1、登陸上海市食品藥品監督管理局官方網站，下載並填寫《食品經營許可申請表》；
2、準備相關材料，包括身份證明、經營場所證明、食品安全管理制度等。
3、將申請表及相關材料報送當地食品藥品監督管理部門；
4、等待審核，如果材料齊全且符合要求，將進行現場核查；
5、現場核查合格的，頒發食品經營許可證。
食品經營許可證的有效期：
1、食品經營許可證的有效期壹般為1-5年，各地區可能有所不同；
2、許可證有效期滿後，經營者需提前申請換證，以免影響經營活動的正常進行；
3、如果經營者在許可證有效期內發生重大變更，如經營範圍、經營地址等，需重新申請或變更許可證。
綜上所述，網上辦理食品經營許可證的流程包括：在官網上下載並填寫申請表，準備身份證明等相關材料，提交監管部門，等待審核和現場核查，核查合格後發放許可證。
法律依據：
《上海市食品經營許可實施辦法》
第三章
食品生產企業應當具有符合衛生要求的生產設施、設備，並取得相應的生產許可證；食品流通、餐飲服務等企業應當具有相應的設施、設備、場所和管理制度，並取得相應的營業執照和健康證明。許可證和健康證明。
《中華人民共和國食品安全法》
第四條
食品生產經營者對其生產經營的食品安全負責。
食品生產經營者應當依照法律、法規和食品安全標準從事生產經營活動，保證食品安全，誠信自律，對社會和公眾負責，接受社會監督，承擔社會責任。
第五條
國務院設立食品安全委員會，其職責由國務院規定。
國務院食品安全監督管理部門依照本法和國務院規定的職責，對食品生產經營活動實施監督管理。
國務院衛生行政部門依照本法和國務院規定的職責，組織開展食品安全風險監測和風險評估，會同國務院食品安全監督管理部門制定並公布食品安全國家標準。
國務院其他有關部門依照本法和國務院規定的職責，承擔食品安全相關工作。