櫻桃的病蟲害有褐斑病，細菌性穿孔病，葉斑病、幹腐病、流膠病、根頸腐爛病、根癌病、病毒病、紅頸天牛、金綠吉丁蟲、蘋果透翅蛾、桑盾蚧、球堅蚧、金龜子、舟形毛蟲、綠盲蝽、大葉青蟬、草履蚧等，大部分可參照桃樹病蟲害進行防治。1.櫻桃褐斑病，初現針頭狀紫色小斑點，擴大成圓形褐斑，上生黑色小點，最後幹縮穿孔脫落。病菌在病葉上越冬，5～6月開始發病，7～8月最重。從謝花後至采果前噴1～2次70%代森錳鋅600倍，或75%百菌清500～800倍，采果後噴2～3次200倍波爾多液。2.櫻桃葉斑病，受害葉片在葉脈間形成褐色或紫色不規則形或近圓形壞死斑，葉背產生粉紅色黴，病斑擴大後葉片枯死。病菌在病葉上越冬，風雨傳播，可用代森錳鋅或百菌清防治。3.幹腐病，多在主幹或大枝上發病，初現暗褐色不規則形，病皮堅硬，常滲出茶褐色黏液，後病部幹縮凹陷，周緣開裂，表面密生小黑點，嚴重時全樹或全枝枯死。以菌絲在病枝上越冬，風雨傳播，5～10月都可發病，以前期為重。減少傷口，刮除病斑，用石硫合劑原液塗布，刮下病皮、徹底消毒。
4.根癌病，主要發生在根頸處，有時也發生在側根上，瘤癌大小不壹，小如豌豆，大如拳頭，球形或不正球形，初為淡褐色或灰色小瘤，光滑，質軟，漸變褐色或深褐色，表面粗糙凹凸不平。細菌性病害，病原大部分存在於癌瘤表層，癌瘤分解後被水沖下進入土壤，傷口入侵，昆蟲亦傳病，土溫18～22℃最適瘤的形成，酸性土發病重，酸櫻桃，實生甜櫻桃，考脫砧發病重，中國櫻桃很少發病。嚴格檢疫，選用抗病砧木。健苗用3～5波美度石硫合劑浸種或用根癌寧（K84）生物農藥30倍浸根5分鐘。對2～3年生幼樹可扒開根際土壤，用30倍根癌寧每株1～2千克灌根；已患病植株，用利刀切除病瘤，傷口處貼附上吸足30倍根癌寧的藥棉，並灌以適量的藥液防治。
5.病毒病，有櫻桃衰退病、葉斑駁病、銼葉病、扭葉病，紫櫻桃斑駁病、櫻桃壞死銹斑駁病、櫻桃小果病以及櫻桃銹斑病等幾種。櫻桃衰退病由馬鈴薯簇生病毒，馬鈴薯環斑病毒，煙草環斑病毒引起，發病癥狀因病毒種類而異，馬鈴薯簇生病毒果實出現木質化圓形板結斑塊，果面畸形不平，葉片生枯斑，感染兩種環斑病毒嫁接愈合處出現斑點，後發生疫枯，致整株死亡。櫻桃葉斑駁病病葉出現失綠斑，葉變形枯死，由蟎類傳毒。櫻桃銼葉病發病葉背有許多耳狀小葉，酷似粗糙的銼，葉變窄，畸形。果實畸形或不規則形，大枝死亡、濱庫對該病最敏感，線蟲傳毒。櫻桃扭葉病如疣蚜危害狀，葉向下或兩側卷曲，昆蟲傳毒。紫櫻桃斑駁病，萌芽前即衰退，有時開綻後死亡，7月初老葉葉脈間現黃色斑駁，後現紫色或深褐色小斑。櫻桃壞死銹斑駁病、病斑時隱時現，病株推遲開花展葉，葉小，葉面生圓形或半圓形病斑，在落瓣後2周最明顯，以後病斑壞死脫落。紫櫻桃作指示植物。櫻桃小果病，果實變小，顏色變淡，葉片染病葉緣上卷，初秋變紅，9～10月更明顯，薩姆·星和先鋒作指示植物，觀賞性櫻桃小果病是侵染源，蘋果粉蚧是傳毒者。櫻桃銹斑病葉片現紫色小斑後中央變褐色，圓形或不規則形，邊緣壞死，穿孔脫落，馬紮德櫻桃是指示植物。防治方法可以鏟除病原的中間寄主如觀賞性櫻花，防治和控制傳毒媒介如嫁接、線蟲、花粉等，選用無病毒材料。
6.根頸腐爛病，此病都發生5～15年初盛果期樹，發病從根頸擴展到粗根，先出現水浸狀褐斑，皮層潰爛後形成層腐爛導致樹勢衰弱，果個變小而致整樹死亡，小葉中國櫻桃、種子繁殖的重，大葉與壓條苗輕，土質黏重，排水不良的土壤，高溫多雨的年份重，可能是梨根朽病的病原菌。發現病根，用利刀縱向平行劃道，間距3毫米，深達木質部，塗以50%砷平加（1份福美砷，0.5份平平加，水加50份）。7.金緣吉丁蟲，壹年發生壹代，以大齡幼蟲在皮層內越冬，早春繼續危害，5～6月化蛹，6～8月份羽化成蟲，成蟲有趨光性與假死性，產卵於陽面粗皮裂縫中，卵期10～15天，孵化後蛀食樹皮為害。除用振落撲殺成蟲，黑光燈誘殺，刮皮外，可在6月成蟲羽化盛期向蟲道內註射80%敵敵畏乳油10倍液，消滅羽化成蟲。
8.蘋果透翅蛾，壹年壹代，以幼蟲在皮層下作薄繭越冬，5月中下旬作繭化蛹，6、7月羽化，成蟲在枝幹傷疤和粗皮裂縫間產卵，7月孵化，幼蟲鉆入皮層為害，10月後越冬。可人工挖除，成蟲羽化時噴久效磷加速滅殺酊2000倍，消滅成蟲和初孵化幼蟲。9.綠盲蝽，刺吸嫩莖、幼葉、花果，被害散生紅褐色小點，形成不規則洞孔。壹年發生4～5代，以卵在頂芽鱗片內和雜草上越冬，4月上旬孵化，5月下旬出現成蟲，以後在灰菜及雜草上危害。10月上中旬越冬代返回果樹或雜草上產卵。消滅越冬卵，4月中下旬在雜草及樹上噴20%滅掃利2000倍消滅若蟲、越冬代成蟲產卵噴10%氮氯氰菊酯2000倍液。