第壹天 覺醒
公元1997年聖誕夜，繁華的紐約到處霓虹閃爍，壹片熱鬧。此時，紐約大劇院即將上演壹出高雅的歌劇。紐約女警阿雅身著華麗的服裝和另壹位英俊的小夥子走進歌劇院，豪華的劇場裏已座無虛席，人們正聚精會神地傾聽著舞臺上演員們動情的表演。就在這時，女主角梅麗莎唱起了歌，頃刻間，舞臺上下所有的人都自燃了，劇場變成了壹片火海。只有阿雅絲毫不受影響，作為警察的她自然是拔槍沖上舞臺與夏娃（梅麗莎）大戰，被打敗的夏娃逃到了後臺，阿雅則跟著壹個小女孩化妝進了劇場後臺。
殺死壹只變異老鼠後，可以打開兩個房間的櫃門取子彈。最後兩扇門是鎖著的，在走廊盡頭左邊的房間裏，調查燒焦的屍體可以得到化妝間的鑰匙，電話是存檔用的。回到兩個上鎖的房間。在右邊的房間裏，殺死壹只會變形的鸚鵡，調查櫥櫃可以得到藥品；在左邊的房間裏，在鏡子前找到女演員梅麗莎的日記，得到劇院排練室的鑰匙。進入排練室，伊芙認出了阿雅的同類，並試圖說服她加入自己。打敗了變身的伊芙，綾的恍惚中出現了壹個白色的房間、壹個躺在病床上的小女孩和壹個醫生 ......。清醒過來的 Aya 走到鋼琴後面，發現了另壹個通往下水道的大洞。自然而然地壹路追到下水道的盡頭，小女孩再次將 Aya 引到左邊的門前，這時在用電話備案並進入大鐵門後，Eve 就會分解成壹團黏糊糊的東西，越過後面的鐵柵欄離開下水道，留下壹個與身體分離的怪物（先打尾巴，再攻擊頭部）。打敗了它，阿雅有些失魂落魄地回到劇院外，這裏早已被警車重重包圍，記者們也圍了上來，幸好巡警丹尼爾斯警官趕到，用警車趕走了滿腹疑問的阿雅：線粒體覺醒、解放和神秘的小女孩 ......。
第二天整合
丹尼爾調查了梅麗莎的資料：沒有親人，壹個人住在歌劇院，身體不好，經常服用各種藥物。就在這個時候，警察局長讓阿雅去警察局的地下軍械庫領取武器M16，此時警察局正在召開新聞發布會，阿雅難以自制地說出了駭人聽聞的真相，惹得局長大發脾氣，此時，遠在日本得到消息的生物學家正在趕來的路上。
阿雅和丹尼爾決定先去博物館拜訪克拉姆博士。克拉姆博士向他們解釋了壹些關於線性立體和夏娃來源的概念，但似乎隱瞞了什麽，當兩人深入追問時，博士要求他們離開博物館。
兩人無奈回到警局，因為晚上夏娃的跨年演唱會將在中心公園如期舉行，而市民並不知道夏娃的真面目，屆時會有大批市民湧向那裏，警局要召開緊急會議，丹尼爾得知兒子和妻子 "正是要去的地方"，急得和阿雅團團轉。但當他們趕到時，灼熱的高溫表明公園已被夏娃控制，丹尼爾已無法進入，只能讓阿雅獨自進去。
劇院內，被夏娃控制的人們逐漸融化成壹團細胞液，阿雅穿過公園大大小小的通道後（在壹個死胡同後倒車走了另壹條路，在壹排小屋中找到了壹把鑰匙），終於在公園中央的露天舞臺上找到了夏娃、並壹路追趕她（這裏需要回到劇院外的路口，然後去左側有壹具屍體的地方，調查屍體，然後會有壹個小女孩出現，這時妳要回到有屍體的路口，然後去左側找到屍體。調查完屍體後，接著會有壹個小女孩領著妳走壹小段路，速度很快，跟不上，但妳可以記住她跑的方向），壹直走到在壹輛馬車旁邊，結果夏娃被邀請上了馬車，夏娃試圖勸說阿雅失敗，結果兩個人在燃燒的馬車裏大戰了壹場，墜地昏迷了過去......。
這時，丹尼爾遇到了上廁所躲過壹劫的兒子本；警察正在疏散全城的居民，這時，來自日本的生物學家前田也來到了這座恐怖之城。
阿雅從昏迷中醒來，原來她被丹尼爾救了，並被帶到了壹個小木屋裏；前田也被帶到了這裏。
前田向他們講述了幾年前在日本發生的類似事件，"最終生命體 "因與宿主的身體發生排異反應而失敗。聽完前田的敘述，綾不禁坦言自己可能也是夏娃的同類，她回憶起自己與夏娃接觸時，感覺到了姐姐瑪雅和母親馬列克的存在，心中充滿了懷疑和不安。......
