在這個時候兩人都意識到該病毒的商業價值，例如賣給軍方或者散布病毒等等，而愛德華也想利用該病毒給自己的家族制造更大的收益和影響。於是，Ashford說服家族成立新公司安布雷拉，主營制藥。其後愛德華壹直研究怎麽才能將該病毒應用於商業行為。因為始祖病毒還存在著種種缺陷。醉心於學術研究的他，漸漸忽略了斯賓塞這個野心家的存在。
作為壹個歐洲的沒落貴族，斯賓塞壹直對愛德華抱有妒忌之心，他比愛德華更想依靠這個病毒翻身，振興自己的家族。（這壹點目前只是猜測，但稍後我將繼續寫出斯賓塞日後的所作所為，由妳來判斷他做這壹切是為了什麽，這也是目前是整個生化危機最大的疑點）所以在愛德華沈湎於病毒研究的時候，他開始慢慢為自己的計劃打上算盤。
1963年，斯賓塞在美國浣熊市建立安布雷拉分公司。而他聘請了當時歐洲專門從事貴族建築的建築師同時也是自己的好朋友喬治·特力博爾在浣熊市市郊建築了構造極其復雜的洋館。四年之後，洋館完工。斯賓塞邀請了喬治壹家三口到美國旅遊，並以剛興建的洋館作為他們的居住地，實際上卻是把其全家騙來滅口並且做活體實驗。
1967年11月10日，喬治的妻子和女兒麗莎來到洋館，當日起便在不知情的情況下分別植入了始祖病毒的兩種變異體進行活體實驗。3天後，喬治也被騙來，與家人團聚。三人被斯賓塞告知這輩子也別想出去了。16日，喬治的妻子因為病毒排斥，在痛苦中死亡。而麗莎卻成功與病毒融合，但副作用也隨之而來，麗莎開始逐漸失去理智。被軟禁的喬治憑借自己建造洋館時的記憶，開始破解各個囚禁的機關，妄圖逃出洋館，但他按照當時記憶中，走到原應是出口的地方時，看見的卻是斯賓塞為自己立的墓碑。對未來、朋友的絕望與喪妻喪女的悲痛之下，11月30日，喬治悲慘的死去。
1970年，愛德華發現始祖病毒在低溫狀態下會更受控制，因此參與英、法等國在南極的研究並提供大額捐助，因此獲準在南極建立研究基地。
1971年，愛德華被病毒感染，隨即死亡。斯賓塞此時已掌握了公司大權。而他的兒子亞歷山大·亞西福特知道憑自己的力量難以與斯賓塞正面交鋒，於是把研究工作轉向到南極基地。他認為自己的智商在斯賓塞和自己父親之下，這種壹代不如壹代的情況將使亞西福特家族難有大作為，所以窮極之下的他提取了家族創始人維羅妮卡·亞西福特的基因，並用人工受精的方式，創造出阿爾弗雷德和阿莉希亞這壹對雙胞胎兄妹。
1972年，病毒學教授馬庫斯受斯賓塞的邀請成為安布雷拉的新董事。此後安布雷拉開始在世界各地建造秘密研究所，進行始祖病毒的研究與B.O.W.（生化兵器）的開發。各地的研究所均采用活體實驗，而活體的取得大都來自貧民區或者監獄的死刑犯。
1976年，馬庫斯出任浣熊市研究所所長及幹部養成所負責人。浣熊市幹部養成所旨在為安布雷拉培養中層以上幹部為任。此後的威廉·巴金及維斯克都誕生於此。而這個時候，他們兩人還在15歲左右，就以優異的成績進入幹部養成所，成為安布雷拉的預備幹部。他們在幹部養成所的主要研究對象，就是那個壹直與始祖病毒呈融合狀的麗莎。
1977年9月19日，馬庫斯取得突破性進展。在始祖病毒與水蛭的結合中，終於消除了始祖病毒會致使人表皮腐爛、智商降低等副作用。而馬庫斯將該病毒命名為Tyrant，即T病毒。馬庫斯覺得這是令自己更上壹步的砝碼，而斯賓塞也不會輕易讓馬庫斯這麽順利的爬上更高的位置……
1977年11月15日，斯賓塞派遣秘密調查人員，采集馬庫斯的實驗數據。但被馬庫斯察覺。
1978年2月11日，馬庫斯發現自己的處境已經越來越危險，因此他決定將手中的壹切資料逐步交給自己的得意門生威廉·巴金與維斯克。他準備在年底的公司董事會上公布T病毒，從而取得在公司的主動權。但實際上兩人早已效忠於斯賓塞。
