(1)種植抗病品種。
選擇中國蔬菜4號、5號、6號、茂粉802、佳粉10、佳粉15、L-402、佳源大凡、中峰等抗病、耐病品種。
(2)種子處理。
播種前用清水浸泡種子3-4小時，然後用10%磷酸三鈉溶液浸泡40-50分鐘，或用0.1%高錳酸鉀浸泡30分鐘。取出後用清水沖洗，然後催芽播種。
(3)作物輪作。
與兩年以上的谷類作物實行輪作，避免與西紅柿、土豆、辣椒等蔬菜輪作。
(4)育苗。
選擇無病土壤育苗，夏季采取措施避蚜。可以在苗床上搭建帶紗網的小拱棚，可以避免暴雨侵蝕，遮陰降溫，減少蚜蟲的入侵和傳播。為減少移栽時傷根，應采用營養缽育苗，移栽的適宜苗齡為60天左右，八葉壹心，第壹芽為宜。
(5)加強現場管理。
施足有機底肥，栽後早中耕除草，及時培土，促生根，晚叉早收；在修剪、耙地、收割等田間作業中，應先取健康植株，後避病株，避免人為將病株汁液傳遞給健康植株；在地裏幹農活的時候不要抽煙，以免病毒從煙草傳播到西紅柿上。
緩栽苗後，第壹穗在坐果期要及時澆水追肥，促進坐果壯苗，特別是高溫幹旱季節，要勤澆小水，保持田間濕潤，降低地溫。
(6)蚜蟲的早期預防。
蚜蟲是番茄病毒病的主要傳播媒介，及時防治蚜蟲是防病的主要手段。黃板可用於野外誘殺，塗機油。也可噴灑2000倍的20%菊馬乳油、3000倍的50%抗蚜威可濕性粉劑或10%吡蟲啉可濕性粉劑。
(7)化學控制。
發病初期可用1.5%植保乳劑1000倍液或20%病毒A可濕性粉劑500倍液防治。另外，噴施1%硝酸鉀追肥可以提高抗病性。
(8)滅活病毒。
使用減毒疫苗N14或衛星S52，取出1 ~ 2片葉的番茄苗，洗凈土壤，立即浸入100倍疫苗N14或S52的溶液中。30 ~ 60分鐘後，苗踵進入苗床，可減輕花葉病毒和條紋病毒的危害。