其毒性不亞於砒霜，即使在高溫下也很難被破壞和溶解。但苦瓜中有生物堿，加熱後難以去除，使用後半小時至數小時內可能出現中毒癥狀。輕度中毒表現為口幹、頭暈、惡心、乏力、嗜睡，嚴重者出現嘔吐、腹部絞痛、腹瀉、脫水甚至危及生命。所以苦瓜的毒性非常大，建議平時不要吃。
如果吃了苦瓜後沒有特殊情況，而妳又吃得少，建議多喝水，幫助體內的有毒物質盡快排出。當已經超過兩刻鐘，突然出現劇烈腹痛、大量排泄、呼吸困難時，建議立即去醫院治療，同時刺激喉嚨，自己把食物吐出來。吐不出來的時候，去醫院告訴醫生妳吃了苦瓜，減少危險的可能性。
治療結束後要註意臥床休息，多喝水，補充體內水分的不足，選擇能促進毒素排出的食物。按時吃藥，不吃生冷刺激性食物，同時戒煙戒酒。如果排泄次數多、量大，可以喝溫鹽水，補充體內流失的離子。
挑選絲瓜的時候可以試試絲瓜是不是苦的，如果是，馬上扔掉。和其他食物壹起煮的時候，壹定要扔掉，不能碰運氣。因為苦瓜和正常的絲瓜在外觀上沒有區別，所以很難區分。萬壹發生意外，請及時去醫院。