第3天淘汰賽
Aya終於勇敢地走進小屋，準備迎接挑戰，與前田交談，這時丹尼爾開著警車趕來。先去左邊的武器店選武器，然後去右邊的藥店買藥（兩個地方都不去不會FAINT），之後和丹尼爾對話，上車出發。
因為前田發現阿雅昏迷時身上有伊芙殘留的粘液，所以大家來到博物館，準備用儀器進行檢測。結果，在顯微鏡下，發現夏娃的細胞確實已經被線蟲完全控制；在綾的要求下，還做了細胞鑒定，發現綾細胞中的線蟲與細胞核****存在，而且還非常強大，可以與夏娃抗衡。這時，醫生出面趕走了眾人，丹尼爾發現辦公桌上放著與妻子、兒子的實驗清單，憤怒地質問克拉默，但他拒不回答，眾人無奈只好返回警局。
到達警察局後，眾人驚恐地發現伊芙已經襲擊了警察局，本和警犬希夫逃到了樓頂，阿雅沖過去幹掉了已經變成怪物的警犬，救下了本和局長，而局長則保護著受傷的本。
第4天 受精
丹尼爾代替受傷的酋長主持大局。綾在警察局三樓的實驗室找到了前田，他認為伊芙壹定會馬上受精，孕育出最後的生命體，大家決定馬上趕往聖弗朗西斯醫院的精子庫。在醫院裏，阿雅看到了妹妹瑪雅的實體，她壹路追趕，結果夏娃鎖上了門，切斷了電線。***此時在剩下的幾個房間裏尋找能接通電路的保險絲，並在有電話存檔的房間裏拿到停屍房的鑰匙，進入停屍房拿到藍色鑰匙和保險絲，打開那扇藍色的門，進去接上保險絲（要接 3 次才能啟動，同時電梯也會壹路上升），關閉開關，電源重新接通、坐電梯回到大廳，從上面的門進去，救出壹名醫生和護士，原來這正是常幻想中的病房，拿到綠卡，到有液氧的倉庫，打開開關，再從剛才救出的醫生口中得知，13樓有壹個研究室。
乘電梯到 13 樓，進入壹個房間，在紅色箭頭標示的角落裏，按下壹個盒子，露出壹個按鈕，打開房間裏的另壹扇門。在裏面的資料室裏，阿雅發現了和克拉默博士壹模壹樣的名單，以及兩份報告的殘片：原來，1977 年 12 月 23 日發生了壹起交通事故，阿雅的母親和姐姐被送往醫院。阿雅的母親和妹妹被送到醫院後，母親去世，妹妹休克 ......另據報道：女演員梅麗莎也在同壹天入院接受移植手術 ......
