扁桃體表面有許多小凹痕，稱為“扁桃體皺壁”。有的很深，嘴巴很小。裏面非常容易堆積分泌物，食物殘渣也非常容易殘留。時間長了，這種分泌增多，沈積物中的鈣就會積累聚集，產生細小、顆粒狀、乳白色的硬物，這就是扁桃體結石。扁桃體結石還是口臭的原因之壹。
因為扁桃體結石的發生與咽炎有關，所以要特別註意防止吃太多刺激性食物，如太熱、太冷、太硬的食材等等。高度酒精對咽部有刺激，如果飲酒後咽部有明顯不適，需要盡量減少。
有的人會提出切除扁桃體，畢竟沒有扁桃體就不會有扁桃體結石。但醫生不建議盲目跟風切除扁桃體。因為扁桃體可以產生網織紅細胞和抗原，具有抗病毒藥物和細菌的防禦作用。咽部是飲食和吸氣的必經之路，碰到它往往容易藏起致病菌和臟東西。咽部五顏六色的淋巴組織和扁桃體，正是日常保衛和維護咽部的任務。所以扁桃體不需要隨便切除。
橘子性溫，行氣廣，除濕，止咳化痰。梔子消火除煩，清熱利濕，活血解毒；羅漢果具有清熱潤肺、清咽利喉、解毒消食的作用，可緩解肺胃熱盛引起的咽喉腫痛、喉癢、喉啞等癥，實際效果顯著。羅漢果味甘涼，能化痰止咳，止渴潤喉。夏枯草具有清熱解毒、止咳化痰、止痛的作用。夏枯草生吃，清熱解毒、止咳潤肺的作用更為突出。這類食物有益於咽、護喉、消腫。經常飲用，對肺火嘶啞、咽喉腫痛、熱大便秘結、用嗓過度、扁桃體炎、咽炎有效。