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1978年6月3日，馬庫斯在幹部養成所的實驗室中被亂槍射殺。彌留之際他看見自己最得意的弟子，站在他的眼前，冷漠的看著他。兩人將馬庫斯的屍體直接推入下水道。但他們沒有想到，下水道的水蛭病毒將馬庫斯處於微弱的生命狀態，並在長達十年的時間內逐步恢復……
1978年7月31日，16歲的威廉·巴金和18歲的維斯克順利從幹部養成所培訓完畢，進入洋館，開始擔任主任研究院。馬庫斯死後，兩人接手了T病毒的研究，並在麗莎身上壹直做各種慘絕人寰的活體實驗。同時期，維斯克發現自己在學術方面的造詣根本不及威廉·巴金，他深感絕望，因此開始尋找出路。
1981年，年僅10歲的阿莉希亞大學畢業。當年亞歷山大創造的雙胞胎，妹妹果不其然成為了天才，但卻使得哥哥成為了壹個性格缺陷和輕度弱智的廢物。兩者的巨大差異，為日後的悲劇埋下伏筆……
1981年7月21日，阿莉希亞以主任研究員的身份逐漸掌管了南極研究所，父親亞歷山大處於半隱退狀態。這對於威廉·巴金是壹個巨大的打擊。壹個10歲的小女孩竟然輕而易舉的拿走了之前圍繞在他身上諸如“天才少年”之類的光環，這令視榮耀為生命的威廉深感失落。而此時T病毒研究陷入瓶頸。無數的實驗體死去，T病毒與宿主的***存性壹直無法突破，只有麗莎，這個實驗體，能壹直在各種病毒的註射下，依然存活。威廉·巴金意識到這是唯壹的突破點……
1981年9月，阿莉希亞的實驗取得突破，她發現將始祖病毒與蟻後的基因融合，可以大幅提升提高病毒的各種能力。（馬庫斯是將其與水蛭融合，看來始祖病毒對各種動物的基因有愛啊- -）。阿莉希亞認為這是令家族復興的機會，因此該病毒命名為“Veronica”，用於紀念家族創始人。
1983年2月17日，阿爾弗雷德在南極的密室中查閱了當年的文件，知道了自己和妹妹的身世，自己是壹個失敗品的事實使他無法接受，由此他仇恨父親亞歷山大的種子開始在心裏萌芽。
1983年3月1日。阿爾弗雷德將父親軟禁，並對妹妹說，實驗病毒最好的宿主，就是自己的父親。
1983年3月3日，這變態的兩兄妹將Veronica病毒註射到父親亞歷山大體內，進行活體實驗。
1983年4月21日。活體實驗宣告失敗。亞歷山大的智商完全崩潰，並便得易攻擊不受控制。因此兩兄妹將亞歷山大囚禁於南極基地下的牢房中。
1983年4月22日，阿莉希亞總結了亞歷山大身上的失敗，認為是其基因不夠良好導致的失敗。因此，她決定拿自己作為標本，將病毒註射到自己身上。在實驗前，她將壹切事務托付於哥哥。由於病毒活躍性極強，阿莉希亞認為這就是破壞宿主智力的原因，因此她決定采用冷凍宿主的方式延緩病毒的活躍性，來克服智力退化。阿莉希亞進入冬眠……
1983年4月23日，阿爾弗雷德向外界宣布自己的父親和妹妹因為病毒實驗感染而亡。南極基地關於Veronica的研究全部終止。當然，這只是表面。
阿爾弗雷德的開始越發迷戀自己的妹妹，並且經常將自己裝扮成妹妹的模樣（這就是傳說中的女裝癖）。
而威廉·巴金聽到這個消息自然高興得不得了，他的自信再度恢復。
而斯賓塞看到這個家族死的死，活著的又是變態，自然不再關心。壹手掌握公司大權的他，開始為自己的計劃鋪路……
1986年，威廉成為安布雷拉病毒研究的權威，並與研究員安耐特結婚，同年生下雪莉。
1988年1月，邁克爾·奧治當選浣熊市市長。浣熊市是壹個美國西部的小城市，人口不多，經濟也不發達。奧治上臺後開始致力於城市的工業化與人文化的雙重發展，開始修建城鐵等現代化設施，而各種行政建築也采用歐式風格，力圖營造現代與文化並重的浣熊新市容市貌。這壹點得到了浣熊市各界居民的大力贊同，並使他再度連任。而成為全球第壹大制藥企業的安布雷拉，亦對這壹措施大力支持。