拿到新電梯的鑰匙，進去登上頂樓。
與此同時，海岸邊的幾艘護衛艦和壹艘航空母艦已經靠近了城市，艦載戰鬥機編隊升空飛入城市，原來艦長已經接到指示，派空軍鎖定公園中心的怪物，隨時準備發動攻擊。
來到樓頂的艾婭遇到了伊芙，她正釋放出巨大的能量摧毀城市上空的戰鬥機，其中壹架燃燒著的戰鬥機向醫院的樓頂俯沖下來，艾婭無奈只好從樓頂壹側跳下，跳到維修架上回到地面；伊芙帶著她需要的精子成功逃脫。
丹尼爾將前田和綾帶回警局，華納警官經過調查，發現梅麗莎和克拉默博士經常接觸，大家覺得夏娃壹定是在尋找安全的地方受孕，於是決定分頭尋找夏娃的下落。
第五天 解放
作者註：（我在這裏做了壹次看似無用的調查。）我先去了港口碼頭，那裏有警察報告說看到了可疑的人，又進了地下儲藏室，那裏什麽也沒有，只有壹根不斷噴出熱氣的管子。{我覺得這壹趟白來了，因為我似乎發現不了任何情節。希望其他玩家知道這個地方的設計目的，告訴大家｝
來到唐人街，繼續往裏走（可以先在街邊的電話亭存檔），遇到前田，在地下水道的井蓋處找到伊芙留下的痕跡。Aya 當然是往下走，**** 往下走，經過 2 個路口後往左走，在第 3 個路口往南（面向妳）走到底，就會來到壹個巨大的通道，登上貓道往裏走，最後在機房裏遇到巨大的公園生物，打開開關（2 號泵）將怪物趕出水泵、然後關掉開關（如果不關掉開關，就無法通過充滿水的下水道），此時不要返回原路，在機房左上角有壹扇通往北面的鐵門，進去後躍過無水的下水道，來到地鐵站。從兩側的地鐵軌道壹直走到壹座橋上，從壹個警察的屍體上拿到地鐵出口的鑰匙，然後在城市中央找到向博物館移動的怪物。[磁盤 1]
拿到鑰匙後，通過鐵路回到剛才的站臺，繼續向南走，進入壹扇通往地面的門。直奔博物館，進入博物館，發現西北方向有人影閃動，追進那個房間竟然遭遇恐龍襲擊，壹路追下去發現最後壹扇門被人打開了。無奈只好返回去，***從另壹條路走去（經過壹些排列得像叢林的房間壹些回答問題的機器，答對了可以補充子彈）；上了二樓，靠近壹樓大廳的那個房間進去，門沒鎖，但可以從窗戶爬出去；總之，在整個2、3層中闖壹闖就好了，但最終壹定要找到靠近整個博物館中心（好像是2樓）鋪著紅地毯的大客廳，大廳靠北（背對窗戶）的壹側有個控制室，進去後關掉警報器（電梯可以使用），此時隨著夏娃的歌聲，博物館裏的恐龍全部活了過來，包括巨大無比的霸王龍酷斃了。
***我在博物館裏轉悠了半天後發現應該坐電梯到三樓，然後從電梯外對應的樓梯下到二樓。看到壹個房間的門半開著，阿雅以為是克拉默博士在裏面，沒想到是前田在裏面檢查瑪雅的血清標本，而丹尼爾去醫院查資料了。瑪雅的血清終於揭穿了博士的陰謀：博士培養了壹個無線立體純精子給夏娃使用，以免夏娃重蹈日本的覆轍。克拉默博士承認了這壹切，稱贊夏娃的進化完美，並試圖用手術刀殺死阿雅。丹尼爾及時趕到，制服了克雷默博士，但為了阻止艾婭阻止夏娃，克雷默瘋狂地引爆了自己。***現在，如果妳乘電梯到頂樓（4 樓），可以看到壹個房間的門上沾滿了液體，但妳進不去，不過可以從旁邊的樓梯下去，然後朝房間的位置繞過去，就會遇到壹個用克魯姆的鑰匙打開的房間，進去後，壹只突然復活的恐龍將艾婭撞到了壹樓的空地上，妳可以把它幹掉；然後霸王龍從上面俯沖下來。然後回到剛才用鑰匙打開的房間，阿雅從克魯姆的屍體上拿到了博物館的鑰匙。然後回到剛才用鑰匙打開的房間，進去 ......。接著，大地震動了，綾沿著布滿粘液的樓梯往下走，最後在壹個布滿粘液的巨大大廳裏見到了已經被浸漬完的大腹便便的夏娃。
整個城市都在震動，無數黏糊糊的東西從排汙管道裏沖出來，匯成壹個巨大的怪物，直奔博物館而來，伸手就要抱走無法動彈的伊芙。
綾失魂落魄地走出博物館，丹尼爾開車送她和前田，告訴梅麗莎自己的遭遇，夏娃是壹個日本科學家創造的，他用妻子的身體復活了她。為了復活妻子，他用妻子的細胞進行培養（也就是現在最新的克隆人計劃），結果依賴細胞的線粒體脫離了人體細胞，控制了細胞，從而控制了人類。全場鴉雀無聲 ......
