組織、病理臘塊等；傳染病、疑似傳染病及突發原因不明的傳染病產婦的胎盤；胎齡在16周以下，或胎重不足500g的死產胎兒。