1988年底，法國研究所研制出Nemesis。與T病毒不同，Nemesis能夠執行壹些簡單的指令，在智力方面有很大的進步。威廉權衡之下，同意將兩者融合，進行研究。
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1998年5月20日，浣熊市市郊出現登山遊客被野獸襲擊致死的事件。傷口呈撕咬狀。市政府建議遊客出遊時註意安全。
1998年5月26日，第二起類似殺人事件在市郊發生。死者為壹名20歲出頭的年輕女性。警察局長布萊恩宣布STARS進行調查。
1998年5月27日，浣熊時報對於26日的殺人事件頭條報道。
從此開始，市郊的殺人及攻擊事件越來越多。
1998年6月初，由於死亡人數越來越多，安布雷拉修建的秘密實驗體處理廠已經無法安全完善的處理屍體。病毒開始在城市內蔓延。
1998年6月16日，各種生化怪物出沒於山區。但安布雷拉發動其控制的各種力量，將該類事件均描述為恐怖份子所為。因此，並未引起美國高層的註意。而浣熊市市民，仍舊天真的以為壹切很快就會相安無事。
1998年6月30日，瑞貝卡從醫校畢業，進入STARS，成為壹名實習的醫護兵。
1998年7月9日，布萊恩代表警方發表記者招待會，標明針對越來越多的市民投訴市郊的種種傷人事件，警方開始逐步封鎖市郊森林，查找元兇。實際原因則是安布雷拉要徹底查明洋館和養成所病毒泄露的真相。
1998年7月22日，比利被軍事法庭宣判死刑。押送他的軍車在經過浣熊市郊的時候遭到喪屍犬攻擊。比利逃脫。
1998年7月23日，馬庫斯指揮水蛭襲擊了經過市郊的列車，車內乘客無壹生還。
2小時後，STARS的Bravo小組出動，趕往現場。恩裏克任隊長。
《生化危機0》故事開始
途中直升機遭受攻擊墜落，而STARS發現了比利的蹤跡。隊員開始分散尋找，而瑞貝卡在列車上，與比利相遇。
兩人在列車上通過安布雷拉高層死亡後遺留的資料得知真相，前往幹部培訓所，見到了復活後的馬庫斯。威廉和維斯克也通過監視器看到了馬庫斯，大為震驚。維斯克深知復活的馬庫斯肯定不會放過安布雷拉與他們，決定藉此機會脫離安布雷拉。而威廉仍迷戀安布雷拉給予他的權利與地位，不肯放棄。此時安布雷拉驚於STARS隊員超強的作戰能力，認為這是考驗生化武器的絕佳機會，命令維斯克將所有隊員帶往洋館。並讓維斯克進行戰鬥數據收集。
瑞貝卡與比利最終幹掉馬庫斯，而幹部養成所也灰飛煙滅。比利決定從此隱姓埋名，做壹個“死去的人”。瑞貝卡則決定趕往洋館，阻止病毒的進壹步擴散。威廉則將病毒研究，轉往建築在浣熊市內的研究所。臨走前，威廉將自己的研究心血--G病毒樣本，留給維斯克壹份。
7月24日，鑒於Bravo小隊失去聯系壹整天，維斯克率領余下的所有隊員，組成Alpha小隊進入市郊森林。
《生化危機1》故事正式開始
alpha小隊進入森林即遭到喪屍犬的攻擊，而維斯克將隊員引導至洋館中。維斯克在洋館中幹掉了副隊長恩裏克，將克裏斯關進牢中並預備將其與生化武器對抗以采集戰鬥數據，並以貝利的妻女為要挾，使貝利將吉爾騙至Tyrant的實驗室。而這壹切都是安布雷拉要他做的事，他自己要做的則是脫胎換骨。
Tyrant覺醒，維斯克事先註射下G病毒，並且引導Tyrant攻擊自己。維斯克死亡。
吉爾最終擊倒Tyrant，並救出貝利與克裏斯。洋館化為壹片灰燼。
而維斯克，獲得了他死亡後的重生。G病毒在他體會與宿主***存，並不會造成宿主的外貌改編及智商降低。這使得維斯克成為迄今為止，安布雷拉所有病毒實驗中最成功的案例。
1998年7月25日，逃出升天的3人召開記者招待會，會上Chirs嚴厲斥責了安布雷拉的罪行。隨即安布雷拉動用旗下力量開始掩蓋事實真相，三人的言行被媒體認為是無聊的猜忌。隨後吉爾和克裏斯開始轉為地下調查。