此時接到總統的進攻命令，航母上的戰鬥機、直升機編隊迅速起飛直奔城市中心的巨大怪獸。人群站在遠處焦急地註視著悲劇的發生。在飛行員和戰鬥機被高溫點燃並爆炸後，所有部隊全部靠近怪物--夏娃的守護神......。
指揮官把綾等人帶到了航母上，希望綾能利用自己的特殊能力帶領戰鬥小組炸毀伊芙。綾勇敢地登上了直升機編隊，在隊友們壹個個被炸死後，綾靠近了夏娃，並成功地用特殊炸彈炸死了大魔王，巨大的大魔王和自由女神壹起散落在地上。就在眾人為航母歡呼的時候，對講機裏傳來了綾的聲音："不，還沒有結束。"然後跳傘，從直升機上壹躍而下，而夏娃則從粘液中站了起來。經過壹場大戰，美麗的夏娃逐漸溶解，阿亞的腦海裏全是夏娃對人類的蔑視和不屑......。
第6天 進化
就在阿雅在戰艦上休息的時候（壹定要在休息室裏面存檔，補給品在士兵那裏有），海面上的另外幾艘戰艦突然爆炸了，剛才的廢墟中傳出了嬰兒的啼哭聲，最後的生命體終於誕生了。
阿雅又壹次勇敢地留下來面對，丹尼爾和前田只好乘坐直升機逃走。
伊芙從嬰兒到成人要換4次身體，前3次是想用什麽槍就用什麽槍，第4次換成綠色怪物後，她用前田的手槍開了4、5槍（好像）、直升機上的丹尼爾從空中掉下來，把剛才前田沒來得及取出的裝有阿雅血清的子彈扔給阿雅，火人壹樣掉進海裏，再次開了6槍想打敗伊芙，但伊芙又變身了，這次阿雅只能逃跑，壹碰伊芙就死、(我就因為這樣死了2次，逃跑時因為進了死胡同，打開門慢慢被追上死了3次，想想也是，每次讀檔都要和4次變身的伊芙重新打壹次，就知道有多痛苦了，也幸好保存了檔案的）此時從鐵門進入休息室（不想存檔了，手機壞了，我剛存檔就在這裏被咬死），然後是休息室（不想存檔了，手機也壞了。我在這裏被咬死了），看完船體示意圖，再進原來士兵把守的鐵門，進左邊第壹個路口（右邊是死胡同），爬下樓梯，這時來到戰艦的控制室，暫時伊芙不會下來，去控制臺打開自動毀滅開關、然後從另壹個樓梯爬上去，這次沒有岔路了，但不要耽誤時間（跑路不要拐彎，進門要壹次成功不要總是撞墻），最後，阿雅在爆炸的壹瞬間躍入大海，而夏娃則留在了火之煉獄。.....
故事終於圓滿結束了，壹切都恢復了平靜，在前田準備返回日本的前壹天，綾、丹尼爾、前田、本再次來到歌劇院，欣賞那場沒有結束的歌劇演出，這時，所有人內心的那根線又壹次在新女主角伊娃的歌聲中被喚醒了......。[磁盤 2]