在播種初期，如果發生真菌蟎，接種塊的菌絲體先被咬破，所以播種後菌絲體往往不發芽。後來真菌蟎蟲造成傷害，菌絲被它們咬掉，導致菇蕾萎縮死亡。可見受傷子實體的柄和蓋長滿虱子，受傷部位變色或出現孔洞。在耳木上，造成爛耳或畸形耳。
預防和控制措施如下:
(1)菌種廠應遠離倉庫和禽舍。
(2)嚴格選擇菌種，去除並銷毀有菌虱的菌種。
(3)播種後約1周，在材料表面覆蓋彩色塑料薄膜幾分鐘，然後用放大鏡觀察靠近培養材料的壹面。壹旦發現真菌蟎蟲，立即用藥物殺蟲。
(4)用敵敵畏蘸棉球放在床架的底料面上，然後蓋上床面熏蒸殺蟲。
(5)噴灑50%毒死蜱1000 ~ 2000倍，氟蟲腈1500倍，或炔蟎特2000倍。
(6)噴灑洗衣粉(25%十二烷基苯磺酸鈉)400次，連續2 ~ 3次，殺蟲效果也很好。
(7)菜籽餅誘捕法。在被蟎蟲破壞的材料表面鋪上幾片濕布，將剛炸好的菜籽餅撒在濕布上，當菌蟎聚集在菜籽餅粉上時，將濕布取下，放入沸水中浸泡壹會，即可殺死蟎蟲。
(8)糖醋藥液誘殺法。取1份醋酸、1份清水、0.1份紅糖(或白糖)，混合均勻，然後滴加1 ~ 2滴敵敵畏，配制成酸甜藥液。將浸有紗布條或棉花的藥液放在材料表面，待菌蟎在上面聚集時，將被燙傷的害蟲清除。重復以上操作，直到沒有蟎蟲為止。
(9)誘殺鮮骨法。把豬骨放在細菌蟎蟲滋生危害的床上，交替排出。當細菌蟎蟲聚集在上面時，將豬骨放入沸水中煮壹會兒以殺死蟎蟲。重復以上操作，直到沒有蟎蟲為止。