1998年8月底，貝利辭職。隨即他前往加拿大，與妻女團聚。
1998年9月，克裏斯決定前往歐洲安布雷拉總部調查真相。而吉爾長期曠工，布萊恩大發雷霆。
1998年9月23日，斯賓塞決定強行搶奪G病毒，因此派遣特種部隊進入浣熊市。在浣熊市市內研究所的威廉·巴金被特種部隊的隊員殺害。G病毒被奪取。在彌留之際，威廉向自己註射了G病毒。然而，病毒與他的身體並不融合，威廉沒有像維斯克壹樣完美，開始變異。隨即他殺死多名特種部隊隊員，而G病毒樣本開始在下水道被老鼠傳播。
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同日，特種部隊隊員漢克，攜帶G病毒樣本回到安布雷拉總部。斯賓塞獲得G病毒。
1998年9月25日，T病毒、G病毒在市內蔓延。城鎮內到處都有咬人，殺人案例，警局開始制定作戰方案。而安布雷拉向布萊恩下達了延緩抵抗，采集戰鬥數據的命令，布萊恩因此下令將彈藥分散到警局各處，表面上他說是為了方便彈藥補給，實則分散了火力，阻擋了抵抗。（這也是為什麽到處都能找到彈藥的原因）
1998年9月26日，浣熊市內通訊逐漸中斷。電視停播。而美國軍方開始出動。
1998年9月27日，浣熊市市長邁克爾·奧治自殺。臨終之時，他將女兒托付給布萊恩。而布萊恩將市長女兒強奸後殺掉。
1998年9月28日，美國白宮宣布浣熊市遭受嚴重的病毒災害，因此準備封鎖浣熊市，並研究解決方案。
此時浣熊市已成為人間煉獄。
《生化危機3》故事開始
吉爾作為留守警局的最後壹批人，開始尋找幸存者並逃出浣熊市。而安布雷拉派遣特種部隊進入浣熊市，開始采集戰鬥數據並毀滅相關證據。特種部隊的壹員即卡洛斯，生化危機3男主角。同事安布雷拉派出復仇者，下達指令為：消滅所有STARS隊員。
同日，吉爾在與復仇者的對抗中感染病毒昏迷。而卡洛斯為其尋找解藥。
同日，裏昂在警校畢業。在酒吧與朋友雅克·湯臣狂歡慶祝的他，並不知道浣熊市發生的壹切，以及白宮的發言。而克裏斯的妹妹克萊爾在大學團體組織的戶外登山遊中完畢，前往浣熊市尋找自己久未聯系的哥哥。
《生化危機2》故事開始
1998年9月29日，裏昂駕著吉普車前往浣熊市報道。很快他就發現了浣熊市的現狀，並與克萊爾壹起前往警局尋找真相。在警局中，裏昂遇見了前來尋找自己男朋友，安布雷拉浣熊市主任研究員約翰的女人艾達·王。
在警局中，裏昂終於得知真相。克萊爾也在警局中得知哥哥已經前往歐洲。而艾達王也透露了自己實則是安布雷拉間諜的身份。布萊恩被G病毒殺死，而變異的威廉殺死了自己的妻子，並出於生物傳宗接代的本能，開始到處尋找自己的女兒雪莉。
裏昂、雪莉與克萊爾最終逃出浣熊市，而克萊爾決定前往歐洲尋找哥哥，裏昂和雪莉則被中情局控制。在中情局威脅下，裏昂加入中情局，為白宮直接服務。而雪莉被維斯克搶走。他堅信在雪莉身上，威廉壹定還留了壹手。
1998年9月30日，經過美國國會全體投票決議通過，鑒於浣熊市事態已無法控制，決定投下原子彈，將整個城市全部消滅。
1998年10月1日清晨，貝利接上恢復意識的吉爾及卡洛斯，逃出浣熊市。
10時正，原子彈擊中浣熊市。浣熊市消失。死亡人數超過10萬，而幸存者不足100人。
《生化危機·逃出生天》故事開始
10月中旬，美國各大媒體開始采訪逃出浣熊市的幸存者。而這些人也紛紛將自己的經歷悉數道出。其中壹名記者愛麗莎用DV將很多珍貴的鏡頭拍攝了下來，成為各大媒體的焦點。而美國由於私下與安布雷拉壹直簽訂生化兵器的研究協議，所以掩蓋了真相。安布雷拉企業作為浣熊事件最大的受害者，得到了全球各個國家的同情。
1998年10月9日，靠近法國的法屬席那島上的犯人計劃越獄。因為他們得知自己將會被安布雷拉作為活體實驗。
1998年10月10日，席那島的犯人集體越獄。席那島研究所所長賓塞德下令將犯人全部射殺。
