臨床上主要用於治療咽痛、喉鎖、口渴、咳痰及肺熱或陰虛熱引起的咳嗽。臨床上，胖大海常與桔梗、甘草、薄荷等藥物合用，可增強療效。有些經常說話的人，聲音被鎖定，引起咽痛癥狀，偶爾在胖大海裏也能服。肺與大腸經的出現，胖大海能宣肺氣清肺熱，通過大腸經釋放大便中的死熱，故可治療大便幹結、咽喉腫痛、目赤、頭暈頭痛等癥。胖大海是治療急性慢性咽炎、扁桃體炎、便秘等癥狀的最佳藥物。
但也要註意，脾胃虛寒者不宜過量使用。另外，胖大海有毒，服用幾天就要停藥，不能長期使用。四類人應慎用胖大海。壹是身體不衛生，表現為食欲不振，腹部冷痛，熱心腸，大便稀。此時服用海飛容易引起腹瀉和元氣損傷。第二，感冒引起的咳嗽和咽喉痛表明吳漢怕冷，身體虛弱。第三種是肺陰虛引起的咳嗽，表現為幹咳無痰，咽部嘶啞，多屬於慢性呼吸道疾病(慢性)。第四，血壓正常或低血壓的人，長期服用有低血壓的危險。