雲南白藥集團作為雲南省醫藥龍頭企業，業務訂單逐年激增。受現有廠房的條件限制，產能不足成為制約白藥發展的最大瓶頸，同時隨著國內醫藥自動化物流配送系統的興起及醫療系統的改革，公司的配送客戶數也隨之大幅度增多，現有的場地已不能滿足未來發展的需要，傳統的人工配貨模式也制約了企業的發展。2008年，雲南白藥集團啟動了白藥歷史上的重大事件─新基地建設，暨雲南白藥整體搬遷項目。該項目是對集團公司所屬生產基地、物流中心以及行政中心進行的整體搬遷。我們相信，雲南白藥物流中心作為搬遷的重要組成部分，其建成後必將成為國內最大、最先進的全自動醫藥物流中心之壹，也是西南地區最大、最先進的現代化醫藥物流中心。
雲南白藥物流中心坐落於呈貢新區雨花片區內，占地169.96畝，總建築面積約3.6萬平方米。屬於醫藥商業流通領域，是集區域型、批零兼營並支持3PL（第三方物流）的大型現代化醫藥物流配送中心，主要服務於雲南白藥集團全資子公司——雲南省醫藥有限公司，是雲南白藥集團工業旅遊的重要組成部分。作為壹項系統工程，物流效率和服務水平的高低不是取決於整個系統最強的部分，而是取決於最薄弱的環節。單壹技術環節的高要求、高投入並不能顯著改善整個物流系統的表現。從戰略投資者、商業合作夥伴或者是下遊的客戶的角度來說，更註重的是整個物流系統的可靠性、完整性和物流整體服務水平的高低。為將雲南白藥物流中心打造成壹個現代化、信心。雲南白藥置業有限公司特此邀請了國內外知名醫藥設計公司，在結合省醫藥公司物流特點的同時嚴格按照國家最新GSP標準對其進行設計，並通過與中國九州通醫藥集團物流總部合作，對雲南白藥物流中心進行集成建設，巧妙運用目前國內領先的物流管理信息系統，低價采購世界先進的物流設備，積極發展壯大第三方物流平臺。
首先在規劃方面：公司對該物流中心未來有規模倍增的可能進行了充分考慮，有針對性地對物流中心用地、物流功能區、辦公區、物流動線都做了詳細的規劃。
其次是系統方面：新的雲南白藥物流中心，對重新整合企業現有的人工揀配貨模式提出了較高的要求。建立先進的物流中心系統，優化企業內部物流，建立自動化物流倉儲系統，同企業MES、POS系統相結合，實現藥品的入庫、倉儲、揀配、發貨、合理配置藥品庫存，減少庫存資金占用，提高物流服務水平和降低物流總成本迫在眉睫。
雲南白藥呈貢物流中心內安裝有自動化立體倉庫堆垛機、立體存儲貨架、U型在線揀選平臺、八層A品揀選平臺、八層螺旋輸送線、電動叉車、電子標簽揀選系統、揀/補貨輸送設備、復核輸送線、復核分揀機、高速滑塊分揀機、PDA、指紋識別器、溫濕度自動調控設備等大量先進的物流設備。庫區全部采用中央空調和溫濕度自動實時監控系統，藥品分別儲存於陰涼庫、低溫庫（冷藏庫、冷凍庫）；所有藥品實施批號管理，物流全過程有貨物進出跟蹤記錄並由計算機完成物流信息壹體化管理；量體裁衣的自動化系統，能夠隨時了解作業進度的環境結構，同時提高對訂單揀選發貨的快速響應程度；整箱與拆零作業的分離，大大提高了作業效率；構建出壹個無需專業人員均能進行作業的簡單工作環境，有效防止了人為錯誤的發生，構成零差錯系統；推行的標準化作業流程有效確保了對客戶服務的專業性和壹致性。
建成後的雲南白藥物流中心可儲存藥品35萬箱，日均出庫量為18000箱，支持年銷售額80~100億元。它將為客戶提供倉儲管理、門到門配送、退貨管理、流通加工、簽單返回、低溫儲存和冷鏈控制等物流服務，保證客戶的產品能夠快速、準確、及時地到達配送終端，並將傳承“客戶至上，信譽第壹 ”的服務宗旨，遵循“高效、安全、快捷、滿意”的服務準則，立足雲南市場，覆蓋西南地區，通過不斷提升自身服務能力，力爭為上、下遊客戶提供更加完善的各項物流服務，建立醫藥及健康產品優秀物流服務供應商的品牌地位。這不僅可以給企業帶來良好的經濟效益，而且通過對藥品的合理調配，可以有效降低醫藥供應鏈的成本，進壹步規範醫藥市場流通局面，為西南地區城鄉居民提供更方便、更安全、更快捷的用藥途徑，具有很好的社會效益。
自2009年10月開工以來，物流中心各項工作進展順利，預計2010年底建成並投入使用。這標誌著雲南白藥物流中心實現了由原來以人工為主的傳統物流中心向壹個集可擴展性、適用性、經濟性、安全性為壹體，以高度自動化設備作業為主同時實現了高密度。