1998年10月11日，安布雷拉高層得知席那島事件。對於已被浣熊市事件弄得焦頭爛額的斯賓塞，覺得席那島此時的事件不合情誼，因此動了除掉賓塞德的念頭。
1998年10月20日，裏昂依靠中情局獲得的情報，知道席那島事件，因此委托自己的偵探好友雅克·湯臣進入席那島調查。
1998年11月1日，雅克潛入席那島研究所。
1998年11月20日，斯賓塞宣布解除賓塞德的壹切職務。
1998年11月22日，喪心病狂的賓塞德將T病毒散布到整個小島。
1998年11月24日，雅克準備離開席那島，但被賓塞德擊落直升飛機，而他喪失記憶。
《生化危機·槍下遊魂》故事開始
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雅克開始逃出席那島。在途中救出了12歲的少年洛特和其妹妹莉莉。而賓塞德將自己研制的Super Tyanrt喚醒企圖殺死雅克壹行，卻把自己害死。而在整個小島爆炸前，雅克三人逃出席那島。
1998年11月27日，雅克將在席那島取得的資料交給裏昂，而裏昂加入由浣熊市受害者及質疑安布雷拉的人組成的反安布雷拉組織，隨後前往歐洲。而吉爾、克萊爾均前往歐洲。
1998年12月1日，華盛頓、紐約等地爆發大規模遊行示威，指責政府與安布雷拉串通壹氣，掩蓋事實真相。
1998年12月10日，維斯克加入新東家，HCF。艾達王成為其手下。
1998年12月12日，克萊爾在安布雷拉巴黎總部被逮捕，並被押送至南太平洋的洛克福特島監禁。
《生化危機·代號維羅妮卡》故事開始
1998年12月27日，HCF向洛克福特島進行轟炸，並投下病毒。洛克福特島被感染。
克萊爾在混亂中逃出監獄，並結識了囚犯史蒂夫。克萊爾在島中遇見了精神已經幾近失常的阿爾弗雷德。克萊爾和史蒂夫乘坐飛機準備離開洛克福特島，卻被阿爾弗雷德設定了飛機的自動駕駛，飛機飛向南極基地。
12月28日，克裏斯得知妹妹被關押至洛克福特島，於是前往。而維斯克也得知T-veronica病毒的存在，於是在島上，兩人第壹次相遇。（仇人相見，分外眼紅……）得知妹妹已被劫至南極，克裏斯也趕去。
在南極基地，阿爾弗雷德被史蒂夫的金槍擊中。生命的最後壹刻，阿爾弗雷德喚醒了自己沈睡了數十年的妹妹阿莉希亞。
而史蒂夫被阿莉希亞抓住，註射了與亞歷山大壹樣的病毒，開始變異。面對克萊爾，失去理智的史蒂夫瘋狂追殺，在最後壹刻終於清醒，表達了對克萊爾的愛意後，史蒂夫死亡。
維斯克遇見阿莉希亞，而他要求阿莉希亞交出T-veronica病毒。阿莉希亞在狂笑中開始露出怪物真身，而維斯克在與其交手後感到無法控制阿莉希亞，遂逃走。隨後，克裏斯與阿莉希亞正面對決，而她開始展露T-veronica的威力。T-Veronica病毒使人具備了飛翔的能力，並能召喚昆蟲，普通物理攻擊對其均沒有效果，但由於阿莉希亞的冷凍期不足，被阿爾弗雷德提前喚醒仍然具有較大缺陷，因此阿莉希亞最終仍然被克裏斯用線性激光炮幹掉。
阿莉希亞死亡後，維斯克救活了史蒂夫，並在阿莉希亞身上提取了T-veronica病毒。他在南極基地已經得到自己想要的東西，而剩下的就是和克裏斯的恩怨。
克裏斯啟動了南極基地自爆裝置，而維斯克劫持了克萊爾。克裏斯對維斯克說，“我們的恩怨，就在今天做壹個了斷吧！”
維斯克放走了克萊爾，克裏斯示意克萊爾去啟動飛機，而克裏斯與維斯克，這兩位從前的同事、戰友，背負著各自的仇恨，在南極冰原上打得妳死我活，卻沒有分出勝負。
南極基地即將爆炸，而克裏斯與克萊爾也搭乘飛機逃出，維斯克也載著史蒂夫利用潛艇逃出。
生化危機的歷史告壹段落。
安布雷拉是如何垮臺的？
斯賓塞的真正用意是什麽？
維斯克究竟為誰服務？HCF是誰控制？
雪莉身上究竟隱藏了威廉的什麽東西？