許多科學實驗和實踐證明，蜂蜜的食用方法對其營養保健功能和醫療效果有直接影響。吃蜂蜜是很有講究的，只有科學的吃法才能充分發揮蜂蜜的營養、保健和醫療作用。
1.食用方法:新鮮成熟的蜂蜜可以直接食用，也可以制成水溶液食用，因為水溶液比純蜂蜜更容易吸收。但是，蜂蜜壹定不能用開水煮沸或高溫煮沸，因為不合理的加熱會嚴重破壞蜂蜜中的營養成分，使蜂蜜中的酶失活，顏色變深，香味揮發，口感改變，變酸。研究表明，蜂蜜營養素中的酶，尤其是澱粉酶對熱不穩定，澱粉酶值降低證明蜂蜜特有的香味和口感被破壞揮發，抑菌效果降低，營養素被破壞。所以蜂蜜最好用40℃以下的溫水或冷水稀釋，尤其是炎熱的夏天，用冷水喝蜂蜜是很好的清涼健康飲品。
二、食用時間:蜂蜜的食用時間很有講究。壹般在1-1.5小時飯前或飯後2-3小時吃比較合適。但對於腸胃病患者，應根據病情確定進食時間，這樣才能發揮其醫療作用。因為科學研究和臨床實踐證明，蜂蜜對胃酸分泌有雙重作用。當胃酸分泌過多或過少時，蜂蜜可以起到調節作用，使胃酸分泌正常化。如果飯前壹個半小時吃蜂蜜，可以抑制胃酸的分泌；如果吃完馬上吃蜂蜜，會刺激胃酸分泌；溫蜂蜜水溶液可稀釋胃液，降低胃液酸度，而冷蜂蜜水溶液可增加胃液酸度，刺激腸道運動，故可用於腹瀉。因此，胃酸過多或肥厚性胃炎患者，尤其是胃及十二指腸潰瘍湯者，飯前1.5小時吃溫蜂蜜水，既可抑制胃酸分泌，又可使胃酸減少，從而減少對胃黏膜的刺激，有利於潰瘍面愈合；胃酸缺乏或萎縮性胃炎患者應在進食後立即食用冷蜂蜜水。神經衰弱的人每天睡前吃蜂蜜，可以促進睡眠，因為蜂蜜有安神增智、改善睡眠的作用。
3.用量:蜂蜜的壹般用量為:成人每天食用100克比較合適，最多不超過200克。孩子早上吃30-60克，中午吃40-80克，晚上吃30-60克比較好。用於治療時，兩個月為壹個療程。