先關閉進水閥和出水閥，再打開清水閥，讓清水通過反滲透膜，擦洗膜表面的汙漬和顆粒。在清洗水中加入適量的化學清洗劑，用該溶液清洗膜表面。清洗劑的種類和濃度應根據反滲透膜的材質和汙染物的種類來選擇。時間壹般是15-30分鐘，然後用清水反洗。
反滲透膜表面的汙染物被高壓水沖走。沖洗壓力壹般為1-2 MPa，時間為10-20分鐘。沖洗時，註意不要使用過強的水槍。需要註意的是，反滲透膜清洗需要在安全的環境下進行，清洗液和廢水要嚴格處理後排放。另外，反滲透膜清洗的頻率需要根據水質、水量、使用時間來確定，建議每半年到壹年清洗壹次。
反滲透膜清洗的特點
在線清洗對不同位置的膜針對性差。因為壹個膜殼通常不是膜元件，所以這些膜元件的汙染也是不壹樣的。使用相同濃度的清洗液清洗不同汙染情況的膜時，必然會出現有的膜清洗過度，有的膜清洗不足的情況，清洗效果差，容易形成交叉汙染。
雖然反滲透系統的設計會有壹定程度的富余，但要保證在緊急情況下不會因為產水量或脫鹽率的降低，反滲透系統壓差的增大而造成供水量不足，對安全生產造成威脅。但實際上，正是因為這些過剩的存在，有時隱藏的故障無法及時顯示出來，最終可能演變成反滲透膜元件的嚴重汙染。