1、生產廠商及產地不同：
（1）、北京同仁堂安宮牛黃丸是北京同仁堂科技發展股份有限公司制藥廠生產的。
（2）、南京同仁堂安宮牛黃丸是南京同仁堂藥業有限責任公司生產的。
2、包裝克數不同：
（1）、京同仁堂安宮牛黃：
壹丸三克，壹盒壹丸。
（2）、南京同仁堂安宮牛黃丸：
壹丸三克，壹盒兩丸。
3、價格不同：
（1）、北京同仁堂安宮牛黃：470.00-503.00元(鐵盒金衣裝) 3g/丸，單丸包裝的是350元/丸，雙丸裝的是700元壹盒(兩丸，每丸3g)，以上說的這個價位的是指藥裏面的麝香是天然麝香，價格雖然貴但療效更好些。
也有含人工麝香的，是160元/丸，壹個包裝是2丸要320元，還有10丸壹個包裝的是3500元壹大盒，另外，還有水丸劑型的，就是每盒裏2瓶，價位是495元/盒。
（2）、南京同仁堂安宮牛黃丸：239元起，也有的價格是買到了318元。不同地區價格也有差異。
擴展資料：
北京同仁堂的歷史及地位：
1、清康熙二十七年（1688年）樂顯揚逝世，由其子樂鳳鳴接續祖業，樂鳳鳴幼承家學精通醫藥，於康熙四十壹年（1702年）在北京前門外大柵欄街路南開設了同仁堂藥鋪。
他刻意精求丸散膏丹及各類劑型配方，分門匯集成書，該書收載宮廷秘方、古方、家傳秘方、歷史驗方。
並為同仁堂制做藥品建立起嚴格的工藝規範，自此以往,同仁堂制售的藥品對癥服用,無不驗應，在社會各界迅速樹立起良好的信譽，自此同仁堂的聲譽大振，同時也得到皇室的信任。
2、北京同仁堂自創辦以來，不僅名盛於當時，而且歷數代而不衰，載譽達三百年之久，可說是藥業史上的壹個奇跡，但到清朝末年幾經天災人禍和民國時期的多年戰亂使得市面蕭條，同仁堂的營業也日漸衰落，解放前夕同仁堂已陷入困境。
3、這壹時期樂氏的同仁堂已改由樂氏四房***管，各房心誌渙散，故家事鋪事紛亂已達極點，這時樂氏的經營人為樂松生，由他極力支撐著這壹殘局，直到北京解放才給古老的同仁堂帶來了新生，在1954年公私合營運動中，樂松生帶頭向國家遞交了公私合營申請，帶動了許多民族工商業者，從此同仁堂正式成為公私合營企業。
1956年1月全行業公私合營後，樂松生於1月15日代表北京市工商業聯合會在天安門城樓上向毛主席等中央領導遞交了公私合營的喜報。
公私合營後，同仁堂在政府的支持下，先後建立了制藥廠、養鹿場、制酒廠、中藥提煉廠等，並添置了制藥的機器設備，進行了技術革新，逐步實現了生產機械化。
樂松生被任同仁堂經理，在同仁堂史上樂松生壹方面屬於樂家老鋪最後壹代主管人，另壹方面又是同仁堂公私合營到正式國營企業的首任經理，直到1968年逝世。
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