1，氧化。比如乙醇在肝臟中被氧化成乙醚和醋酸，然後被氧化成二氧化碳和水。這種類型也被稱為氧化解毒。
2.還原。氯黴素、硝基苯等壹些藥物或毒物可通過還原轉化，三氯乙醛在體內還原成三氯乙醇，失去催眠作用。
3.水解。肝細胞中含有多種水解酶，可水解普魯卡因、普魯卡因胺等多種藥物或毒物。
4.組合。它是肝臟生物轉化最重要的方式，將藥物或毒物與葡萄糖醛酸、乙酰輔酶a(乙酰化)、甘氨酸、3'-磷酸腺苷-5'-硫酸磷酸(PASA)、谷胱甘肽結合。
生物轉化是指毒物經酶催化後化學結構發生變化的代謝過程，即毒物發生了質的變化。生物轉化是毒物在生物體內消除之前發生的重要事件，其典型結果是產生無毒或低毒的代謝產物。因此，生物轉化已經等同於解毒。然而，在許多情況下，生物轉化產生的有毒代謝物會導致組織損傷。此時的生物轉化稱為生物活化。也被稱為中毒。
輔因子再生在生物轉化反應中的應用:
糖核苷酸的再生:寡糖和多糖在許多生物化學過程中起著重要作用，包括細菌或病毒感染中的分子識別和細胞通訊。基於此，低聚糖和多糖可以作為潛在的藥物。在各種寡糖合成方法中，糖苷酶具有高度的區域選擇性和立體選擇性，因此糖苷酶介導的方法可以應用於工業生產。
2.煙酰胺輔酶NAD(P)H的再生:在酶法進行的生物轉化反應中，氧化還原酶催化的壹些反應需要NADH和NADPH作為輔酶。此外，氧化還原力在微生物中通常是不平衡的，NADH+氧化為NAD+和氧化還原平衡對細胞的持續生長非常重要，氧化還原力的不平衡會導致代謝流從所需產物的代謝途徑轉移到其他代謝途徑產生副產物。
3.ATP的再生:ATP是激酶反應中不可缺少的輔酶。這些物質壹般都是小分子有機化合物，與輔助基團不同的是，它們與酶蛋白結合松散。它們可以通過透析和其他方法很容易地從酶中分離出來。它們雖然不直接作用於酶的底物，但特異性不強，常常參與壹系列的酶反應和代謝過程。在這個過程中，ATP主要作為磷酸核苷酸的來源而不是提供能量。